IllnessMorbus Stargardt, differential diagnosis
Summary
Comprehensive differential diagnostic panel for Morbus Stargardt containing 3 guideline-curated genes, 9 core candidate genes and altogether 16 curated genes according to the clinical signs
34,8 kb (Extended panel: incl. additional genes)
- EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
NGS +
Gene panel
Selected genes
Name | Exon Length (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Heredity |
---|---|---|---|---|
ABCA4 | 6822 | NM_000350.3 | AR | |
BEST1 | 1758 | NM_004183.4 | AD, AR | |
CDH3 | 2490 | NM_001793.6 | AR | |
CNGB3 | 2430 | NM_019098.5 | AD, AR | |
ELOVL4 | 945 | NM_022726.4 | AD | |
IMPG1 | 2394 | NM_001563.4 | AD, AR | |
IMPG2 | 3726 | NM_016247.4 | AD, AR | |
PROM1 | 2598 | NM_006017.3 | AD | |
PRPH2 | 1041 | NM_000322.5 | AD, AR, digenisch | |
EFEMP1 | 1482 | NM_001039348.3 | AD | |
GUCA1B | 603 | NM_002098.6 | AD | |
RBP4 | 606 | NM_006744.4 | AR | |
RDH12 | 951 | NM_152443.3 | AR, AD | |
RPGR | 2448 | NM_000328.3 | XL | |
RPGRIP1 | 3861 | NM_020366.4 | AR | |
TIMP3 | 636 | NM_000362.5 | AD |
Informations about the disease
Stargardt disease is the most common, but only one of several genetic diseases that cause progressive macular degeneration with (sometimes undetected) loss of vision in childhood or adolescence, patients rarely go completely blind. In the more and more complex differential diagnosis, besides ABCA4 (Stargardt disease 1), ELOVL4 (Stargardt disease 3) and PROM1 (Stargardt disease 4) some other genes have to be included. The disease is usually inherited autosomal recessively, more rarely autosomal dominantly. The diagnostic yield reaches >70-80%. An inconspicuous genetic finding does not mean an exclusion of the suspected clinical diagnosis, especially since the differential diagnosis with (clinically closely) related macular degeneration syndromes can be very difficult.
Reference: https://www.orpha.net/data/patho/Han/Int/fr/MaladieDeStargardt_FR_fr_HAN_ORPHA827.pdf
- Alias: Stargardt-Erkrankung
- Allelic: Choroidal dystrophy, central areolar 2 (PRPH2)
- Allelic: Cone-rod dystrophy 12 (PROM1)
- Allelic: Cone-rod dystrophy, XL, 1 (RPGR)
- Allelic: Ichthyosis, spastic quadriplegia, and mental retardation (ELOVL4)
- Allelic: Leber congenital amaurosis 18 (PRPH2)
- Allelic: Leber congenital amaurosis 6 (RPGRIP1)
- Allelic: Macular dystrophy, patterned, 1 (PRPH2)
- Allelic: Macular dystrophy, retinal, 2 (PROM1)
- Allelic: Microcornea, rod-cone dystrophy, cataract, posterior staphyloma (BEST1)
- Allelic: Microphthalmia, isolated, with coloboma 10 (RBP4)
- Allelic: Retinitis pigmentosa 3 (RPGR)
- Allelic: Retinitis pigmentosa 41 (PROM1)
- Allelic: Retinitis pigmentosa 56 (IMPG2)
- Allelic: Retinitis pigmentosa 7 + digenic form (PRPH2)
- Allelic: Retinitis pigmentosa, XL, sinorespiratory infections, with/-out deafness (RPGR)
- Allelic: Retinitis pigmentosa, concentric (BEST1)
- Allelic: Retinitis pigmentosa-50 (BEST1)
- Allelic: Retinitis punctata albescens (PRPH2)
- Allelic: Spinocerebellar ataxia 34 (ELOVL4)
- Allelic: Vitreoretinochoroidopathy (BEST1)
- Achromatopsia 3 (CNGB3)
- Bestrophinopathy, AR (BEST1)
- Cone-rod dystrophy 13 (RPGRIP1)
- Doyne honeycomb degeneration of retina (EFEMP1)
- Ectodermal dysplasia, ectrodactyly, macular dystrophy (CDH3)
- Fundus flavimaculatus (ABCA4)
- Hypotrichosis, congenital, with juvenile macular dystrophy (CDH3)
- Leber congenital amaurosis 13 (RDH12)
- Macular degeneration, XL atrophic (RPGR)
- Macular dystrophy, vitelliform, 2 (BEST1)
- Macular dystrophy, vitelliform, 3 (PRPH2)
- Macular dystrophy, vitelliform, 4 (IMPG1)
- Macular dystrophy, vitelliform, 5 (IMPG2)
- Retinal dystrophy, early-onset severe (ABCA4)
- Retinal dystrophy, iris coloboma, comedogenic acne syndrome (RBP4)
- Retinitis pigmentosa 48 (GUCA1B)
- Sorsby fundus dystrophy (TIMP3)
- Stargardt disease 1; Macular degeneration, juvenile; Macular dystrophy with flecks, type 1 (ABCA4)
- Stargardt disease 3 (ELOVL4)
- Stargardt disease 4 (PROM1)
- AD
- AR
- XL
- digenisch
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatics and clinical interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboratory requirement
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.