Illness46XY - disorders of sexual development, differential diagnosis
Summary
A curated panel containing 69 genes (42 guideline-curated genes) for the comprehensive analysis of practically all known genetic causes of 46XY disorders of sexual development; mutations in 13 genes cover the most frequent mutations.
83,6 kb (Extended panel: incl. additional genes)
- EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
NGS +
[Sanger]
Gene panel
Selected genes
Name | Exon Length (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Heredity |
---|---|---|---|---|
AMH | 1683 | NM_000479.5 | AR | |
AMHR2 | 1722 | NM_020547.3 | AR | |
AR | 2763 | NM_000044.6 | XLR | |
CYP11A1 | 1566 | NM_000781.3 | AR, AD | |
CYP17A1 | 1527 | NM_000102.4 | AR | |
DHH | 1191 | NM_021044.4 | AR | |
HSD17B3 | 933 | NM_000197.2 | AR | |
MAP3K1 | 4539 | NM_005921.2 | AD | |
NR5A1 | 1386 | NM_004959.5 | AD | |
SOX9 | 1530 | NM_000346.4 | AD | |
SRD5A2 | 764 | NM_000348.4 | AR | |
SRY | 615 | NM_003140.3 | YL | |
WT1 | 1569 | NM_024426.6 | AD | |
AKR1C2 | 420 | NM_001354.6 | AR | |
AKR1C4 | 972 | NM_001818.5 | AR | |
ANOS1 | 2043 | NM_000216.4 | XLR | |
BMP15 | 1179 | NM_005448.2 | XL | |
CBX2 | 1599 | NM_005189.3 | AR | |
CHD7 | 8994 | NM_017780.4 | AD | |
CYB5A | 297 | NM_001914.4 | AR | |
CYP11B1 | 1512 | NM_000497.4 | AR | |
CYP21A2 | 1488 | NM_000500.9 | AR | |
DHCR7 | 1428 | NM_001360.3 | AR | |
FGF8 | 735 | NM_033163.5 | AD | |
FGFR1 | 2469 | NM_023110.3 | AR | |
FSHB | 390 | NM_000510.4 | AR | |
GATA4 | 1329 | NM_002052.5 | AD | |
GNRH1 | 291 | NM_000825.3 | AR | |
GNRHR | 987 | NM_000406.3 | AR | |
HOXA13 | 1167 | NM_000522.5 | AD | |
HS6ST1 | 1236 | NM_004807.3 | AD | |
HSD3B2 | 1119 | NM_000198.4 | AR | |
KISS1 | 417 | NM_002256.4 | AR | |
LHCGR | 2100 | NM_000233.4 | AD, AR | |
MAMLD1 | 2325 | NM_005491.4 | XLR | |
NR0B1 | 1413 | NM_000475.5 | XL | |
NSMF | 1587 | NM_015537.5 | AD | |
POR | 2043 | NM_001395413.1 | AR | |
PROK2 | 390 | NM_001126128.2 | AD, AR, Oligo | |
PROKR2 | 1155 | NM_144773.4 | AD | |
RSPO1 | 792 | NM_001038633.4 | AR | |
SAMD9 | 4770 | NM_001193307.2 | AD | |
SEMA3A | 2316 | NM_006080.3 | AD | |
SGPL1 | 1721 | NM_003901.4 | AR | |
SOX3 | 1341 | NM_005634.3 | XL | |
STAR | 858 | NM_000349.3 | AR | |
TAC3 | 366 | NM_013251.4 | AR | |
TACR3 | 1398 | NM_001059.3 | AR | |
WDR11 | 3675 | NM_018117.12 | AD | |
ZFPM2 | 3456 | NM_012082.4 | AD |
Informations about the disease
illness_ClinicalComment_GP0072
- Alias: 46XY disorder of sex development; 46XY DSD; 46XY sex reversal 1; 46XY sex reversal 1
- Alias: DSD, disorders of sex determination
- Allelic: 46XX sex reversal 1 (SRY)
- Allelic: 46XX sex reversal 4 (NR5A1)
- Allelic: Acampomelic campomelic dysplasia (SOX9)
- Allelic: Adrenal hyperplasia, congenital, due to 21-hydroxylase deficiency (CYP21A2)
- Allelic: Adrenocortical insufficiency (NR5A1)
- Allelic: Aldosteronism, glucocorticoid-remediable (CYP11B1)
- Allelic: Campomelic dysplasia (SOX9)
- Allelic: Hypospadias 1, XL (AR)
- Allelic: Mesothelioma, somatic (WT1)
- Allelic: Mullerian aplasia + hyperandrogenism (WNT4)
- Allelic: Nephrotic syndrome, type 4 (WT1)
- Allelic: Premature ovarian failure 7 (NR5A1)
- Allelic: Prostate cancer, susceptibility to (AR)
- Allelic: Spermatogenic failure 8 (NR5A1)
- Allelic: Spinal + bulbar muscular atrophy of Kennedy (AR CAG)
- Allelic: Wilms tumor, type 1 (WT1)
- Intellectual disability [panelapp red] (STARD8)
- 17-alpha-hydroxylase/17,20-lyase deficiency (CYP17A1)
- 46,XY disorder of sex development [MONDO:0020040] (ESR2)
- 46XX sex reversal 5 (NR2F2)
- 46XY partial gonadal dysgenesis, with minifascicular neuropathy (DHH)
