IllnessOvergrowth syndromes, differential diagnosis
Summary
Comprehensive differential diagnostic panel for overgrowth syndromes containing 1 guideline-curated gene, 6 additional and altogether 23 curated genes according to the clinical signs
47,3 kb (Extended panel: incl. additional genes)
- EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
NGS +
[Sanger]
Gene panel
Selected genes
Name | Exon Length (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Heredity |
---|---|---|---|---|
CDKN1C | 951 | NM_000076.2 | AD | |
DNMT3A | 2739 | NM_175629.2 | AD | |
EZH2 | 2256 | NM_004456.5 | AD | |
GPC3 | 1743 | NM_004484.4 | XLR | |
NFIX | 1533 | NM_001271043.2 | AD | |
NSD1 | 8091 | NM_022455.5 | AD | |
OFD1 | 3039 | NM_003611.3 | XL | |
AKT3 | 1440 | NM_005465.7 | AD | |
DIS3L2 | 2658 | NM_152383.5 | AR | |
EED | 2100 | NM_003797.5 | AD | |
FBN1 | 8616 | NM_000138.5 | AD | |
MTOR | 7650 | NM_004958.4 | AD | |
PIK3CA | 3207 | NM_006218.4 | AD | |
PTEN | 1212 | NM_000314.8 | AD |
Informations about the disease
Over-growth syndromes form a group of rare congenital diseases with the main characteristic of a circumscribed (segmental) or complete pathological growth that can be detected during pregnancy, shortly after birth or in the first years of life. High growth is defined as a body length/height above the 97th percentile. High growth can either be a norm variant ("constitutional high growth" or "familial high growth") or have a pathological cause. Pathological macrosomia is usually syndromal. There is a high degree of phenotypic overlap between the syndromes in question.
Reference: https://www.nature.com/articles/s41574-019-0180-z
- Alias: Tall stature, overgrowth syndrome
- Allelic: Acromicric dysplasia (FBN1)
- Allelic: Acute myeloid leukemia, somatic (DNMT3A)
- Allelic: Autism, susceptibility to, 18 (CHD8)
- Allelic: Basal ganglia calcification, idiopathic, 4 (PDGFRB)
- Allelic: Breast cancer, somatic (PIK3CA)
- Allelic: CLAPO syndrome, somatic (PIK3CA)
- Allelic: CLOVE syndrome, somatic (PIK3CA)
- Allelic: Colorectal cancer, somatic (PIK3CA)
- Allelic: Cowden syndrome 1 (PTEN)
- Allelic: Diabetes mellitus, type II (AKT2)
- Allelic: Ectopia lentis, familial (FBN1)
- Allelic: Focal cortical dysplasia, type II, somatic (MTOR)
- Allelic: Gastric cancer, somatic (PIK3CA)
- Allelic: Geleophysic dysplasia 2 (FBN1)
- Allelic: Hepatocellular carcinoma, somatic (PIK3CA)
- Allelic: Heyn-Sproul-Jackson (DNMT3A)
- Allelic: Joubert syndrome 10 (OFD1)
- Allelic: Keratosis, seborrheic, somatic (PIK3CA)
- Allelic: Lhermitte-Duclos syndrome (PTEN)
- Allelic: Macrodactyly, somatic (PIK3CA)
- Allelic: Megalencephaly-capillary malformation-polymicrogyria syndrome, somatic (PIK3CA)
- Allelic: Myeloproliferative disorder with eosinophilia (PDGFRB)
- Allelic: Myofibromatosis, infantile, 1 (PDGFRB)
- Allelic: Nevus, epidermal, somatic (PIK3CA)
- Allelic: Nonsmall cell lung cancer, somatic (PIK3CA)
- Allelic: Orofaciodigital syndrome I (OFD1)
- Allelic: Ovarian cancer, somatic (PIK3CA)
- Allelic: Premature aging syndrome, Penttinen type (PGFRB)
- Allelic: Premature ovarian failure 1 (FMR1_CGG)
- Allelic: Retinitis pigmentosa 23 (OFD1)
- Allelic: Schizophrenia 15 (SHANK3)
- Allelic: Stiff skin syndrome (FBN1)
- Allelic: Weill-Marchesani syndrome 2, dominant (FBN1)
- Allelic: Wilms tumor, somatic (GPC3)
- Beckwith-Wiedemann syndrome, IMAGE syndrome (CDKN1C)
- Cohen-Gibson syndrome (EED)
- Cowden syndrome 5 (PIK3CA)
- Fragile X syndrome (FMR1_CGG)
- Fragile X tremor/ataxia syndrome (FMR1_CGG)
- Hypoinsulinemic hypoglycemia with hemihypertrophy (AKT2)
- Imagawa-Matsumoto syndrome (SUZ12)
- Intellectual developmental disorder, AD 23 (SETD5)
- Intellectual developmental disorder, XL 93 (BRWD3)
- Kosaki overgrowth syndrome (PDGFRB)
- Luscan-Lumish syndrome (SETD2)
- MASS syndrome (FBN1)
- Macrocephaly, acquired, with impaired intellectual development (NFIB)
- Macrocephaly/autism syndrome (PTEN)
- Malan syndrome (NFIX)
- Marfan lipodystrophy syndrome (FBN1)
- Marfan syndrome (FBN1)
- Marshall-Smith syndrome (NFIX)
- Megalencephaly-polymicrogyria-polydactyly-hydrocephalus syndrome 2 (AKT3)
- Perlman syndrome (DIS3L2)
- Phelan-McDermid syndrome (SHANK3)
- Rahman syndrome (H1-4 syn. HIST1H1E)
- Shashi-Pena syndrome (ASXL2)
- Simpson-Golabi-Behmel syndrome (GPC3)
- Simpson-Golabi-Behmel syndrome, type 2 (OFD1)
- Smith-Kingsmore syndrome (MTOR)
- Sotos syndrome 1 (NSD1)
- Sotos syndrome 2 (NFIX)
- Tatton-Brown-Rahman syndrome (DNMT3A)
- Tenorio syndrome (RNF125)
- Thauvin-Robinet-Faivre syndrome (FIBP)
- Weaver syndrome (EZH2)
- AD
- AR
- XL
- XLR
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatics and clinical interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboratory requirement
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.