IllnessOvarian insufficiency, primary; differential diagnosis
Summary
Comprehensive differential diagnostic panel for Ovarian insufficiency, primary, comprising 9 mostly guideline-curated core candidate genes and altogether 52 curated genes according to the clinical signs
The FSHR polymorphism p.Asn680Ser may be relevant with regard to dose calculation prior to ovarian stimulation and is therefore reported if explicitly requested. doi: 10.1007/s00129-021-04785-6
71,7 kb (Extended panel: incl. additional genes)
- EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
NGS +
[Sanger]
Gene panel
Selected genes
Name | Exon Length (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Heredity |
---|---|---|---|---|
FIGLA | 660 | NM_001004311.3 | AD | |
FOXL2 | 1131 | NM_023067.4 | AD | |
GALT | 1140 | NM_000155.4 | AR | |
HFM1 | 4308 | NM_001017975.6 | AR | |
MCM8 | 2523 | NM_032485.6 | AR | |
NOBOX | 2076 | NM_001080413.3 | AD | |
NR5A1 | 1386 | NM_004959.5 | AD | |
PGRMC1 | 588 | NM_006667.5 | XL | |
STAG3 | 3678 | NM_012447.4 | AR | |
AARS2 | 2958 | NM_020745.4 | AR | |
BMP15 | 1179 | NM_005448.2 | XL | |
BMPR1B | 1509 | NM_001203.3 | AD | |
CLPP | 834 | NM_006012.4 | AR | |
CYP17A1 | 1527 | NM_000102.4 | AR | |
CYP19A1 | 1512 | NM_031226.3 | AR | |
EIF2B4 | 1569 | NM_015636.4 | AD | |
EIF2B5 | 2166 | NM_003907.3 | AR | |
FANCM | 6147 | NM_020937.4 | AR | |
FMR1 | 1899 | NM_002024.6 | XL | |
FSHB | 390 | NM_000510.4 | AR | |
FSHR | 2088 | NM_000145.4 | AR | |
GDF9 | 1365 | NM_005260.6 | AD, AR | |
HARS2 | 1521 | NM_012208.4 | AR | |
LARS2 | 2712 | NM_015340.4 | AR | |
LMNA | 1995 | NM_170707.4 | AD | |
MCM9 | 3432 | NM_017696.3 | AR | |
MSH5 | 2505 | NM_002441.5 | AR | |
NANOS3 | 593 | NM_001098622.3 | AD | |
NOG | 699 | NM_005450.6 | AD | |
NUP107 | 2778 | NM_020401.4 | AR | |
PMM2 | 741 | NM_000303.3 | AR | |
POF1B | 1770 | NM_024921.4 | XLR | |
POLG | 3720 | NM_002693.3 | AD, AR | |
POU5F1 | 1083 | NM_002701.6 | AD | |
PSMC3IP | 654 | NM_016556.4 | AR | |
RCBTB1 | 1596 | NM_018191.4 | AR | |
SOHLH1 | 1164 | NM_001101677.2 | AR | |
TWNK | 2055 | NM_021830.5 | AR |
Informations about the disease
Premature ovarian insufficiency (POI) refers to the loss of ovarian activity before the age of 40. POI is characterised by menstrual disorders (amenorrhoea, oligomenorrhoea) with increased gonadotropins and low estradiol levels. In addition to genetic causes, autoimmune, infectious, iatrogenic and environmental causes are known. 10-12% of women with POI show chromosomal abnormalities, mostly (94%) X-linked chromosomal disorders. FMR1 premutations are probably responsible for about 5% of all POI cases. Mutations of individual genes are much rarer.
