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IllnessAngelman syndrome, differential diagnosis

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for Angelman syndrome comprising 1 guideline-curated "core" gene, 9 additional core candidate genes and altogether 20 curated genes according to the clinical signs

ID
AP0650
Number of genes
15 Accredited laboratory test
Examined sequence length
23,4 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
58,3 kb (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Test material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications
  • Step-by-step diagnosis, 1. PWS/AS MLPA-UPD, then if necessary UBE3A gene analyses...
  • 70% maternal deletion of chromosomes 15q11.2-q13

NGS +

[Sanger]

 

Gene panel

Selected genes

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
CDKL53093NM_003159.3XL
EHMT13897NM_024757.5AD
FOXG11470NM_005249.5AD
MECP21461NM_004992.4XL
MEF2C1422NM_002397.5AD
SLC9A62010NM_006359.3XL
STXBP11812NM_003165.6AD, AR
TCF42016NM_001083962.2AD
UBE3A2559NM_130838.4AD
ZEB23645NM_014795.4AD
ATRX7479NM_000489.6XL
CNTNAP23996NM_014141.6AR
KMT2C14736NM_170606.3AD
NRXN14644NM_001135659.3AR, AD
SYNGAP14032NM_006772.3AD

Informations about the disease

Clinical Comment

Angelman syndrome (AS; "happy puppet") is an inconsistent genetic disorder with delayed development (after 6-12 months), intellectual disability, severe speech impairment, often ataxia, epilepsy, and microcephaly. Affected children are often hyperactive, smile and have sleep difficulties. Adult patients exhibit intellectual deficits with speech disorders, seizures, and coarsened facial features. Deficient expression or function of the maternally inherited UBE3A allele causes AS in 80% of cases by deletion, uniparental disomy (UPD) or an imprinting defect. Very rarely, patients have cytogenetic aberrations. Mutations in the UBE3A gene are present in at least 10% of individuals. In the remaining 10% of individuals with AS, the genetic mechanisms are unknown. Mutations in more than a dozen other genes can cause similar disease symptoms and must be considered in the differential diagnosis. In more than 70% of families, the familial recurrence risk is low because of a regional deletion on chromosome 15 but may reach 50% in >10% of cases with maternal UBE3A mutations. Negative cytogenetic and DNA results do not exclude a clinical diagnosis of AS.

(Core/basic diagnostic genes: ###; additional genes: ###).

Reference: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1144/

 

Synonyms
  • Alias: Happy puppet syndrome (UBE3A)
  • Allelic: Alpha-thalassemia myelodysplasia syndrome, somatic /ATRX)
  • Allelic: Alpha-thalassemia/mental retardation syndrome (ATRX)
  • Allelic: Autism susceptibility, XL 3 (MECP2)
  • Allelic: Chromosome 5q14.3 deletion syndrome (MEF2C)
  • Allelic: Corneal dystrophy, Fuchs endothelial, 3 (TCF4)
  • Allelic: Cortical dysplasia-focal epilepsy syndrome (CNTNAP2)
  • Allelic: Encephalopathy, neonatal severe (MECP2)
  • Allelic: Neural tube defects, susceptibility to (MTHFR)
  • Allelic: Schizophrenia, susceptibility to (MTHFR)
  • Allelic: Skin/hair/eye pigmentation 1, blond/brown hair (HERC2)
  • Allelic: Skin/hair/eye pigmentation 1, blue/nonblue eyes (HERC2)
  • Allelic: Thromboembolism, susceptibility to (MTHFR)
  • Allelic: Vascular disease, susceptibility to (MTHFR)
  • Adenylosuccinase deficiency (ADSL)
  • Angelman syndrome (UBE3A)
  • Angelman/Pitt Hopkins syndrome-like disorder (STXBP1)
  • Desanto-Shinawi syndr.: developm. delay, abnormal behavior, facial dysmorph., ocular abnormal. (WAC)
  • Epileptic encephalopathy, early infantile, 2 (CDKL5)
  • Epileptic encephalopathy, early infantile, 4 (STXBP1)
  • Homocystinuria due to MTHFR deficiency (MTHFR)
  • Kleefstra syndrome 1 (EHMT1)
  • Kleefstra syndrome 2 (KMT2C)
  • Mental retardation, AD 1 (MBD5)
  • Mental retardation, AD 5 (SYNGAP1)
  • Mental retardation, AR 38 (HERC2)
  • Mental retardation, XL syndromic, Christianson type (SLC9A6)
  • Mental retardation, XL syndromic, Lubs type (MECP2)
  • Mental retardation, XL, syndromic 13 (MECP2)
  • Mental retardation, stereotypic movements, epilepsy, and/or cerebral malformations (MEF2C)
  • Mental retardation-hypotonic facies syndrome, XL (ATRX)
  • Mowat-Wilson syndrome (ZEB2)
  • Pitt-Hopkins like syndrome 1 (CNTNAP2)
  • Pitt-Hopkins syndrome (TCF4)
  • Pitt-Hopkins-like syndrome 2 (NRXN1)
  • Rett syndrome (MECP2)
  • Rett syndrome, atypical (MECP2)
  • Rett syndrome, congenital variant (FOXG1)
  • Rett syndrome, preserved speech variant (MECP2)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
  • XL
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.