IllnessBrugada-Syndrom [erweitertes panel], Differentialdiagnose
Summary
Comprehensive differential diagnostic panel for Brugada syndrome comprising 1 guideline-curated core gene and altogether 42 curated genes according to the clinical signs
179,7 kb (Extended panel: incl. additional genes)
- EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
NGS +
Gene panel
Selected genes
Name | Exon Length (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Heredity |
---|---|---|---|---|
SCN5A | 6051 | NM_198056.3 | AD | |
ABCC9 | 4650 | NM_005691.4 | Ass | |
CACNA1C | 6417 | NM_000719.7 | Ass | |
CACNA2D1 | 3276 | NM_000722.4 | Ass | |
CACNB2 | 1821 | NM_201590.3 | Ass | |
CASQ2 | 1200 | NM_001232.4 | Ass | |
DSG1 | 3150 | NM_001942.4 | Ass | |
DSP | 8616 | NM_004415.4 | Ass | |
GPD1L | 1056 | NM_015141.4 | Ass | |
HCN4 | 3612 | NM_005477.3 | Ass | |
KCND3 | 1968 | NM_004980.5 | Ass | |
KCNE3 | 312 | NM_005472.5 | Ass | |
KCNE5 | 429 | NM_012282.4 | Ass | |
KCNH2 | 3480 | NM_000238.4 | Ass | |
KCNJ8 | 1275 | NM_004982.4 | Ass | |
PKP2 | 2646 | NM_004572.4 | Ass | |
RANGRF | 561 | NM_016492.5 | Ass | |
RYR2 | 14904 | NM_001035.3 | Ass | |
SCN10A | 5871 | NM_006514.4 | Ass | |
SCN1B | 657 | NM_001037.5 | Ass | |
SCN2B | 648 | NM_004588.5 | Ass | |
SCN3B | 648 | NM_018400.4 | Ass | |
SLMAP | 2436 | NM_007159.5 | Ass | |
TRPM4 | 3645 | NM_017636.4 | Ass | |
TTN | 100272 | NM_001267550.2 | Ass |
Informations about the disease
Brugada syndrome (BS) causes ventricular arrhythmias. If left untreated, the irregular rhythms can cause syncope, seizures, respiratory distress or sudden death. These complications usually occur when the affected person is resting or sleeping. Often BS becomes apparent in adulthood, but can also occur at any time during life. Sudden cardiac death usually occurs around the age of 40. Some cases of sudden infant death can also be explained by BS. Another acute unexplained death syndrome is due to unexpected cardiac arrest in young adults, usually at night during sleep. It has long been assumed that BS can be caused by mutations in several genes. Of >20 initially clinically curated genes, an expert biocurator commission classified only the SCN5A gene as definitely causing BS. Yet the SCN5A gene is only altered in some 30% of BS patients. Mutations in all other genes, that cause BS according to the extended clinical definition, explain about 2% of cases. BS is inherited in an autosomal dominant manner. Certain drugs can cause a rare acquired BS-like disorder. Since no causative mutation is detectable in 2/3 of BS cases, a negative DNA test result does not exclude the clinical diagnosis.
References: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1517/
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29959160/
- Alias: BGS 1 (SCN5A)
- Alias: BGS; BRGDS; Dream disease
- Alias: Bangungut
- Alias: Idiopathic ventricular fibrillation, Brugada type
- Alias: Pokkuri death syndrome
- Alias: Right bundle branch block, ST segment elevation, Sudden death syndrome
- Alias: Sudden unexpected nocturnal death syndrome
- Alias: Sudden unexplained death syndrome
- Alias: Sudden unexplained nocturnal death syndrome, SUNDS
- Allelic: Arrhythmogenic right ventricular dysplasia 8 (DSP)
- Allelic: Arrhythmogenic right ventricular dysplasia 9 (PKP2)
- Allelic: Atrial fibrillation, familial, 10 (SCN5A)
- Allelic: Atrial fibrillation, familial, 12 (ABCC9)
- Allelic: Atrial fibrillation, familial, 13 (SCN1B)
- Allelic: Atrial fibrillation, familial, 14 (SCN2B)
- Allelic: Atrial fibrillation, familial, 16 (SCN3B)
- Allelic: Atrial fibrillation, familial, 4 (KCNE2)
- Allelic: Bronchiectasis +/- elevated sweat chloride 2 (SCNN1A)
- Allelic: Cardiac conduction defect, nonspecific (SCN1B)
- Allelic: Cardiomyopathy, dilated, 1 (TTN)
- Allelic: Cardiomyopathy, dilated, 1E (SCN5A)
