IllnessMicrocephaly, isolated, primary/secondary; differential diagnosis
Summary
Comprehensive differential diagnostic panel for Microcephaly, isolated, primary or secondary, comprising 6 guideline-curated and another 28 curated genes
80,1 kb (Extended panel: incl. additional genes)
- EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
NGS +
[Sanger]
Gene panel
Selected genes
Name | Exon Length (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Heredity |
---|---|---|---|---|
ASPM | 10434 | NM_018136.5 | AR | |
CENPJ | 4017 | NM_018451.5 | AR | |
CEP152 | 4965 | NM_014985.4 | AR | |
MCPH1 | 2508 | NM_024596.5 | AR | |
NBN | 2265 | NM_002485.5 | AR | |
WDR62 | 4572 | NM_001083961.2 | AR | |
AP4B1 | 2220 | NM_006594.5 | AR | |
AP4M1 | 1362 | NM_004722.4 | AR | |
AP4S1 | 480 | NM_007077.5 | AR | |
CDK5RAP2 | 5682 | NM_018249.6 | AR | |
CDK6 | 981 | NM_001259.8 | AR | |
CENPE | 8106 | NM_001813.3 | AR | |
CEP135 | 3423 | NM_025009.5 | AR | |
CRIPT | 306 | NM_014171.6 | AR | |
KNL1 | 7029 | NM_170589.5 | AR | |
MRE11 | 2127 | NM_005591.4 | AR | |
NSRP1 | 1995 | NM_001261467.2 | AR | |
PALB2 | 3561 | NM_024675.4 | AR | |
PHC1 | 3015 | NM_004426.3 | AR | |
RAD51C | 1131 | NM_058216.3 | AR | |
SASS6 | 1974 | NM_194292.3 | AR | |
STIL | 3867 | NM_001048166.1 | AR | |
ZNF335 | 4029 | NM_022095.4 | AR |
Informations about the disease
Genetically heterogeneous disorder of brain development with reduced head circumference at birth with no gross anomalies of brain architecture + variable degrees of intellectual impairment
- Alias: Microcephalia vera
- Alias: Microcephaly vera
- Alias: True microcephaly
- Allelic: Aplastic anemia (NBN)
- Allelic: Breast cancer, susceptibility to (PALB2)
- Allelic: Breast-ovarian cancer, familial, susceptibility to, 3 (RAD51C)
- Allelic: Intellectual disability [panelapp] (MCM7)
- Allelic: Leukemia, acute lymphoblastic (NBN)
- Allelic: Meier-Gorlin syndrome [panelapp] (MCM7)
- Allelic: Pancreatic cancer, susceptibility to, 3 (PALB2)
- Allelic: Seckel syndrome 4 (CENPJ)
- Allelic: Seckel syndrome 5 (CEP152)
- Ataxia-telangiectasia-like disorder 1 (MRE11)
- Baralle-Macken syndrome (COPB1)
- Bloom syndrome-like disorder [panelapp] (RMI1)
- Cerebrooculofacioskeletal syndrome 3 (ERCC5)
- Cornelia de Lange-like syndrome [MONDO:0016033] (BRD4)
- Developmental + epileptic encephalopathy 104 (ATP6V0A1)
- Developmental + epileptic encephalopathy 107 (NAPB)
- Developmental delay + microcephaly [panelapp] (HMGB1)
- Epilepsy, ID, microcephaly [panelapp] (ATP6V0C)
- Fanconi anemia, complementation group N (PALB2)
- Fanconi anemia, complementation group O (RAD51C)
- Global developm. delay, ID, seizures, white matter atrophy, corpus callosum + head abnormal (DROSHA)
- Intellectual developmental disorder, AR 73 (NAA20)
- Megalencephaly-polymicrogyria-polydactyly-hydrocephalus syndrome 3 (CCND2)
- Meier-Gorlin syndrome [MONDO:0016817] (GINS3)
- Meier-Gorlin syndrome like [panelapp] (GINS3)
- Microcephaly 1, primary, AR (MCPH1)
- Microcephaly 10, primary, AR (ZNF335)
- Microcephaly 11, primary, AR (PHC1)
- Microcephaly 12, primary, AR (CDK6)
- Microcephaly 13, primary, AR (CENPE)
- Microcephaly 14, primary, AR (SASS6)
- Microcephaly 2, primary, AR, with/-out cortical malformations (WDR62)
- Microcephaly 22, primary, AR (NCAPD3)
- Microcephaly 25, primary, AR (TRAPPC14)
- Microcephaly 28, primary, AR (RRP7A)
- Microcephaly 29, primary, AR (PDCD6IP)
- Microcephaly 3, primary, AR (CDK5RAP2)
- Microcephaly 4, primary, AR (KNL1)
- Microcephaly 5, primary, AR (ASPM)
- Microcephaly 6, primary, AR (CENPJ)
- Microcephaly 7, primary, AR (STIL)
- Microcephaly 8, primary, AR (CEP135)
- Microcephaly 9, primary, AR (CEP152)
- Microcephaly [panelapp] (MCM7)
- Microcephaly, postnatal progressive, with seizures + brain atrophy (MED17)
- Microcephaly, progressive, seizures + cerebral + cerebellar atrophy (QARS1)
- Microcephaly, short stature + impaired glucose metabolism 2 (PPP1R15B)
- Neurodevelopmental delay, postnat. microceph., failure to thrive, gastrointest. [panelapp] (ATP9A)
- Neurodevelopmental disorder with epilepsy + brain atrophy (ATP6V0A1)
- Neurodevelopmental disorder with microcephaly, ataxia + seizures (SARS1)
- Neurodevelopmental disorder with microcephaly, cerebral atrophy, visual impairment (DOHH)
- Neurodevelopmental disorder with microcephaly, hypotonia, nystagmus + seizures (CPSF3)
- Neurodevelopmental disorder with microcephaly, movement abnormalities + seizures (CHKA)
- Neurodevelopmental disorder with poor growth + skeletal anomalies (PCDHGC4)
- Neurodevelopmental disorder with seizures + brain atrophy (EXOC7)
- Neurodevelopmental disorder with spasticity, seizures + brain abnormalities (NSRP1)
- Nijmegen breakage syndrome (NBN)
- Nivelon-Nivelon-Mabille syndrome (HHAT)
- PEHO [Progr. Encephalop., edema, Hypsarrythm., Optic atrophy] syndrome-like (CCDC88A)
- Primordial dwarfism-immunodeficiency-lipodystrophy syndrome (PRIM1)
- Rauch-Steindl syndrome (NSD2)
- Short stature with microcephaly + distinctive facies (CRIPT)
- Short stature-micrognathia syndrome (ARCN1)
- Spastic paraplegia 47, AR (AP4B1)
- Spastic paraplegia 50, AR (AP4M1)
- Spastic paraplegia 52, AR (AP4S1)
- Trichothiodystrophy 4, nonphotosensitive (MPLKIP)
- Xeroderma pigmentosum, group G (ERCC5)
- Xeroderma pigmentosum, group G/Cockayne syndrome (ERCC5)
- AR
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatics and clinical interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboratory requirement
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.