IllnessKartagener syndrome/primary ciliary dyskinesia, differential diagnosis
Summary
Comprehensive differential diagnostic panel for Kartagener syndrome/primary ciliary dyskinesia comprising 2 core genes, 33 guideline-curated genes and altogether 43 curated genes according to the clinical signs
136,0 kb (Extended panel: incl. additional genes)
- EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Gene panel
Selected genes
Name | Exon Length (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Heredity |
---|---|---|---|---|
CCDC103 | 729 | NM_001258395.2 | AR | |
CCDC39 | 2826 | NM_181426.2 | AR | |
CCDC40 | 3429 | NM_017950.4 | AR | |
CCDC65 | 1455 | NM_033124.5 | AR | |
CCNO | 1053 | NM_021147.5 | AR | |
CFAP298 | 873 | NM_021254.4 | AR | |
DNAAF1 | 2178 | NM_178452.6 | AR | |
DNAAF11 | 1401 | NM_012472.6 | AR | |
DNAAF2 | 2370 | NM_018139.3 | AR | |
DNAAF3 | 1827 | NM_001256714.1 | AR | |
DNAAF4 | 1131 | NM_001033559.3 | AD, AR | |
DNAAF5 | 2568 | NM_017802.4 | AR | |
DNAH11 | 13551 | NM_001277115.2 | AR | |
DNAH5 | 13875 | NM_001369.3 | AR | |
DNAH8 | 14527 | NM_001206927.2 | AR | |
DNAI1 | 2100 | NM_012144.4 | AR | |
DNAI2 | 1782 | NM_001172810.3 | AR | |
DNAL1 | 573 | NM_031427.4 | AR | |
DRC1 | 2223 | NM_145038.5 | AR | |
GAS8 | 1448 | NM_001481.3 | AR | |
MCIDAS | 1165 | NM_001190787.3 | AR | |
NME8 | 1767 | NM_016616.5 | AR | |
ODAD1 | 2013 | NM_144577.4 | AR | |
ODAD2 | 3264 | NM_018076.5 | AR | |
ODAD3 | 1788 | NM_145045.5 | AR | |
OFD1 | 3039 | NM_003611.3 | XL | |
RPGR | 2448 | NM_000328.3 | XLR | |
RSPH1 | 930 | NM_080860.4 | AR | |
RSPH4A | 2151 | NM_001010892.3 | AR | |
RSPH9 | 921 | NM_001193341.2 | AR | |
SPAG1 | 2781 | NM_003114.5 | AR | |
ZMYND10 | 1323 | NM_015896.4 | AR | |
DNAH1 | 12798 | NM_015512.5 | AR | |
DNAH9 | 13461 | NM_001372.4 | AR | |
FOXJ1 | 1266 | NM_001454.4 | AD | |
GAS2L2 | 2643 | NM_139285.4 | AR | |
LZTFL1 | 900 | NM_020347.4 | AR | |
SPEF2 | 5469 | NM_024867.4 | AR | |
STK36 | 3885 | NM_001243313.2 | AR |
Informations about the disease
Primary ciliary dyskinesia is characterized by chronic respiratory infections, abnormally positioned internal organs and infertility. Symptoms of this disease are caused by malfunctioning cilia and flagella, e.g. in the respiratory tract. Respiratory problems occur in newborns, as well as frequent respiratory infections in early childhood, and eventually bronchiectasis with possibly life-threatening respiratory problems later in life. Half of the patients present with situs inversus totalis, Kartagener syndrome, but usually without apparent health problems. Approximately 12% of affected individuals suffer from heterotaxy syndrome, situs ambiguus with abnormalities of the heart, liver, intestine or spleen, the severity varies widely. Recurrent otitis media is also often seen, which can lead to hearing loss; hydrocephalus, on the other hand, is rare. The disease is mostly inherited in an autosomal recessive manner, rarely X-linked, it can be caused by mutations in several dozen different genes. Mutations in the DNAI1 and DNAH5 genes are responsible for up to one third of cases. Mutations in the other genes associated with this disease are each found in only a small proportion of cases. Yet, in many individuals with primary ciliary dyskinesia, the cause of the disorder remains unclear. Therefore, a negative molecular genetic result does not exclude the clinical diagnosis.
