IllnessAlbinism, ocular/oculocutaneous; differential diagnosis
Summary
Comprehensive differential diagnostic panel for ocular/oculocutaeous albinism comprising 20 guideline-curated genes and altogether 30 curated genes according to the clinical signs
59,1 kb (Extended panel: incl. additional genes)
- EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
NGS +
Gene panel
Selected genes
Name | Exon Length (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Heredity |
---|---|---|---|---|
AP3B1 | 3138 | NM_001271769.2 | AR | |
AP3D1 | 3648 | NM_001261826.3 | AR | |
BLOC1S3 | 609 | NM_212550.5 | AR | |
BLOC1S6 | 519 | NM_012388.4 | AR | |
DTNBP1 | 813 | NM_001271667.2 | AR | |
GPR143 | 1215 | NM_000273.3 | XL | |
HPS1 | 2103 | NM_000195.5 | AR | |
HPS3 | 3015 | NM_032383.5 | AR | |
HPS4 | 2127 | NM_022081.6 | AR | |
HPS5 | 3048 | NM_007216.4 | AR | |
HPS6 | 2328 | NM_024747.6 | AR | |
LRMDA | 597 | NM_032024.5 | AR | |
OCA2 | 2517 | NM_000275.3 | AR | |
SLC24A5 | 1503 | NM_205850.3 | AR | |
SLC45A2 | 1593 | NM_016180.5 | AR | |
TYR | 1590 | NM_000372.5 | AR | |
TYRP1 | 1614 | NM_000550.3 | AR | |
ASIP | 399 | NM_001672.3 | Ass | |
IRF4 | 1356 | NM_002460.4 | Ass | |
LYST | 11406 | NM_000081.4 | AR | |
MC1R | 954 | NM_002386.4 | AR | |
MITF | 1260 | NM_000248.4 | AD | |
MYO5A | 5568 | NM_000259.3 | AR | |
RAB27A | 666 | NM_004580.5 | AR | |
SLC24A4 | 1869 | NM_153646.4 | AR | |
SLC38A8 | 1308 | NM_001080442.3 | AR | |
TPCN2 | 2259 | NM_139075.4 | Ass |
Informations about the disease
Oculocutaneous albinism is a group of disorders that affect the pigmentation of the skin, hair and eyes. Long-term sun exposure increases the risk of skin damage and skin cancer, including malignant melanoma. Reduced pigmentation of the iris and retina leads to decreased visual acuity, nystagmus and photophobia. The most common forms of albinism are inherited in an autosomal recessive manner. The diagnostic yield captures the genetic forms in approximately 50% of the patients. An inconspicuous genetic finding does not mean that the suspected clinical diagnosis is excluded. Even in the corresponding absence of syndromologic signs, Hermansky-Pudlak, Chediak-Higashi and Griscelli syndrome types 1 and 2 should not be disregarded in the differential diagnosis of ocular/oculocutaneous albinism.
References: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1166/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1232/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1343/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1510/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1287/
- Alias: Ocular albinism
- Alias: Ocular cutaneous albinism, OCA
- Alleilic: Skin/hair/eye pigmentation 3, blue/green eyes (TYR)
- Allelic: Amelogenesis imperfecta, type IIA5 (SLC24A4)
- Allelic: Analgesia from kappa-opioid receptor agonist, female-specific (MC1R)
- Allelic: COMMAD [Coloboma, Osteopetr., Microphth., Macroceph., Albinism, Deafness] syndrome (MITF)
- Allelic: Deafness, AD 69, unilateral or asymmetric (KITLG)
- Allelic: Foveal hypoplasia 2, +/- optic nerve misrouting +/- anterior segment dysgenesis (SLC38A8)
- Allelic: Hyperpigmentation with/-out hypopigmentation (KITLG)
- Allelic: Melanoma, cutaneous malignant, 5 (MC1R)
- Allelic: Melanoma, cutaneous malignant, susceptibility to, 8 (MITF)
- Allelic: Melanoma, cutaneous malignant, susceptibility to, 8 (TYR)
- Allelic: Nystagmus 6, congenital, XL (GPR143)
- Allelic: Skin/hair/eye pigmentation, variation in, 8 (IRF4)
- Allelic: UV-induced skin damage
- Albinism, brown oculocutaneous (OCA2)
- Albinism, oculocutaneous, type IA (TYR)
- Albinism, oculocutaneous, type IB (TYR)
- Albinism, oculocutaneous, type II (OCA2)
- Albinism, oculocutaneous, type II, modifier of (MC1R)
- Albinism, oculocutaneous, type III (TYRP1)
- Albinism, oculocutaneous, type IV (SLV45A2)
- Albinism, oculocutaneous, type VI (SLC24A5)
- Albinism, oculocutaneous, type VII (LRMDA)
- Albinism, oculocutaneous, type VIII (DCT)
- Blaschko-linear hypopigmentation (KITLG)
- Chediak-Higashi syndrome (LYST)
- Griscelli syndrome, type 1 + 2 (MYO5A + RAB27A)
- Hermansky-Pudlak syndrome 1-6 (HPS1, AP3B1, HPS3, HPS4, HPS5, HPS6)
- Hermansky-Pudlak syndrome 7-11 (DTNBP1, BLOC1S3, BLOC1S6, AP3D1, BLOC1S5)
- Ocular albinism, type I, Nettleship-Falls type (GPR143)
- Oculocutaneous albinism, type VIII (DCT)
- Progressive hyper-+ hypopigmentation (KITLG)
- Skin/hair/eye pigment., blond/fair skin; Skin/hair/eye pigment., red hair/fair skin (MC1R)
- Skin/hair/eye pigmentation 1, blond/brown hair (OCA2)
- Skin/hair/eye pigmentation 1, blue/nonblue eyes (OCA2)
- Skin/hair/eye pigmentation 10, blond/brown hair (TPCN2)
- Skin/hair/eye pigmentation 10, blond/brown hair (TPCN2)
- Skin/hair/eye pigmentation 2, blond hair/fair skin (MC1R)
- Skin/hair/eye pigmentation 2, red hair/fair skin (MC1R)
- Skin/hair/eye pigmentation 3, light/dark/freckling skin (TYR)
- Skin/hair/eye pigmentation 4, fair/dark skin (SLC24A5)
- Skin/hair/eye pigmentation 5, black/nonblack hair (SLC45A2)
- Skin/hair/eye pigmentation 5, dark/fair skin (SLC45A2)
- Skin/hair/eye pigmentation 5, dark/light eyes (SLC45A2)
- Skin/hair/eye pigmentation 6, blond/brown hair (SLC24A4)
- Skin/hair/eye pigmentation 6, blue/green eyes (SLC24A4)
- Skin/hair/eye pigmentation 7, blond/brown hair (KITLG)
- Skin/hair/eye pigmentation 9, brown/nonbrown eyes (ASIP)
- Skin/hair/eye pigmentation 9, dark/light hair (ASIP)
- Skin/hair/eye pigmentation, blond/brown hair, blue/green eyes (SLC24A4)
- Skin/hair/eye pigmentation, variation in, 11 [Melanesian blond hair] (TYRP1)
- Skin/hair/eye pigmentation, variation in, 8 (IRF4)
- Tietz albinism-deafness syndrome (MITF)
- Vici syndrome (MYO5A)
- Waardenburg syndrome, type 2A (MITF)
- Waardenburg syndrome/albinism, digenic (TYR)
- Waardenburg syndrome/ocular albinism digenic (MITF)
- AD
- AR
- Ass
- XL
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatics and clinical interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboratory requirement
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.