IllnessLymph edema, congenital hereditary; differential diagnosis
Summary
Comprehensive differential diagnostic panel for congenital hereditary Lymphatic edema comprising 9 guideline-curated and altogether 45 curated genes according to the clinical signs
139,2 kb (Extended panel: incl. additional genes)
- EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
NGS +
[Sanger]
Gene panel
Selected genes
Name | Exon Length (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Heredity |
---|---|---|---|---|
CCBE1 | 1221 | NM_133459.4 | AR | |
EPHB4 | 2964 | NM_004444.5 | AD | |
FLT4 | 4092 | NM_182925.5 | AD | |
FOXC2 | 1506 | NM_005251.3 | AD | |
GATA2 | 1443 | NM_032638.5 | AD | |
GJC2 | 1320 | NM_020435.4 | AD | |
KIF11 | 3171 | NM_004523.4 | AD | |
PIEZO1 | 7566 | NM_001142864.4 | AD | |
PTPN14 | 3564 | NM_005401.5 | AR | |
SOX18 | 1155 | NM_018419.3 | AD, AR | |
VEGFC | 1263 | NM_005429.5 | AD | |
ADAMTS3 | 3653 | NM_014243.3 | AR | |
BRAF | 2301 | NM_004333.6 | AD | |
CBL | 2721 | NM_005188.4 | AD | |
CELSR1 | 9045 | NM_014246.4 | AD | |
CHD7 | 8994 | NM_017780.4 | AD | |
DCHS1 | 9897 | NM_003737.4 | AR | |
FAT4 | 14946 | NM_024582.6 | AR | |
GJA1 | 1149 | NM_000165.5 | AD | |
HRAS | 570 | NM_005343.4 | AD | |
KRAS | 567 | NM_004985.5 | AD | |
LZTR1 | 2523 | NM_006767.4 | AD, AR | |
MAP2K1 | 1182 | NM_002755.4 | AD | |
MAP2K2 | 1203 | NM_030662.4 | AD | |
NF1 | 8457 | NM_001042492.3 | AD | |
NRAS | 570 | NM_002524.5 | SMu | |
NSD1 | 8091 | NM_022455.5 | AD | |
PMM2 | 741 | NM_000303.3 | AR | |
PPP1CB | 350 | NM_002709.3 | AD | |
PTPN11 | 1782 | NM_002834.5 | AD | |
RAF1 | 1947 | NM_002880.4 | AD | |
RASA1 | 3144 | NM_002890.3 | AD | |
RIT1 | 660 | NM_006912.6 | AD | |
SHANK3 | 5386 | NM_001372044.2 | AD | |
SHOC2 | 1749 | NM_007373.4 | AD | |
SOS1 | 4002 | NM_005633.4 | AD | |
SOS2 | 3999 | NM_006939.4 | AD | |
SPRED1 | 1335 | NM_152594.3 | AD | |
TSC1 | 3495 | NM_000368.5 | AD | |
TSC2 | 5424 | NM_000548.5 | AD |
Informations about the disease
Hereditary lymphedema, swelling of extremities due to failure in development and/or function of lymphatics, leading to lymph accumulation in interstitial fluid space; highly variable in expression/penetrance including unaffected obligate heterozygotes; onset from embryonic to middle age. Classic congenital edema of lower body half -> no other obvious manifestations; complications of Milroy disease include hypoproteinemia (intestinal loss of albumin), increased susceptibility to infection in affected limb, in some cases angiosarcoma
- Alias: Early-onset primary congenital lymphedema
- Allelic: Congenital heart defects, multiple types, 7 (FLT4)
- Allelic: Fibromatosis, gingival, 1 (SOS1)
- Allelic: Hemangioma, capillary infantile, somatic (FLT4)
- Allelic: Hypogonadotropic hypogonadism 5 with/-out anosmia (CHD7)
- Allelic: Juvenile myelomonocytic leukemia (CBL)
- Allelic: Leukemia, juvenile myelomonocytic (NF1)
- Allelic: Leukodystrophy, hypomyelinating, 2 (GJC2)
- Allelic: Mitral valve prolapse 2 (DCHS1)
- Allelic: Neurofibromatosis, familial spinal (NF1)
