©istock.com/Andrea Obzerova
Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
Know how in the analysis of genetic material.
For the benefit of patients.

IllnessEhlers-Danlos syndromes, differential diagnosis

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for Ehlers-Danlos syndrome cobntaining 5 guideline-curated core genes, 14 additional guideline-curated genes and altogether 55 curated genes according to the clinical signs

ID
EP0500
Number of genes
46 Accredited laboratory test
Examined sequence length
35,7 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
155,3 kb (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Test material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

[Sanger]

 

Gene panel

Selected genes

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
COL1A14395NM_000088.4AD
COL1A24101NM_000089.4AD, AR
COL3A14401NM_000090.4AD, AR
COL5A15517NM_000093.5AD
COL5A24500NM_000393.5AD
TNXB12729NM_019105.8AR
ADAMTS23636NM_014244.5AR
AEBP13477NM_001129.5AR
ALDH18A12388NM_002860.4AD, AR
ATP6V0A22571NM_012463.4AR
ATP7A4503NM_000052.7XLR
B3GALT6990NM_080605.4AR
B4GALT7984NM_007255.3AR
BGN1107NM_001711.6XL
C1R1884NM_001733.7AD
C1S2067NM_201442.4AD
CBS1656NM_000071.3AR
CHST141131NM_130468.4AR
COL12A19192NM_004370.6AD, AR
COL6A13087NM_001848.3AD, AR
COL6A23060NM_001849.4AD, AR
COL6A39534NM_004369.4AD, AR
DSE2877NM_013352.4AR
EFEMP21332NM_016938.5AR
ELN2175NM_000501.4AD
FBLN51347NM_006329.4AD
FBN18616NM_000138.5AD
FBN28739NM_001999.4AD
FKBP14636NM_017946.4AR
GORAB1185NM_152281.3AR
LOX1254NM_002317.7AD
LTBP44763NM_003573.2AR
PLOD12184NM_000302.4AR
PRDM51893NM_018699.4AR
PYCR1960NM_006907.4AR
RIN22688NM_018993.4AR
ROBO34161NM_022370.4AR
SKI2187NM_003036.4AD
SLC39A131095NM_152264.5AR
SMAD21404NM_005901.6AD
SMAD31278NM_005902.4AD
TGFB21245NM_003238.6AD
TGFB31239NM_003239.5AD
TGFBR11512NM_004612.4AD
TGFBR21704NM_003242.6AD
ZNF46911862NM_001367624.2AR

Informations about the disease

Clinical Comment

The different types of Ehlers-Danlos syndrome form a heterogeneous group of diseases characterised by fragility of the soft connective tissue and manifest themselves in the skin, ligaments, joints, blood vessels and/or internal organs. The clinical spectrum is very diverse and ranges from mild skin and joint hypermobility to severe physical disability and life-threatening vascular complications. An overlap with osteogenesis imperfecta is observed. Diseases in this group include classic Ehlers-Danlos syndrome (EDS), musculo-contractival EDS, hypermobile EDS, vascular EDS, arthrochalasia EDS, dermatosparax EDS, periodontal EDS, X-linked EDS, brittle corneal syndrome, classic type 1 and type 2 EDS, cardiac valve EDS, spondylodysplastic EDS, myopathic EDS and kyphoscoliotic EDS.

References: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1244/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK541503/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1462/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1494/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1279/

 

