IllnessEpidermolysis bullosa, differential diagnosis
Summary
Comprehensive differential diagnostic panel for Epidermolysis bullosa syndrome comprising 21 guideline-curated genes and altogether 36 curated genes according to the clinical signs
102,5 kb (Extended panel: incl. additional genes)
- EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
NGS +
Gene panel
Selected genes
Name | Exon Length (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Heredity |
---|---|---|---|---|
CD151 | 762 | NM_001039490.2 | AR | |
COL17A1 | 4494 | NM_000494.4 | AD, AR | |
COL7A1 | 8835 | NM_000094.4 | AD, AR | |
DSP | 8616 | NM_004415.4 | AR | |
DST | 17028 | NM_001723.7 | AR | |
EXPH5 | 5970 | NM_015065.3 | AR | |
FERMT1 | 2034 | NM_017671.5 | AR | |
ITGA3 | 3156 | NM_002204.4 | AR | |
ITGA6 | 3222 | NM_000210.4 | AR | |
ITGB4 | 5259 | NM_001005731.3 | AR | |
JUP | 2238 | NM_002230.4 | AR | |
KLHL24 | 1975 | NM_017644.3 | AD | |
KRT14 | 1419 | NM_000526.5 | AD, AR | |
KRT5 | 1773 | NM_000424.4 | AD | |
LAMA3 | 5175 | NM_000227.6 | AR | |
LAMB3 | 3519 | NM_000228.3 | AR | |
LAMC2 | 3582 | NM_005562.3 | AR | |
PKP1 | 2181 | NM_001005337.3 | AR | |
PLEC | 13725 | NM_000445.5 | AD, AR | |
PLOD3 | 2217 | NM_001084.5 | AR | |
TGM5 | 2163 | NM_201631.4 | AR | |
DSG1 | 3150 | NM_001942.4 | AD, AR |
Informations about the disease
The term Epidermolysis bullosa comprises a group of rare diseases that cause brittle, blistering skin. The blisters can occur in response to minor injuries, including heat, rubbing, scratching or taping. In severe cases, the blisters can occur e.g. on the mucous membrane of the mouth or stomach mucosa. The disease usually commences in infancy or toddlers. Some people only develop symptoms in adolescence or early adulthood. Most forms of epidermolysis bullosa are inherited, and all classic transmission patterns are observed. When sequencing the 21 confirmed genes causing the 30 different types of Epidermolysis bullosa, a diagnostic yield of about 90% is achieved. This means that even an inconspicuous genetic finding cannot provide a reliable exclusion of a suspected clinical diagnosis.
Reference: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7064925/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1369/https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1304/https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1125/
- Alias: Dystrophic epidermolysis bullosa
- Alias: Epidermolysis bullosa simplex
- Alias: Hemidesmosomal epidermolysis bullosa
- Alias: Junctional epidermolysis bullosa
- Alias: Weber-Cockayne syndrome
- Allelic: Amelogenesis imperfecta, type IA (LAMB3)
- Allelic: Arrhythmogenic right ventricular dysplasia 12 (JUP)
- Allelic: Arrhythmogenic right ventricular dysplasia 8 (DSP)
- Allelic: Autoinflammatory disease, systemic, X-linked (IKBKG)
- Allelic: Cardiomyopathy, dilated, with woolly hair + keratoderma (DSP)
- Allelic: Dilated cardiomyopathy with woolly hair, keratoderma, tooth agenesis (DSP)
- Allelic: Dowling-Degos disease 1 (KRT5)
- Allelic: Epithelial recurrent erosion dystrophy (COL17A1)
- Allelic: Hypotrichosis 2 (CDSN)
- Allelic: Immunodeficiency 33 (IKBKG)
- Allelic: Incontinentia pigmenti (IKBKG)
- Allelic: Laryngoonychocutaneous syndrome (LAMA3)
- Allelic: Muscular dystrophy, limb-girdle, AR 17 (PLEC)
- Allelic: Neuropathy, hereditary sensory + autonomic, type VI (DST)
- Allelic: Skin fragility-woolly hair syndrome (DSP)