Reference: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1122/
- Alias: Immotile cilia syndrome
- Alias: Primary ciliary dyskinesia, PCD
- Allelic: Dyslexia, susceptibility to, 1 (DNAAF4)
- Allelic: Infertility [panelapp] (CFAP74)
- Allelic: Male infertility due to sperm motility disorder [MONDO:0018395] (CFAP45)
- Allelic: Spermatogenic failure 18 (DNAH1)
- Allelic: Spermatogenic failure 46 (DNAH8)
- Ciliary dyskinesia, primary [panelapp] (CFAP74)
- Ciliary dyskinesia, primary, 1, with/-out situs inversus (DNAI1)
- Ciliary dyskinesia, primary, 10 (DNAAF2)
- Ciliary dyskinesia, primary, 11 (RSPH4A)
- Ciliary dyskinesia, primary, 12 (RSPH9)
- Ciliary dyskinesia, primary, 13 (DNAAF1)
- Ciliary dyskinesia, primary, 14 (CCDC39)
- Ciliary dyskinesia, primary, 15 (CCDC40)
- Ciliary dyskinesia, primary, 16 (DNAL)
- Ciliary dyskinesia, primary, 17 (CCDC103)
- Ciliary dyskinesia, primary, 18 (DNAAF5)
- Ciliary dyskinesia, primary, 19 (LRCC6)
- Ciliary dyskinesia, primary, 2 (DNAAF3)
- Ciliary dyskinesia, primary, 20 (CCDC114)
- Ciliary dyskinesia, primary, 21 (DRC1)
- Ciliary dyskinesia, primary, 22 (ZMYND10(
- Ciliary dyskinesia, primary, 23 (ARMC4)
- Ciliary dyskinesia, primary, 24 (RSPH1)
- Ciliary dyskinesia, primary, 25 (DNAAF4)
- Ciliary dyskinesia, primary, 26 (CFAP298)
- Ciliary dyskinesia, primary, 27 (CCDC65)
- Ciliary dyskinesia, primary, 28 (SPAG1)
- Ciliary dyskinesia, primary, 29 (CCNO)
- Ciliary dyskinesia, primary, 3, with/-out situs inversus (DNAH5)
- Ciliary dyskinesia, primary, 30 (CCDC151)
- Ciliary dyskinesia, primary, 32 (RSPH3)
- Ciliary dyskinesia, primary, 33 (GAS8)
- Ciliary dyskinesia, primary, 34 (DNAJB13)
- Ciliary dyskinesia, primary, 35 (TTC25)
- Ciliary dyskinesia, primary, 36, XL (DNAAF6 syn PIH1D3)
- Ciliary dyskinesia, primary, 37 (DNAH1)
- Ciliary dyskinesia, primary, 38 (CFAP300)
- Ciliary dyskinesia, primary, 39 (LRRC56)
- Ciliary dyskinesia, primary, 40 (DNAH9)
- Ciliary dyskinesia, primary, 41 (GAS2L2)
- Ciliary dyskinesia, primary, 42 (MCIDAS)
- Ciliary dyskinesia, primary, 43 (FOXJ1)
- Ciliary dyskinesia, primary, 44 (NEK10)
- Ciliary dyskinesia, primary, 45 (TTC12)
- Ciliary dyskinesia, primary, 5 (HYDIN)
- Ciliary dyskinesia, primary, 6 (NME8)
- Ciliary dyskinesia, primary, 7, with/-out situs inversus (DNAH11)
- Ciliary dyskinesia, primary, 9, with/-out situs inversus (DNAI2)
- Ciliopathies, laterality dis., isomerism, resp. ciliop. incl. non-CF bronchiect. [panelapp] (DNAH8)
- Heterotaxy [panelapp] (CFAP46)
- Heterotaxy, visceral, 6, AR (CFAP53)
- Situs inversus [MONDO:0010029] (CFAP45)
- Visceral heterotaxy [MONDO:0018677] (CFAP52)
- AD
- AR
- XL
- XLR
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatics and clinical interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboratory requirement
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.