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Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
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IllnessBrugada-Syndrom [erweitertes panel], Differentialdiagnose

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for Brugada syndrome comprising 1 guideline-curated core gene and altogether 42 curated genes according to the clinical signs

ID
BP0150
Number of genes
25 Accredited laboratory test
Examined sequence length
6,1 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
179,7 kb (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Test material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

 

Gene panel

Selected genes

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
SCN5A6051NM_198056.3AD
ABCC94650NM_005691.4Ass
CACNA1C6417NM_000719.7Ass
CACNA2D13276NM_000722.4Ass
CACNB21821NM_201590.3Ass
CASQ21200NM_001232.4Ass
DSG13150NM_001942.4Ass
DSP8616NM_004415.4Ass
GPD1L1056NM_015141.4Ass
HCN43612NM_005477.3Ass
KCND31968NM_004980.5Ass
KCNE3312NM_005472.5Ass
KCNE5429NM_012282.4Ass
KCNH23480NM_000238.4Ass
KCNJ81275NM_004982.4Ass
PKP22646NM_004572.4Ass
RANGRF561NM_016492.5Ass
RYR214904NM_001035.3Ass
SCN10A5871NM_006514.4Ass
SCN1B657NM_001037.5Ass
SCN2B648NM_004588.5Ass
SCN3B648NM_018400.4Ass
SLMAP2436NM_007159.5Ass
TRPM43645NM_017636.4Ass
TTN100272NM_001267550.2Ass

Informations about the disease

Clinical Comment

Brugada syndrome (BS) causes ventricular arrhythmias. If left untreated, the irregular rhythms can cause syncope, seizures, respiratory distress or sudden death. These complications usually occur when the affected person is resting or sleeping. Often BS becomes apparent in adulthood, but can also occur at any time during life. Sudden cardiac death usually occurs around the age of 40. Some cases of sudden infant death can also be explained by BS. Another acute unexplained death syndrome is due to unexpected cardiac arrest in young adults, usually at night during sleep. It has long been assumed that BS can be caused by mutations in several genes. Of >20 initially clinically curated genes, an expert biocurator commission classified only the SCN5A gene as definitely causing BS. Yet the SCN5A gene is only altered in some 30% of BS patients. Mutations in all other genes, that cause BS according to the extended clinical definition, explain about 2% of cases. BS is inherited in an autosomal dominant manner. Certain drugs can cause a rare acquired BS-like disorder. Since no causative mutation is detectable in 2/3 of BS cases, a negative DNA test result does not exclude the clinical diagnosis.

References: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1517/

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29959160/

 