- Allelic: Toenail dystrophy, isolated (COL7A1)
- Allelic: Transient bullous of the newborn (COL7A1)
- Acrodermatitis enteropathica (SLC39A4)
- Acrokeratosis verruciformis (ATP2A2)
- Darier disease (ATP2A2)
- Dermatopathia pigmentosa reticularis (KRT14)
- Ectodermal dysplasia and immunodeficiency 1 (IKBKG)
- Ectodermal dysplasia/skin fragility syndrome (PKP1)
- Encephalopathy, progressive, early-onset + brain edema and/or leukoencephalopathy, 2 (NAXD)
- Epidermolysis bullosa dystrophica inversa (COL7A1)
- Epidermolysis bullosa dystrophica, AD (COL7A1)
- Epidermolysis bullosa dystrophica, AR (COL7A1)
- Epidermolysis bullosa dystrophica, Bart type (COL7A1)
- Epidermolysis bullosa dystrophica, localisata variant (CLO7A1)
- Epidermolysis bullosa of hands and feet (ITGB4)
- Epidermolysis bullosa pruriginosa (COL7A1)
- Epidermolysis bullosa simplex with muscular dystrophy (PLEC)
- Epidermolysis bullosa simplex with nail dystrophy (PLEC)
- Epidermolysis bullosa simplex, AR 1 (KRT14, KRT5)
- Epidermolysis bullosa simplex, AR 2 (DST)
- Epidermolysis bullosa simplex, Dowling-Meara type (KRT14, KRT5)
- Epidermolysis bullosa simplex, Koebner type (KRT14, KRT5)
- Epidermolysis bullosa simplex, Ogna type (PLEC)
- Epidermolysis bullosa simplex, Weber-Cockayne type (KRT14, KRT5)
- Epidermolysis bullosa simplex-MCR (KRT5)
- Epidermolysis bullosa simplex-MP (KRT5)
- Epidermolysis bullosa, generalized atrophic benign (LAMA3)
- Epidermolysis bullosa, junctional, Herlitz type (LAMA3, LAMB3, LAMC2)
- Epidermolysis bullosa, junctional, localisata variant (COL17A1)
- Epidermolysis bullosa, junctional, non-Herlitz type (COL17A1, ITGB4, LAMB3, LAMC2)
- Epidermolysis bullosa, junctional, with pyloric atresia (ITGB4, PLEC)
- Epidermolysis bullosa, junctional, with pyloric stenosis (ITGA6)
- Epidermolysis bullosa, lethal acantholytic (DSP)
- Epidermolysis bullosa, nonspecific, AR (EXPH5)
- Epidermolysis bullosa, pretibial (COL7A1)
- Epidermolytic hyperkeratosis 1 (KRT1)
- Epidermolytic hyperkeratosis 2 (KRT10)
- Erythroderma, congenital, palmoplantar keratoderma, hypotrichosis, hyper IgE (DSG1)
- Hailey-Hailey disease (ATP2C1)
- Hypotrichosis and recurrent skin vesicles (DSC3)
- Ichthyosis histrix, Curth-Macklin type (KRT1)
- Ichthyosis histrix, Lambert type (KRT10)
- Ichthyosis with confetti (KRT10)
- Ichthyosis, annular epidermolytic 1 (KRT10)
- Ichthyosis, annular epidermolytic 2 (KRT1)
- Interstitial lung disease, nephrotic syndrome, epidermolysis bullosa, cong. (ITGA3)
- Keratolytic winter erythema (CTSB)
- Keratosis palmoplantaris striata I, AD (DSG1)
- Keratosis palmoplantaris striata II (DSP)
- Keratosis palmoplantaris striata III (KRT1)
- Kindler syndrome (FERMT1)
- Lysyl hydroxylase 3 deficiency (PLOD3)
- Naegeli-Franceschetti-Jadassohn syndrome (KRT14)
- Naxos disease (JUP)
- Nephropathy with pretibial epidermolysis bullosa, deafness (CD151)
- Palmoplantar keratoderma, epidermolytic, 2 (KRT1)
- Palmoplantar keratoderma, nonepidermolytic (KRT1)
- Peeling skin syndrome 1 (CDSN)
- Peeling skin syndrome 2 (TGM5)
- Peeling skin syndrome 4 (CSTA)
- Peeling skin syndrome 5 (SERPINB8)
- Peeling skin syndrome 6 (FLG2)
- Peeling skin with leukonychia, acral punctate keratoses, cheilitis, knuckle pads (CAST)
- AD
- AR
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatics and clinical interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboratory requirement
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.