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Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
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IllnessEhlers-Danlos syndrome, vascular type

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Summary

Short information

Curated single gene sequence analysis according to the clinical suspicion Ehlers-Danlos syndrome, vascular type

ID
EP0501
Number of genes
1 Accredited laboratory test
Examined sequence length
4,5 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
- (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Test material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

 

Gene panel

Selected genes

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
COL3A14401NM_000090.4AD, AR

Informations about the disease

Clinical Comment

The different types of Ehlers-Danlos syndrome form a heterogeneous group of diseases characterised by fragility of the soft connective tissue and manifest themselves in the skin, ligaments, joints, blood vessels and/or internal organs. The clinical spectrum is very diverse and ranges from mild skin and joint hypermobility to severe physical disability and life-threatening vascular complications. An overlap with osteogenesis imperfecta is observed. Diseases in this group include classic Ehlers-Danlos syndrome (EDS), musculo-contractival EDS, hypermobile EDS, vascular EDS, arthrochalasia EDS, dermatosparax EDS, periodontal EDS, X-linked EDS, brittle corneal syndrome, classic type 1 and type 2 EDS, cardiac valve EDS, spondylodysplastic EDS, myopathic EDS and kyphoscoliotic EDS.

Reference: https://www.orpha.net/consor/cgi-bin/Disease_Search.php?lng=DE&data_id=13266&Disease_Disease_Search_diseaseGroup=ehlers-danlos&Disease_Disease_Search_diseaseType=Pat&Krankheite(n)/Disease Group=Ehlers-Danlos Syndrome&title=Ehlers-Danlos Syndrome&search=Disease_Search_Simple

 

Synonyms
  • Alias: Ehlers-Danlos syndrome type IV
  • Alias: Ehlers-Danlos syndrome, vascularType, type III
  • Allelic: Polymicrogyria with or without vascular-type EDS
  • Ehlers-Danlos classic/vascular type (COL3A1)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.