The FSHR polymorphism p.Asn680Ser may be relevant with regard to dose calculation prior to ovarian stimulation and is therefore reported if explicitly requested. doi: 10.1007/s00129-021-04785-6
- Alias: (Genetic) non-acquired ovarian insufficiency
- Alias: 46XX pure gonadal dysgenesis; 46XX complete gonadal dysgenesis; XX female gonadal dysgenesis
- Alias: Hypergonadotropic ovarian dysgenesis
- Alias: Primary ovarian insufficiency
- Allelic: 46XX sex reversal 4 (NR5A1)
- Allelic: 46XY sex reversal 3 (NR5A1)
- Allelic: Adrenocortical insufficiency (NR5A1)
- Allelic: Blepharophimosis, epicanthus inversus + ptosis, type 1-2 (FOXL2)
- Allelic: D-bifunctional protein deficiency (HSD17B4)
- Allelic: Leukoencephalopathy with vanishing white matter (EIF2B4, EIF2B5)
- Allelic: Mosaic variegated aneuploidy syndrome 1 (BUB1)
- Allelic: Ovarian hyperstimulation syndrome (FSHR)
- Allelic: Ovarian response to FSH stimulation (FSHR)
- Allelic: Spermatogenic failure 52 (C14orf39)
- Allelic: Spermatogenic failure 8 (NR5A1)
- Adrenal hyperplasia, congenital, due to 21-hydroxylase deficiency (CYP21A2)
- Allelic: Spermatogenic failure 15 (SYCE1)
- Autoimmune polyendocrinopathy syndrome, type I, with/-out reversible metaphyseal dysplasia (AIRE)
- FSH-RO Follicular stimulating hormone-resistant ovaries
- Hyperandrogenism, nonclassic type, due to 21-hydroxylase deficiency (CYP21A2)
- Hypogonadotropic hypogonadism 24 without anosmia (FSHB)
- Leukoencephalopathy, progressive, with ovarian failure (AARS2)
- Malouf syndrome (LMNA)
- Muscular dystrophy, congenital hearing loss + ovarian insufficiency syndrome (GGPS1)
- Ovarian dysgenesis 1 (FSHR)
- Ovarian dysgenesis 2 (BMP15)
- Ovarian dysgenesis 3 (PSMC3IP)
- Ovarian dysgenesis 6 (NUP107)
- Ovarian dysgenesis 7 (MRPS22)
- Ovarian dysgenesis 8 (ESR2)
- Ovarioleukodystrophy (EIF2B4, EIF2B5)
- Perrault syndrome 1 (HSD17B4)
- Perrault syndrome 2 (HARS2)
- Perrault syndrome 3 (CLPP)
- Perrault syndrome 4 (LARS2)
- Perrault syndrome 5 (TWNK)
- Perrault syndrome 6 (ERAL1)
- Perrault syndrome [panelapp] (SGO2)
- Premature chromatid separation trait (BUB1)
- Premature ovarian failure 10 (MCM8)
- Premature ovarian failure 11 (ERCC6)
- Premature ovarian failure 12 (SYCE1)
- Premature ovarian failure 13 (MSH5)
- Premature ovarian failure 14 (GDF9)
- Premature ovarian failure 15 (FANCM)
- Premature ovarian failure 18 (C14orf39)
- Premature ovarian failure 2A (DIAPH2)
- Premature ovarian failure 2B (POF1B)
- Premature ovarian failure 3 (FOXL2)
- Premature ovarian failure 4 (BMP15)
- Premature ovarian failure 5 (NOBOX)
- Premature ovarian failure 6 (FIGLA)
- Premature ovarian failure 7 (NR5A1)
- Premature ovarian failure 8 (STAG3)
- Premature ovarian failure 9 (HFM1)
- Premature ovarian failure [panelapp] (KHDRBS1)
- Premature ovarian insufficiency [panelapp] (DACH2)
- Premature ovarian insufficiency [panelapp] (EIF4ENIF1)
- Premature ovarian insufficiency [panelapp] (PGRMC1)
- Premature ovarian insufficiency [panelapp] (POLR2C)
- Premature ovarian insufficiency [panelapp] (POLR3H)
- Premature ovarian insufficiency [panelapp] (SYCP2L)
- Primary ovarian failure [MONDO:0005387] (MSH4)
- Primary ovarian insufficiency [panelapp] (NANOS3)
- Primary ovarian insufficiency [panelapp] (SOHLH2)
- Retinal dystrophy with/-out extraocular anomalies (RCBTB1)
- AD
- AR
- XL
- XLR
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatics and clinical interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboratory requirement
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.