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Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
Know how in the analysis of genetic material.
For the benefit of patients.

IllnessMacrosomia, congenital; differential diagnosis

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for congenital macrosomia comprising 9 core as well as core candidate genes and altogether 33 curated genes according to the clinical signs

ID
MP0780
Number of genes
24 Accredited laboratory test
Examined sequence length
22,3 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
71,6 kb (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Test material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

[Sanger]

 

Gene panel

Selected genes

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
CDKN1C951NM_000076.2AD
DIS3L22658NM_152383.5AR
EZH22256NM_004456.5AD
GPC31743NM_004484.4XL
HRAS570NM_005343.4AD
NFIX1533NM_001271043.2AD
NSD18091NM_022455.5AD
PIK3CA3207NM_006218.4AD
PTEN1212NM_000314.8AD
AKT11443NM_005163.2AD
AKT21446NM_001626.6AD
BRWD35409NM_153252.5XL
CHD87746NM_001170629.2AD
DNMT3A2739NM_175629.2AD
EED2100NM_003797.5AD
GPC41671NM_001448.3XLR
H1-4661NM_005321.3AD
MTOR7650NM_004958.4AD
NFIB1485NM_001190737.2AD
OFD13039NM_003611.3XL
PDGFRB3321NM_002609.4AD
RNF125699NM_017831.4AD
SETD27695NM_014159.7AD
SUZ122220NM_015355.4AD

Informations about the disease

Clinical Comment

Macrosomia refers to newborns at regular term carrying excessive birth weight (>4kg). The abnormal growth is the result of a disturbed interplay of genetic, epigenetic and hormonal factors that control human growth. Macrosomia is diagnosed after birth, often in the setting of poorly controlled gestational or pregestational diabetes; polyhydramnios are also common. Less commonly, overgrowth syndromes are observed such as Beckwith-Wiedemann (BWS), Simpson-Golabi-Behmel, Sotos, Weaver, Perlman, Tatton-Brown-Rahman, Parkes Weber, PTEN, PIK3CA syndromes or segmental overgrowth as in Proteus syndrome and others. Overgrowth syndromes are usually associated with health problems and in some cases carry increased risks for tumor development susceptibility and/or hormonal alterations, life-threatening hypoglycemia (e.g. BWS), seizures (Sotos syndrome) and developmental delay. The inheritance pattern of several of the above syndromes is autosomal dominant, but all other inheritance patterns occur, including epigenetic alterations and uniparental disomy (especially in BWS). The molecular genetic diagnostic yield in macrosomia is up to 80%, such as in the differential diagnosis of BWS. Thus, a negative result does not exclude the obvious clinical diagnosis.

References: doi: 10.3389/fped.2020.574857

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1394/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1219/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1479/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK153722/

 