Synonyms
  • Alias: BGS 1 (SCN5A)
  • Alias: BGS; BRGDS; Dream disease
  • Alias: Bangungut
  • Alias: Idiopathic ventricular fibrillation, Brugada type
  • Alias: Pokkuri death syndrome
  • Alias: Right bundle branch block, ST segment elevation, Sudden death syndrome
  • Alias: Sudden unexpected nocturnal death syndrome
  • Alias: Sudden unexplained death syndrome
  • Alias: Sudden unexplained nocturnal death syndrome, SUNDS
  • Allelic: Arrhythmogenic right ventricular dysplasia 8 (DSP)
  • Allelic: Arrhythmogenic right ventricular dysplasia 9 (PKP2)
  • Allelic: Atrial fibrillation, familial, 10 (SCN5A)
  • Allelic: Atrial fibrillation, familial, 12 (ABCC9)
  • Allelic: Atrial fibrillation, familial, 13 (SCN1B)
  • Allelic: Atrial fibrillation, familial, 14 (SCN2B)
  • Allelic: Atrial fibrillation, familial, 16 (SCN3B)
  • Allelic: Atrial fibrillation, familial, 4 (KCNE2)
  • Allelic: Bronchiectasis +/- elevated sweat chloride 2 (SCNN1A)
  • Allelic: Cardiac conduction defect, nonspecific (SCN1B)
  • Allelic: Cardiomyopathy, dilated, 1 (TTN)
  • Allelic: Cardiomyopathy, dilated, 1E (SCN5A)
  • Allelic: Cardiomyopathy, dilated, 1O (ABCC9)
  • Allelic: Cardiomyopathy, dilated, 1P (PLN) 3
  • Allelic: Cardiomyopathy, dilated, with woolly hair + keratoderma (DSP)
  • Allelic: Cardiomyopathy, familial hypertrophic, 9 (TTN)
  • Allelic: Cardiomyopathy, hypertrophic, 18 (PLN)
  • Allelic: Congenital myopathy 5 + cardiomyopathy (TTN)
  • Allelic: Developmental and epileptic encephalopathy 110 (CACNA2D1)
  • Allelic: Developmental and epileptic encephalopathy 47 (FGF12)
  • Allelic: Dilated cardiomyopathy with woolly hair, keratoderma, tooth agenesis (DSP)
  • Allelic: Epidermolysis bullosa, lethal acantholytic (DSP)
  • Allelic: Epilepsy, gen., febrile seizures plus, 1 (SCN1B)
  • Allelic: Epilepsy, idiopathic generalized, susceptibility to, 18 (HNC4)
  • Allelic: Epileptic encephalopathy, early infant., 52 (SCN1B)
  • Allelic: Episodic pain syndrome, familial, 2 (SCN10A)
  • Allelic: Erythroderma, congenital, + palmoplantar keratoderma, hypotrichosis, hyper IgE (DSG1)
  • Allelic: Erythrokeratodermia veriabilis et progressiva 6 (TRPM4)
  • Allelic: Heart block, nonprogressive (SCN5A)
  • Allelic: Heart block, progressive, type IA (SCN5A)
  • Allelic: Holt-Oram syndrome (TBX5)
  • Allelic: Hyperkalemic periodic paralysis, type 2 (SCN4A)
  • Allelic: Hypertrichotic osteochondrodysplasia (ABCC9)
  • Allelic: Hypogonadotropic hypogonadism 16 +/- anosmia (SEMA3A)
  • Allelic: Hypokalemic periodic paralysis, type 2 (SCN4A)
  • Allelic: Hypokalemic tubulopathy and deafness (KCNJ16)
  • Allelic: Keratosis palmoplantaris striata I, AD (DSG1)
  • Allelic: Keratosis palmoplantaris striata II (DSP)
  • Allelic: LQTS2; SQTS1 (KCNH2)
  • Allelic: Liddle syndrome 3 (SCNN1A)
  • Allelic: Long QT syndrome (CACNA1C)
  • Allelic: Long QT syndrome 2 (KCNH2)
  • Allelic: Long QT syndrome 3 (SCN5A)
  • Allelic: Long QT syndrome 4 (ANK2)
  • Allelic: Long QT syndrome 6 (KCNE2)
  • Allelic: Muscular dystrophy, limb-girdle, AR 10 (TTN)
  • Allelic: Myasthenic syndrome, congenital, 16 (SCN4A)
  • Allelic: Myopathy, myofibrillar, 9, + early respiratory failure (TTN)
  • Allelic: Myotonia congenita, atypical, acetazolamide-responsive (SCN4A)
  • Allelic: Paramyotonia congenita (SCN4A)
  • Allelic: Progressive familial heart block, type IB (TRPM4)
  • Allelic: Pseudohypoaldosteronism, type IB1, AR (SCNN1A)
  • Allelic: Short QT syndrome 1 (KCNH2)
  • Allelic: Short stature, developmental delay, and congenital heart defects (TKT)
  • Allelic: Sick sinus syndrome 1 (SCN5A)
  • Allelic: Sick sinus syndrome 2 (HNC4)
  • Allelic: Skin fragility-woolly hair syndrome (DSP)
  • Allelic: Spinocerebellar ataxia 19 (KCND3)
  • Allelic: Sudden infant death syndrome, susceptibility to (SCN5A)
  • Allelic: Tibial muscular dystrophy, tardive (TTN)
  • Allelic: Timothy syndrome (CACNA1C)
  • Allelic: Ventricular arrhythmias due to cardiac ryanodine receptor calcium release def. s. (RYR2)
  • Allelic: Ventricular fibrillation, familial, 1 (SCN5A)
  • Allelic: Ventricular tachycardia, catecholaminergic polymorphic, 1 (RYR2)
  • Allelic: Ventricular tachycardia, catecholaminergic polymorphic, 2 (CASQ2)
  • Brugada syndrome (KCNE5)
  • Brugada syndrome 1 (SCN5A)
  • Brugada syndrome 2 (GPD1L)
  • Brugada syndrome 3 (CACNA1C)
  • Brugada syndrome 4 (CACNB2)
  • Brugada syndrome 5 (SCN1B)
  • Brugada syndrome 6 (KCNE3)
  • Brugada syndrome 7 (SCN3B)
  • Brugada syndrome 8 (HNC4)
  • Brugada syndrome 9 (KCND3)
  • Brugada syndrome ass. (ANK2, CACNA2D1, CASQ2, DSG1, DSP, FGF12, HEY2, KCNAB2, KCNB2, KCND2, KCNE2)
  • Brugada syndrome ass. (KCNE5, KCNH2, KCNJ16, KCNJ8, LRRC10, PLN, PKP2, RANGRF, RYR2, SCN10A, SCN2B)
  • Brugada syndrome ass. (SCN4A, SCNN10A, SLMAP, TBX5, TKT, TRPM4, TTN, XIRP1, XIRP2)
  • Cardiac arrhythmia, ankyrin-B-related (ANK2)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • Ass
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.