IllnessCADASIL, differential diagnosis

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for CADASIL comprising 6 guideline-curated and altogether 13 curated genes according to the clinical signs

CP6442

Number of loci

Loci type	Count
Gen	12

Accredited laboratory test

Examined sequence length

22,3 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
40,6 kb (Extended panel: incl. additional genes)

Analysis Duration

on request

Test material

EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)

Diagnostic indications

NGS +

[Sanger]

Loci panel

Gen

Name	Exon Length (bp)	OMIM-G	Referenz-Seq.	Heredity
COL4A1	5010	120130	NM_001845.6	AD, Mult
COL4A2	5139	120090	NM_001846.4	n.k.
CTSA	1497	613111	NM_000308.4	AR
GLA	1290	300644	NM_000169.3	XL
HTRA1	1443	602194	NM_002775.5	AD, AR
NOTCH3	6966	600276	NM_000435.3	AD
TREX1	945	606609	NM_033629.6	AD
APP	2313	104760	NM_000484.4	AD
ATP1A2	3063	182340	NM_000702.4	AD
CACNA1A	6786	601011	NM_001127221.2	AD
COL3A1	4401	120180	NM_000090.4	AR, AD
FOXC1	1662	601090	NM_001453.3	AD

Informations about the disease

Clinical Comment

Group of disorders

DD: MT-TL1, MT-ND5; MT-TC, MT-TK, MT-TV, MT-TF, MT-TQ, MT-TS1, MT-TS2, MT-TW, MT-CO1, MT-CO2, MT-CO3, MT-CYB, MT-ND1, MT-ND3, MT-ND6

Synonyms

DD: CARASAL, cathepsin A–related arteriopathy, strokes, leukoencephalopathy
Alias: Familial cerebral small vessel disease
Allelic: Aicardi-Goutieres syndrome 1, AD + AR (TREX1)
Allelic: Alzheimer disease 1, familial (APP)
Allelic: Anterior segment dysgenesis 3, multiple subtypes (FOXC1)
Allelic: Arterial calcification, generalized, of infancy, 2 (ABCC6)
Allelic: Axenfeld-Rieger syndrome, type 3 (FOXC1)
Allelic: Chilblain lupus (TREX1)
Allelic: Developemental + epileptic encephalopathy 42 (CACNA1A)
Allelic: Ehlers-Danlos syndrome, vascular type (COL3A1)
Allelic: Episodic ataxia, type 2 (CACNA1A)
Allelic: Fabry disease, cardiac variant (GLA)
Allelic: Lateral meningocele syndrome (NOTCH3)
Allelic: Macular degeneration, age-related, neovascular type; Macular degen., age-rel., 7 (HTRA1)
Allelic: Myofibromatosis, infantile 2 (NOTCH3)
Allelic: Retinal arteries, tortuosity of (COL4A1)
Allelic: Spinocerebellar ataxia 6 (CACNA1A)
Allelic: Systemic lupus erythematosus, susceptibility to (TREX1)
Alternating hemiplegia of childhood 1 (ATP1A2)
Angiopathy, hereditary, with nephropathy, aneurysms + muscle cramps (COL4A1)
Brain small vessel disease 2 (COL4A2)
Brain small vessel disease 3 (COLGALT1)
Brain small vessel disease with/-out ocular anomalies (COL4A1)
CARASIL syndrome (HTRA)
Cerebral amyloid angiopathy, Dutch, Italian, Iowa, Flemish, Arctic variants (APP)
Cerebral arteriopathy with subcortical infarcts + leukoencephalopathy 1 (NOTCH3)
Cerebral arteriopathy, AD, with subcortical infarcts + leukoencephalopathy, type 2 (HTRA1)
Fabry disease (GLA)
Galactosialidosis (CTSA)
Hemorrhage, intracerebral, susceptibility to (COL4A1, COL4A2)
Microangiopathy + leukoencephalopathy, pontine, AD (COL4A1)
Migraine, familial basilar (ATP1A2)
Migraine, familial hemiplegic, 1 (CACNA1A)
Migraine, familial hemiplegic, 1, with progressive cerebellar ataxia (CACNA1A)
Migraine, familial hemiplegic, 2 (ATP1A2)
Polymicrogyria with/-out vascular-type EDS (COL3A1)
Pseudoxanthoma elasticum (ABCC6)
Pseudoxanthoma elasticum, forme fruste (ABCC6)
Vasculopathy, retinal, with cerebral leukoencephalopathy + systemic manifestations (TREX1)

Heredity, heredity patterns etc.

AD
AR
Mult
XL
n.k.

OMIM-Ps

Multiple OMIM-Ps

ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

DAkkS-akkreditiertes Labor
EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
Gen-Konversionen
komplexe Inversionen
Balancierte Translokationen
Mitochondriale Varianten
Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
niedriger Mosaik-Status
Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
Varianten innerhalb von Pseudogenen
die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.