Synonyms
  • Alias: Genetic overgrowth/obesity syndrome
  • Alias: Macrosomia adiposa congenita
  • Allelic: Acute myeloid leukemia, somatic (DNMT3A)
  • Allelic: Autism, susceptibility to, 18 (CHD8)
  • Allelic: Basal ganglia calcification, idiopathic, 4 (PDGFRB)
  • Allelic: Bladder cancer, somatic (HRAS)
  • Allelic: Breast cancer, somatic (AKT1)
  • Allelic: Breast cancer, somatic (PIK3CA)
  • Allelic: Colorectal cancer, somatic (AKT1)
  • Allelic: Colorectal cancer, somatic (PIK3CA)
  • Allelic: Congenital myopathy with excess of muscle spindles (HRAS)
  • Allelic: Cortical dysplasia, complex, with other brain malformations 10 (APC2)
  • Allelic: Costello syndrome (HRAS)
  • Allelic: Cowden syndrome 5 (PIK3CA)
  • Allelic: Diabetes mellitus, type II (AKT2)
  • Allelic: Focal cortical dysplasia, type II, somatic (MTOR)
  • Allelic: Gastric cancer, somatic (PIK3CA)
  • Allelic: Glioma susceptibility 2 (PTEN)
  • Allelic: Hepatocellular carcinoma, somatic (PIK3CA)
  • Allelic: Heyn-Sproul-Jackson syndrome (DNMT3A)
  • Allelic: IMAGE syndrome (CGKN1C)
  • Allelic: Joubert syndrome 10 (OFD1)
  • Allelic: Keratosis, seborrheic, somatic (PIK3CA)
  • Allelic: Macrodactyly, somatic (PIK3CA)
  • Allelic: Marshall-Smith syndrome (NFIX)
  • Allelic: Meningioma (PTEN)
  • Allelic: Myeloproliferative disorder with eosinophilia (PDGFRB)
  • Allelic: Myofibromatosis, infantile, 1 (PDGFRB)
  • Allelic: Nevus sebaceous or woolly hair nevus, somatic (HRAS)
  • Allelic: Nevus, epidermal, somatic (PIK3CA)
  • Allelic: Nonsmall cell lung cancer, somatic (PIK3CA)
  • Allelic: Orofaciodigital syndrome I (OFD1)
  • Allelic: Ovarian cancer, somatic (AKT1)
  • Allelic: Ovarian cancer, somatic (PIK3CA)
  • Allelic: Premature aging syndrome, Penttinen type (PDGFRB)
  • Allelic: Prostate cancer, somatic (PTEN)
  • Allelic: Retinitis pigmentosa 23 (OFD1)
  • Allelic: Schimmelpenning-Feuerstein-Mims syndrome, somatic mosaic (HRAS)
  • Allelic: Spitz nevus or nevus spilus, somatic (HRAS)
  • Allelic: Thyroid carcinoma, follicular, somatic (HRAS)
  • Allelic: Wilms tumor, somatic (GPC3)
  • Beckwith-Wiedemann syndrome (CDKN1C)
  • Beckwith-Wiedemann syndrome due to imprinting defect of 11p15 [MONDO:0016475] (NLRP2)
  • CLAPO syndrome, somatic (PIK3CA)
  • CLOVE syndrome, somatic (PIK3CA)
  • Capillary malformation-arteriovenous malformation 1 (RASA1)
  • Cohen-Gibson syndrome (EED)
  • Cowden syndrome 1 (PTEN)
  • Cowden syndrome 6 (AKT1)
  • Ehlers-Danlos syndrome, kyphoscoliotic type, 1 (PLOD1)
  • Hypoinsulinemic hypoglycemia with hemihypertrophy (AKT2)
  • Imagawa-Matsumoto syndrome (SUZ12)
  • Keipert syndrome (GPC4)
  • Kosaki overgrowth syndrome (PDGFRB)
  • Lhermitte-Duclos syndrome (PTEN)
  • Luscan-Lumish syndrome (SETD2)
  • Macrocephaly, acquired, with impaired intellectual development (NFIB)
  • Macrocephaly, neurodevelopmental delay, lymphoid hyperplasia, persistent fetal Hb (ZBTB7A)
  • Macrocephaly/autism syndrome (PTEN)
  • Megalencephaly-capillary malformation-polymicrogyria syndrome, somatic (PIK3CA)
  • Megalencephaly-polymicrogyria-polydactyly-hydrocephalus syndrome 1 (PIK3R2)
  • Megalencephaly-polymicrogyria-polydactyly-hydrocephalus syndrome 2 (AKT3)
  • Megalencephaly-polymicrogyria-polydactyly-hydrocephalus syndrome 3 (CCND2)
  • Mental retardation, XL 93 (BRWD3)
  • Perlman syndrome (DIS3L2)
  • Preimplantation embryonic lethality 2 (PADI6)
  • Proteus syndrome, somatic (AKT1)
  • Rahman syndrome (HIST1H1E)
  • Shashi-Pena syndrome (ASXL2)
  • Simpson-Golabi-Behmel syndrome, type 1 (GPC3)
  • Simpson-Golabi-Behmel syndrome, type 2 (OFD1)
  • Smith-Kingsmore syndrome (MTOR)
  • Sotos syndrome 1 (NSD1)
  • Sotos syndrome 2 (NFIX)
  • Tatton-Brown-Rahman syndrome (DNMT3A)
  • Tenorio syndrome (RNF125)
  • Weaver syndrome (EZH2)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
  • XL
  • XLR
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.