- Allelic: Schwannomatosis-2, susceptibility to (LZTR1)
- Allelic: Spastic paraplegia 44, AR (GJC2)
- CHARGE [Coloboma, Heart anomalies, choanal Atresia, mR, Genital + Ear anomalies] syndrome (CHD7)
- Capillary malformation-arteriovenous malformation 1 (RASA1)
- Capillary malformation-arteriovenous malformation 2 (EPHB4)
- Cardiofaciocutaneous syndrome (BRAF)
- Cardiofaciocutaneous syndrome 2 (KRAS)
- Cardiofaciocutaneous syndrome 3 (MAP2K1)
- Cardiomyopathy, dilated, 1NN (RAF1)
- Choanal atresia + lymphedema (PTPN14)
- Congenital disorder of glycosylation, type Ia (PMM2)
- Congenital myopathy with excess muscle spindles (HRAS)
- Costello syndrome (HRAS)
- Ectodermal dysplasia + immunodeficiency 1 (IKBKG)
- Emberger syndrome [Lymphedema, primary, with Mmyelodysplasia] (GATA2)
- Hennekam lymphangiectasia-lymphedema syndrome 1 (CCBE1)
- Hennekam lymphangiectasia-lymphedema syndrome 2 (FAT4)
- Hennekam lymphangiectasia-lymphedema syndrome 3 (ADAMTS3)
- Hypotrichosis-lymphedema-telangiectasia syndrome (SOX18)
- Hypotrichosis-lymphedema-telangiectasia-renal defect syndrome (SOX18)
- Immunodeficiency 33 (IKBKG)
- Immunodeficiency 42 (RORC)
- Incontinentia pigmenti (IKBKKG)
- LEOPARD syndrome 1 (PTPN11)
- LEOPARD syndrome 2 (RAF1)
- LEOPARD syndrome 3 (BRAF)
- Legius syndrome (SPREAD1)
- Lymphangioleiomyomatosis (TSC1)
- Lymphangioleiomyomatosis, somatic (TSC2)
- Lymphatic malformation 10 (ANGPT2)
- Lymphatic malformation 11 (TIE1)
- Lymphatic malformation 1; [Nonne-Milroy lymphedema] (FLT4)
- Lymphatic malformation 3 (GJC2)
- Lymphatic malformation 4 (VEGFC)
- Lymphatic malformation 6 (PIEZO1)
- Lymphatic malformation 7 (EPHB4)
- Lymphatic malformation 9 (CELSR1)
- Lymphedema-distichiasis syndrome (FOXC2)
- Lymphedema-distichiasis syndrome with renal disease and diabetes mellitus (FOXC2)
- Lymphoedema [MONDO:0019297] (ARAP3)
- Lymphoedema [MONDO:0019297] (RORC)
- Metachondromatosis 1 (PTPN11)
- Microcephaly with or without chorioretinopathy, lymphedema, or mental retardation (KIF11)
- Neurofibromatosis, type 1 (NF1)
- Neurofibromatosis-Noonan syndrome (NF1)
- Noonan syndrome 1 (PTPN11)
- Noonan syndrome 10 (LZTR1)
- Noonan syndrome 2 (LZTR1)
- Noonan syndrome 3 (KRAS)
- Noonan syndrome 4 (SOS1)
- Noonan syndrome 5 (RAF1)
- Noonan syndrome 6 (NRAS)
- Noonan syndrome 7 (BRAF)
- Noonan syndrome 8 (RIT1)
- Noonan syndrome 9 (SOS2)
- Noonan syndrome-like disorder with loose anagen hair 2 (PPP1CB)
- Noonan syndrome-like disorder with/-out juvenile myelomonocytic leukemia (CBL)
- Noonan syndrome-like with loose anagen hair 1 (SHOC2)
- Phelan-McDermid syndrome (SHANK3)
- RAS-associated autoimmune leukoproliferative disorder (KRAS)
- Schizophrenia 15 (SHANK3)
- Sotos syndrome 1 (NSD1)
- Van Maldergem syndrome 1 (DCHS1)
- Van Maldergem syndrome 2 (FAT4)
- Watson syndrome (NF1)
- ardiofaciocutaneous syndrome 4 (MAP2K2)
- AD
- AR
- SMu
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatics and clinical interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboratory requirement
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.