IllnessCoffin-Lowry syndrome, differential diagnosis
Summary
Comprehensive differential diagnostic panel for Coffin-Lowry syndrome comprising 6 curated genes according to the clinical signs
21,6 kb (Extended panel: incl. additional genes)
- EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
NGS +
Gene panel
Informations about the disease
The symptoms of Coffin-Lowry syndrome are usually more severe in males than in females, although features range from very mild to severe in affected females. Males with Coffin-Lowry syndrome typically have severe intellectual disability and delayed development. Affected women may be cognitively normal, or they may have mild to severe intellectual disability. Beginning in childhood or adolescence, some of these patients experience brief episodes of seizures when they are excited or startled by a loud noise, called stimulus-induced falling episodes. Most affected males and some affected females have distinctive facial features of prominent forehead with hypertelorism and downward-outward sloping palpebral fissures, a short nose with a broad tip, and a wide mouth with full lips. These features become more pronounced with age. Short, pointed fingers are also characteristic. Other features include short stature, microcephaly, kyphoscoliosis and other skeletal abnormalities. The mode of inheritance is X-linked dominant, with 75% of cases occurring de novo. The diagnostic yield via molecular genetics is not known. Therefore, a negative molecular genetic result does not exclude the clinical diagnosis.
Reference: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1346/
- Sy: ID [male>female]; neuropsych. s. [stimulus-induced drop attacks, spastic., paraplegia, stroke]
- Allelic: Nonsyndromic XL mental retardation-19 (RPS6KA3)
- Alpha-thalassemia/mental retardation syndrome (ATRX)
- Aneurysm, intracranial berry, 1 (meta-analytically confirmed risk locus ELN)
- Borjeson-Forssman-Lehmann syndrome (PHF6)
- Coffin-Lowry syndrome (RPS6KA3)
- Corneal dystrophy, Fuchs endothelial, 3 (TCF4)
- Cutis laxa, AD [Cutis laxa, ELN-related] (ELN)
- Lujan-Fryns syndrome (MED12)
- Mental retardation, XL (RPS6KA3)
- Mental retardation-hypotonic facies syndrome, XL (ATRX)
- Ohdo syndrome, XL (MED12)
- Opitz-Kaveggia syndrome [FG syndrome type 1] (MED12)
- Pitt-Hopkins syndrome (TCF4)
- Supravalvar aortic stenosis (ELN)
- AD
- XL
- XLR
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatics and clinical interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboratory requirement
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.