IllnessGlucocorticoid deficiency, familial; differential diagnosis

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for familial Glucocorticoid-deficiency comprising 15 guideline-curated and altogether 20 curated genes according to the clinical signs

GP0170

Number of genes

17 Accredited laboratory test

Examined sequence length

25,4 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
29,2 kb (Extended panel: incl. additional genes)

Analysis Duration

on request

Test material

EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)

Diagnostic indications

NGS +

[Sanger]

Gene panel

Selected genes

Name	Exon Length (bp)	OMIM-G	Referenz-Seq.	Heredity
AAAS	1641	605378	NM_015665.6	AR
ABCD1	2238	300371	NM_000033.4	XLR
AIRE	1638	607358	NM_000383.4	AR
CDKN1C	951	600856	NM_000076.2	AD
CYP11A1	1566	118485	NM_000781.3	AD
MC2R	894	607397	NM_000529.2	AR
MCM4	2592	602638	NM_005914.4	AR
MRAP	519	609196	NM_178817.4	AR
NNT	3261	607878	NM_012343.4	AR
NR0B1	1413	300473	NM_000475.5	XL
NR5A1	1386	184757	NM_004959.5	AD, AR
SAMD9	4770	610456	NM_001193307.2	AD
STAR	858	600617	NM_000349.3	AR
TXNRD2	1575	606448	NM_006440.5	AR
POMC	804	176830	NM_001035256.3	AR
SGPL1	1721	603729	NM_003901.4	AR
TBX19	1347	604614	NM_005149.3	AR

Informations about the disease

Clinical Comment

Primary adrenal insufficiencies with neonatal hyperpigmentation, hypoglycemia, failure to thrive, recurrent infections; biochemically glucocorticoid deficiency without mineralocorticoid deficiency

Functional NR3C1 deficiency (Glucocorticoid receptor) present with similar symptoms.

Synonyms

Alias: Congenital adrenal hypoplasia; Familial glucocorticoid deficiency
Allelic: 46XX sex reversal 4 (NR5A1)
Allelic: 46XY sex reversal (NR5A1)
Allelic: 46XY sex reversal 2, dosage-sensitive (NR0B1)
Allelic: Albinism, oculocutaneous, type II, modifier of (MC1R)
Allelic: Analgesia from kappa-opioid receptor agonist, female-specific (MC1R)
Allelic: Beckwith-Wiedemann syndrome (CDKN1C)
Allelic: Colorectal cancer, susceptibility to, 12 (POLE)
Allelic: Melanoma, cutaneous malignant, 5 (MC1R)
Allelic: Obesity, early-onset, susceptibility to (POMC)
Allelic: Premature ovarian failure 7 (NR5A1)
Allelic: Skin/hair/eye pigmentation 2, blond hair/fair skin (MC1R)
Allelic: Skin/hair/eye pigmentation 2, red hair/fair skin (MC1R)
Allelic: Spermatogenic failure 8 (NR5A1)
Allelic: Tumoral calcinosis, familial, normophosphatemic (SAMD9)
Allelic: UV-induced skin damage (MC1R)
Achalasia-addisonianism-alacrimia syndrome (AAAS)
Adrenal hypoplasia, congenital (NR0B1)
Adrenal insufficiency, congenital, with 46XY sex reversal, partial or complete (CYP11A1)
Adrenocortical insufficiency (NR5A1)
Adrenocorticotropic hormone deficiency (TBX19)
Adrenoleukodystrophy (ABCD1)
Adrenomyeloneuropathy, adult (ABCD1)
Allelic: Aldosterone to renin ratio raised (CYP11B1)
Allelic: Low renin hypertension, susceptibility to (CYP11B1)
Autoimmune polyendocrinopathy syndrome , type I, with/-out reversible metaphyseal dysplasia (AIRE)
FILS - Facial dysmorphism, Immunodeficiency, Livedo, Short stature - syndrome (POLE)
Glucocorticoid deficiency 2 (MRAP)
Glucocorticoid deficiency 4, with/-out mineralocorticoid deficiency (NNT)
Glucocorticoid deficiency 5 (TXNRD2)
Glucocorticoid deficiency, due to ACTH unresponsiveness (MC2R)
Hypoaldosteronism, congenital, due to CMO I deficiency (CYP11B1)
Hypoaldosteronism, congenital, due to CMO II deficiency (CYP11B1)
IMAGE syndrome (CDKN1C)
IMAGE-I syndrome (POLE)
Immunodeficiency 54 (MCM4)
Lipoid adrenal hyperplasia (STAR)
MIRAGE syndrome (SAMD9)
Nephrotic syndrome, type 14 (SGPL1)
Obesity, adrenal insufficiency, red hair due to POMC deficiency (POMC)

Heredity, heredity patterns etc.

OMIM-Ps

Multiple OMIM-Ps

ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

DAkkS-akkreditiertes Labor
EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
Gen-Konversionen
komplexe Inversionen
Balancierte Translokationen
Mitochondriale Varianten
Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
niedriger Mosaik-Status
Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
Varianten innerhalb von Pseudogenen
die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.