- 46XY sex reversal 1 (SRX)
- 46XY sex reversal 11 (DHX37)
- 46XY sex reversal 3 (NR5A1)
- 46XY sex reversal 6 (MAP3K1)
- 46XY sex reversal 7 (DHH)
- Adrenal hyperplasia, congenital, due to 11-beta-hydroxylase deficiency (CYP11B1)
- Adrenal hyperplasia, congenital, due to 3-beta-hydroxysteroid dehydrogenase 2 deficiency (HSD3B2)
- Adrenal insufficiency, congenital, with 46XY sex reversal, partial/complete (CYP11A1)
- Allelic: Alpha-thalassemia/mental retardation syndrome (ATRX)
- Allelic: Apert syndrome (FGFR2)
- Allelic: Beare-Stevenson cutis gyrata syndrome (FGFR2)
- Allelic: Congenital heart defects, multiple types, 4 (NR2F2)
- Allelic: Craniofacial-skeletal-dermatologic dysplasia (FGFR2)
- Allelic: Craniosynostosis, nonspecific (FGFR2)
- Allelic: Crouzon syndrome (FGFR2)
- Allelic: Developmental and epileptic encephalopathy 1 (ARX)
- Allelic: Intellectual developmental disorder, XL 29 (ARX)
- Allelic: Jackson-Weiss syndrome (FGFR2)
- Allelic: Lissencephaly, XL 2 (ARX)
- Allelic: Mullerian aplasia and hyperandrogenism (WNT4)
- Allelic: Ovarian dysgenesis 2 (BMP15)
- Allelic: Ovarian dysgenesis 6 (NUP107)
- Allelic: Ovarian dysgenesis 8 (ESR2)
- Allelic: Partington syndrome (ARX)
- Allelic: Pfeiffer syndrome (FGFR2)
- Allelic: Premature ovarian failure 3 (FOXL2)
- Allelic: Premature ovarian failure 4 (BMP15)
- Allelic: Saethre-Chotzen syndrome (FGFR2)
- Allelic: Scaphocephaly and Axenfeld-Rieger anomaly (FGFR2)
- Allelic: Scaphocephaly, maxillary retrusion + impaired intellectual development (FGFR2)
- Androgen insensitivity (AR)
- Androgen insensitivity, partial, with/-out breast cancer (AR)
- Antley-Bixler syndrome without genital anomalies or disordered steroidogenesis (FGFR2)
- Bent bone dysplasia syndrome (FGFR2)
- Blepharophimosis, epicanthus inversus, ptosis, type 1 (FOXL2)
- Blepharophimosis, epicanthus inversus, ptosis, type 2 (FOXL2)
- Campomelic dysplasia with autosomal sex reversal (SOX9)
- Denys-Drash syndrome (WT1)
- Developmental and epileptic encephalopathy 28 (WWOX)
- Frasier syndrome (WT1)
- Galloway-Mowat syndrome 7 (NUP107)
- Hydranencephaly with abnormal genitalia (ARX)
- Hyperandrogenism, nonclassic type, due to 21-hydroxylase deficiency (CYP21A2)
- IMAGE syndrome (CDKN1C)
- Intellectual disability-hypotonic facies syndrome, XL (ATRX)
- LADD syndrome 1 (FGFR2)
- Leydig cell adenoma, somatic, with precocious puberty (LHCGR)
- Leydig cell hypoplasia with hypergonadotropic hypogonadism (LHCGR)
- Leydig cell hypoplasia with pseudohermaphroditism (LHCGR)
- MIRAGE syndrome (SAMD9)
- Meacham syndrome (WT1)
- Mullerian aplasia and hyperandrogenism
- Multiple synostoses syndrome 3 (FGF9)
- Nephrotic syndrome, type 11 (NUP107)
- Nephrotic syndrome, type 14 (SGPL1)
- Neurodevelopmental disorder with brain anomalies +/- vertebral/cardiac anomalies (DHX37)
- Nivelon-Nivelon-Mabille syndrome (HHAT)
- PCWH syndrome (SOX10)
- Persistent Mullerian duct syndrome, type I (AMH)
- Persistent Mullerian duct syndrome, type II (AMHR2)
- Precocious puberty, male (LHCGR)
- Proud syndrome (ARX)
- Pseudohermaphroditism, male, with gynecomastia (HSD17B3)
- Pseudovaginal perineoscrotal hypospadias (SRD5A2)
- SERKAL syndrome (WNT4)
- Schizencephaly (EMX2)
- Smith-Lemli-Opitz syndrome (DHCR7)
- Spinocerebellar ataxia, AR 12 (WWOX)
- Waardenburg syndrome, type 2E, +/- neurologic involvement (SOX10)
- Waardenburg syndrome, type 4C (SOX10)
- AD
- AR
- Oligo
- XL
- XLR
- YL
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatics and clinical interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboratory requirement
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.