- Allelic: Cardiomyopathy, dilated, 1O (ABCC9)
- Allelic: Cardiomyopathy, dilated, 1P (PLN) 3
- Allelic: Cardiomyopathy, dilated, with woolly hair + keratoderma (DSP)
- Allelic: Cardiomyopathy, familial hypertrophic, 9 (TTN)
- Allelic: Cardiomyopathy, hypertrophic, 18 (PLN)
- Allelic: Congenital myopathy 5 + cardiomyopathy (TTN)
- Allelic: Developmental and epileptic encephalopathy 110 (CACNA2D1)
- Allelic: Developmental and epileptic encephalopathy 47 (FGF12)
- Allelic: Dilated cardiomyopathy with woolly hair, keratoderma, tooth agenesis (DSP)
- Allelic: Epidermolysis bullosa, lethal acantholytic (DSP)
- Allelic: Epilepsy, gen., febrile seizures plus, 1 (SCN1B)
- Allelic: Epilepsy, idiopathic generalized, susceptibility to, 18 (HNC4)
- Allelic: Epileptic encephalopathy, early infant., 52 (SCN1B)
- Allelic: Episodic pain syndrome, familial, 2 (SCN10A)
- Allelic: Erythroderma, congenital, + palmoplantar keratoderma, hypotrichosis, hyper IgE (DSG1)
- Allelic: Erythrokeratodermia veriabilis et progressiva 6 (TRPM4)
- Allelic: Heart block, nonprogressive (SCN5A)
- Allelic: Heart block, progressive, type IA (SCN5A)
- Allelic: Holt-Oram syndrome (TBX5)
- Allelic: Hyperkalemic periodic paralysis, type 2 (SCN4A)
- Allelic: Hypertrichotic osteochondrodysplasia (ABCC9)
- Allelic: Hypogonadotropic hypogonadism 16 +/- anosmia (SEMA3A)
- Allelic: Hypokalemic periodic paralysis, type 2 (SCN4A)
- Allelic: Hypokalemic tubulopathy and deafness (KCNJ16)
- Allelic: Keratosis palmoplantaris striata I, AD (DSG1)
- Allelic: Keratosis palmoplantaris striata II (DSP)
- Allelic: LQTS2; SQTS1 (KCNH2)
- Allelic: Liddle syndrome 3 (SCNN1A)
- Allelic: Long QT syndrome (CACNA1C)
- Allelic: Long QT syndrome 2 (KCNH2)
- Allelic: Long QT syndrome 3 (SCN5A)
- Allelic: Long QT syndrome 4 (ANK2)
- Allelic: Long QT syndrome 6 (KCNE2)
- Allelic: Muscular dystrophy, limb-girdle, AR 10 (TTN)
- Allelic: Myasthenic syndrome, congenital, 16 (SCN4A)
- Allelic: Myopathy, myofibrillar, 9, + early respiratory failure (TTN)
- Allelic: Myotonia congenita, atypical, acetazolamide-responsive (SCN4A)
- Allelic: Paramyotonia congenita (SCN4A)
- Allelic: Progressive familial heart block, type IB (TRPM4)
- Allelic: Pseudohypoaldosteronism, type IB1, AR (SCNN1A)
- Allelic: Short QT syndrome 1 (KCNH2)
- Allelic: Short stature, developmental delay, and congenital heart defects (TKT)
- Allelic: Sick sinus syndrome 1 (SCN5A)
- Allelic: Sick sinus syndrome 2 (HNC4)
- Allelic: Skin fragility-woolly hair syndrome (DSP)
- Allelic: Spinocerebellar ataxia 19 (KCND3)
- Allelic: Sudden infant death syndrome, susceptibility to (SCN5A)
- Allelic: Tibial muscular dystrophy, tardive (TTN)
- Allelic: Timothy syndrome (CACNA1C)
- Allelic: Ventricular arrhythmias due to cardiac ryanodine receptor calcium release def. s. (RYR2)
- Allelic: Ventricular fibrillation, familial, 1 (SCN5A)
- Allelic: Ventricular tachycardia, catecholaminergic polymorphic, 1 (RYR2)
- Allelic: Ventricular tachycardia, catecholaminergic polymorphic, 2 (CASQ2)
- Brugada syndrome (KCNE5)
- Brugada syndrome 1 (SCN5A)
- Brugada syndrome 2 (GPD1L)
- Brugada syndrome 3 (CACNA1C)
- Brugada syndrome 4 (CACNB2)
- Brugada syndrome 5 (SCN1B)
- Brugada syndrome 6 (KCNE3)
- Brugada syndrome 7 (SCN3B)
- Brugada syndrome 8 (HNC4)
- Brugada syndrome 9 (KCND3)
- Brugada syndrome ass. (ANK2, CACNA2D1, CASQ2, DSG1, DSP, FGF12, HEY2, KCNAB2, KCNB2, KCND2, KCNE2)
- Brugada syndrome ass. (KCNE5, KCNH2, KCNJ16, KCNJ8, LRRC10, PLN, PKP2, RANGRF, RYR2, SCN10A, SCN2B)
- Brugada syndrome ass. (SCN4A, SCNN10A, SLMAP, TBX5, TKT, TRPM4, TTN, XIRP1, XIRP2)
- Cardiac arrhythmia, ankyrin-B-related (ANK2)
- AD
- Ass
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatics and clinical interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboratory requirement
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.