Synonyms
  • Allelic: Aortic valve disease 1 (NOTCH1)
  • Allelic: Developmental + epileptic encephalopathy 93 (ATP6V1A)
  • Allelic: Leukemia, Philadelphia chromosome-positive, resistant to imatinib (ABL1)
  • Allelic: Megacystis-microcolon-intestinal hypoperistalsis syndrome 1 (MYLK)
  • Allelic: Mirror movements 1 and/or agenesis of the corpus callosum (DCC)
  • Achondrogenesis, type II or hypochondrogenesis (COL2A1)
  • Acromicric dysplasia (FBN1)
  • Adams-Oliver syndrome 5 (NOTCH1)
  • Al-Gazali syndrome (B3GALT6)
  • Aortic aneurysm, familial thoracic 10 (LOX)
  • Aortic aneurysm, familial thoracic 6 (ACTA2)
  • Aortic aneurysm, familial thoracic 7 (MYLK)
  • Arthrogryposis, distal, type 3 (PIEZO2)
  • Arthrogryposis, distal, type 5 (PIEZO2)
  • Arthrogryposis, distal, with impaired proprioception + touch (PIEZO2)
  • Avascular necrosis of the femoral head (COL2A1)
  • Bethlem myopathy 1 (COL6A1-3)
  • Bethlem myopathy 2 (COL12A1)
  • Bone mineral density variation QTL, osteoporosis (COL1A1)
  • Brittle cornea syndrome 1 (ZNF469)
  • Brittle cornea syndrome 2 (PTDM5)
  • C1s deficiency (C1S)
  • Caffey disease (COL1A1)
  • Congenital heart defects + skeletal malformations syndrome (ABL1)
  • Contractural arachnodactyly, congenital (FBN2)
  • Cutis laxa, AD (ELN)
  • Cutis laxa, AD 2 (FBLN5)
  • Cutis laxa, AR, type IA (FBLN5)
  • Cutis laxa, AR, type IB (EFEMP2)
  • Cutis laxa, AR, type IIA (ATP6V0A2)
  • Cutis laxa, AR, type IID (ATP6V1A)
  • Cutis laxa, AR, type IIE (LTBP1)
  • Cutis laxa, AR, type IIIA (ALDH18A1)
  • Cutis laxa, autosomal recessive, type IC (LTBP4)
  • Cutis laxa, autosomal recessive, type IIB-IIIB (PYCR1)
  • Czech dysplasia (COL2A1)
  • Ectopia lentis, familial (FBN1)
  • Ehlers Danlos syndrome, musculocontractural type 1 (CHST14)
  • Ehlers Danlos syndrome, type VI (PLOD1)
  • Ehlers-Danlos syndrome due to tenascin X deficiency (TNXB)
  • Ehlers-Danlos syndrome, arthrochalasia type, 1 (COL1A1)
  • Ehlers-Danlos syndrome, arthrochalasia type, 2 (COL1A2)
  • Ehlers-Danlos syndrome, cardiac valvular type (COL1A2)
  • Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1 (COL5A1)
  • Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 2 (COL5A2)
  • Ehlers-Danlos syndrome, classic-like, 2 (AEBP1)
  • Ehlers-Danlos syndrome, kyphoscoliotic type, 1 (PLOD1)
  • Ehlers-Danlos syndrome, kyphoscoliotic type, 2 (FKBP14)
  • Ehlers-Danlos syndrome, musculocontractural type 2 (DSE))
  • Ehlers-Danlos syndrome, periodontal type, 1 (C1R)
  • Ehlers-Danlos syndrome, periodontal type, 2 (C1S)
  • Ehlers-Danlos syndrome, spondylodysplastic type, 1 (B4GALT7)
  • Ehlers-Danlos syndrome, spondylodysplastic type, 2 (B3GALT6)
  • Ehlers-Danlos syndrome, vascular type (COL3A1)
  • Epiphyseal dysplasia, multiple, with myopia + deafness (COL2A1)
  • Gaze palsy, familial horizontal, with progressive scoliosis, 1 (ROBO3)
  • Gaze palsy, familial horizontal, with progressive scoliosis, 2 (DCC)
  • Geleophysic dysplasia 2 (FBN1)
  • Geroderma osteodysplasticum (GORAB)
  • Homocystinuria, B6-responsive and nonresponsive types (CBS)
  • Hypermobile Ehlers-Danlos syndrome (includes EDS type III)
  • Kniest dysplasia (COL2A1)
  • Kyphoscoliotic EDS (includes FKBP14-kEDS, PLOD1-kEDS)
  • Legg-Calve-Perthes disease (COL2A1)
  • Loeys-Dietz syndrome 1 (TGFBR1)
  • Loeys-Dietz syndrome 2 (TGFBR2)
  • Loeys-Dietz syndrome 3 (SMAD3)
  • Loeys-Dietz syndrome 4 (TGFB2)
  • Loeys-Dietz syndrome 5 (TGFB3)
  • MASS syndrome (FBN1)
  • Macrocephaly, alopecia, cutis laxa, scoliosis (RIN2)
  • Macular degeneration, age-related, 3 (FBLN5)
  • Macular degeneration, early-onset (FBN2)
  • Marden-Walker syndrome (PIEZO2)
  • Marfan lipodystrophy syndrome (FBN1)
  • Marfan syndrome (FBN1)
  • Meester-Loeys syndrome (BGN)
  • Menkes disease (ATP7A)
  • Moyamoya disease 5 (ACTA2)
  • Multisystemic smooth muscle dysfunction syndrome (ACTA2)
  • Neuropathy, hereditary, with or without age-related macular degeneration (FBLN5)
  • Occipital horn syndrome (ATP7A)
  • Osteoarthritis with mild chondrodysplasia (COL2A1)
  • Osteogenesis imperfecta, type I-IV (COL1A1)
  • Osteogenesis imperfecta, type II-IV (COL1A2)
  • Platyspondylic skeletal dysplasia, Torrance type (COL2A1)
  • Polymicrogyria with or without vascular-type EDS (COL3A1)
  • Shprintzen-Goldberg syndrome (SKI)
  • Spastic paraplegia 9A, AD (ALDH18A1)
  • Spastic paraplegia 9B, AR (ALDH18A1)
  • Spinal muscular atrophy, distal, X-linked 3 (ATP7A)
  • Spondylocheirodysplasia, Ehlers-Danlos syndrome-like (SLC39A13)
  • Spondyloepimetaphyseal dysplasia with joint laxity, type 1, with/-out fractures (B3GALT6)
  • Spondyloepimetaphyseal dysplasia, Strudwick type (COL2A1)
  • Spondyloepimetaphyseal dysplasia, X-linked (BGN)
  • Spondyloepiphyseal dysplasia congenita (COL2A1)
  • Spondyloepiphyseal dysplasia, Stanescu type (COL2A1)
  • Spondyloperipheral dysplasia (COL2A1)
  • Stickler sydrome, type I, nonsyndromic ocular (COL2A1)
  • Stickler syndrome, type I (COL2A1)
  • Stiff skin syndrome (FBN1)
  • Supravalvar aortic stenosis (ELN)
  • Thrombosis, hyperhomocysteinemic (CBS)
  • Ullrich congenital muscular dystrophy 1 (COL6A1-3)
  • Ullrich congenital muscular dystrophy 2 (COL12A1)
  • VISS s.: Vascular aneurysm, immune dysregulation, skeletal anomalies, skin/joint laxity (IPO8)
  • Vitreoretinopathy with phalangeal epiphyseal dysplasia (COL2A1)
  • Weill-Marchesani syndrome 2, AD (FBN1)
  • Wrinkly skin syndrome (ATP6V0A2)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
  • XL
  • XLR
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.