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Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
Know how in the analysis of genetic material.
For the benefit of patients.

IllnessHypertension, pulmonary; differential diagnosis

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for pulmonary Hypertension comprising 14 guideline-curated genes and altogether 17 curated genes according to the clinical signs

ID
PP1001
Number of genes
14 Accredited laboratory test
Examined sequence length
28,2 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
29,8 kb (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Test material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

[Sanger]

 

Gene panel

Selected genes

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
ABCC84746NM_000352.6AD, AR
ACVRL11512NM_000020.3AD
AQP1810NM_198098.4Ass
ATP13A33856NM_024524.4AR
BMPR23117NM_001204.7AD
CAV1537NM_001753.5AD
EIF2AK44950NM_001013703.4AR
ENG1878NM_000118.3AD
GDF21290NM_016204.4AD
KCNK31185NM_002246.3AD
SMAD91404NM_001127217.3AD
SOX171245NM_022454.4AD
TBX41638NM_018488.3AD, AR
SARS21563NM_001145901.2AR

Informations about the disease

Clinical Comment

Group of diseases with elevated pulmonary arterial resistance leading to right heart failure; progressive, potentially fatal; idiopathic and/or familial, induced by drug/toxin or associated with other diseases like congenital heart disease, connective tissue disease, HIV, schistosomiasis, portal hypertension

 

Synonyms
  • Alias: Pulmonary arterial hypertension
  • Alias: Pulmonary hypertension, familial primary, 1, with/-out HHT
  • Allelic: Acromesomelic dysplasia, Demirhan type (BMPR1B)
  • Allelic: Brachydactyly, type A1, D (BMPR1B)
  • Allelic: Brachydactyly, type A2 (BMPR1B)
  • Allelic: Lipodystrophy, congenital generalized, type 3 (CAV1)
  • Allelic: Lipodystrophy, familial partial, type 7 (CAV1)
  • Amelia, posterior, with pelvic + pulmonary hypoplasia syndrome (TBX4)
  • Aquaporin-1 deficiency (AQP1)
  • Diabetes mellitus, noninsulin-dependent (ABCC8)
  • Diabetes mellitus, permanent neonatal 3, with/-out neurologic features (ABCC8)
  • Diabetes mellitus, transient neonatal 2 (ABCC8)
  • Hemangioma, capillary infantile, susceptibility to (KDR)
  • Heritable pulmonary arterial hypertension [panelapp] (ATP13A3)
  • Hyperinsulinemic hypoglycemia, familial, 1 (ABCC8)
  • Hyperuricemia, pulmonary hypertension, renal failure, and alkalosis (SARS2)
  • Hypoglycemia of infancy, leucine-sensitive (ABCC8)
  • Immunodeficiency 75 (TET2)
  • Ischiocoxopodopatellar syndrome with/-out pulmonary arterial hypertension (TBX4)
  • Multiple mitochondrial dysfunctions syndrome 1 (NFU1)
  • Pulmonary hypertension, primary, 1 (BMPR2)
  • Pulmonary hypertension, primary, 2 (SMAD9)
  • Pulmonary hypertension, primary, 3 (CAV1)
  • Pulmonary hypertension, primary, 4 (KCNK3)
  • Pulmonary hypertension, primary, fenfluramine or dexfenfluramine-associated (BMPR2)
  • Pulmonary venoocclusive disease 1 (BMPR2)
  • Pulmonary venoocclusive disease 2 (EIF2AK4)
  • Telangiectasia, hereditary hemorrhagic, type 1 (ENG)
  • Telangiectasia, hereditary hemorrhagic, type 2 (ACVRL1)
  • Telangiectasia, hereditary hemorrhagic, type 5 (GDF2)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
  • Ass
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.