IllnessPolycystic kidney disease, ADPKD; differential diagnosis
Summary
Comprehensive differential diagnostic panel for Polycystic kidney disease, ADPKD, comprising 8 guideline-curated and altogether 26 curated genes according to the clinical signs
52,3 kb (Extended panel: incl. additional genes)
- EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
NGS +
[Sanger]
Gene panel
Selected genes
Name | Exon Length (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Heredity |
---|---|---|---|---|
GANAB | 2900 | NM_198335.4 | AD | |
HNF1B | 1674 | NM_000458.4 | AD | |
PKD1 | 12912 | NM_001009944.3 | AD, AR | |
PKD2 | 2907 | NM_000297.4 | AD | |
COL4A1 | 5010 | NM_001845.6 | AD | |
DNAJB11 | 1250 | NM_016306.6 | AD | |
LRP5 | 4848 | NM_002335.4 | AD | |
MUC1 | 822 | NM_002456.6 | AD | |
PRKCSH | 1587 | NM_002743.3 | AD | |
SEC61A1 | 623 | NM_013336.4 | AD | |
SEC63 | 2283 | NM_007214.5 | AD | |
TSC1 | 3495 | NM_000368.5 | AD | |
TSC2 | 5424 | NM_000548.5 | AD | |
TTC21B | 3951 | NM_024753.5 | AD, AR | |
UMOD | 1923 | NM_003361.4 | AD | |
VHL | 642 | NM_000551.4 | AD |
Informations about the disease
Kidney cysts can be clinically insignificant but can also lead to early end-stage renal failure. The cystic kidney is a disease that is diagnosed on the basis of kidney size and cyst localisation, and possibly by extra-renal symptoms. Cystic kidney disease (CKD) can also be associated with extra-renal symptoms in multisystemic diseases, such as tuberous sclerosis and von Hippel-Lindau syndrome. Causal pathogenetic differentiation must also be made between glomerulocystic and medullary forms of CKD and juvenile nephronophthisis. CKDs therefore have very different causes, hereditary, systemic or rarely acquired and can develop in children and adults. Inherited CKDs are often autosomal dominant (ADPKD) or more rarely autosomal recessive CKDs (ARPKD), each with variable expressivity and penetrance. In over 90% of familial CDKs, the genetic causes can currently be clarified by molecular genetics. However, an inconspicuous genetic finding does not mean that the clinically suspected diagnosis of CKD can be excluded.
References: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1246/https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1326/https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1356/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK368475/https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK153723/
- Alias: Autosomal dominant polycystic kidney disea
- Alias: Autosomal dominante polyzystische Nierenerkrankung
- Alias: Familial cystic renal disease
- Alias: Nierenkrankheit, polyzystische, autosomal-dominante
- Alias: Polycystic kidney disease
- Alias: Polyzystische Nierenerkrankungen
- Alias: Renal cysts
- Allelic: Brain small vessel disease with/-out ocular anomalies (COL4A1)
- Allelic: Diabetes mellitus, noninsulin-dependent (HNF1B)
- Allelic: Dyskeratosis congenita, AR 4 (TERT)
- Allelic: Dyskeratosis congenita, AR 5 (RTEL1)
- Allelic: Erythrocytosis, familial, 2 (VHL)
- Allelic: Exudative vitreoretinopathy 4 (LRP5)
- Allelic: Focal cortical dysplasia, type II, somatic (TSC1)
- Allelic: Focal cortical dysplasia, type II, somatic (TSC2)
- Allelic: Hemangioblastoma, cerebellar, somatic (VHL)
- Allelic: Hemorrhage, intracerebral, susceptibility to (COL4A1)
- Allelic: Hyperostosis, endosteal (LRP5)
- Allelic: Hyperuricemic nephropathy, familial juvenile 1 (UMOD)
- Allelic: Leukemia, acute myeloid (TERT)
- Allelic: Lymphangioleiomyomatosis (TSC1)
- Allelic: Lymphangioleiomyomatosis, somatic (TSC2)
- Allelic: Melanoma, cutaneous malignant, 9 (TERT)
- Allelic: Microangiopathy + leukoencephalopathy, pontine, AD (COL4A1)
- Allelic: Osteopetrosis, AD 1 (LRP5)
- Allelic: Osteoporosis (LRP5)
- Allelic: Osteoporosis-pseudoglioma syndrome (LRP5)
- Allelic: Osteosclerosis (LRP5)
- Allelic: Pheochromocytoma (VHL)
- Allelic: Renal cell carcinoma (HNF1B)
- Allelic: Renal cell carcinoma, somatic (VHL)
- Allelic: Retinal arteries, tortuosity of (COL4A1)
- Allelic: Short-rib thoracic dysplasia 4 with/-out polydactyly (TTC21B)
- Allelic: van Buchem disease, type 2 (LRP5)
- Allelic: von Hippel-Lindau syndrome (VHL)
- Alagille syndrome 2 (NOTCH2)
- Angiopathy, hereditary, with nephropathy, aneurysms + muscle cramps (COL4A1)
- Anterior segment anomalies with/-out cataract (EYA1)
- Birt-Hogg-Dube syndrome (FLCN)
- Bone mineral density variability 1 (LRP5
- Branchiootic syndrome 1 (EYA1)
- Branchiootorenal syndrome 1, with/-out cataracts (EYA1)
- Congenital disorder of glycosylation, type Ih (ALG8)
- Congenital disorder of glycosylation, type Il (ALG9)
- Dyskeratosis congenita, AD 2 (TERT)
- Dyskeratosis congenita, AD 4 (RTEL1)
- Focal cortical dysplasia, type II, somatic (TSC1)
- Gillessen-Kaesbach-Nishimura syndrome (ALG9)
- Glomerulocystic kidney disease with hyperuricemia + isosthenuria (UMOD)
- Hajdu-Cheney syndrome (NOTCH2)
- Medullary cystic kidney disease 1 (MUC1)
- Medullary cystic kidney disease 2 (UMOD)
- Microphthalmia, syndromic 6 (BMP4)
- Nephronophthisis 12 (TTC21B)
- Orofacial cleft 11 (BMP4)
- Otofaciocervical syndrome (EYA1)
- Pneumothorax, primary spontaneous (FLCN)
- Polycystic kidney disease 1 (PKD1)
- Polycystic kidney disease 2 (PKD2)
- Polycystic kidney disease 3 (GANAB)
- Polycystic kidney disease 6 with/-out polycystic liver disease (DNAJB11)
- Polycystic liver disease 1 (PRKCSH)
- Polycystic liver disease 2 (SEC23)
- Polycystic liver disease 3 with/-out kidney cysts (ALG8)
- Polycystic liver disease 4 with/-out kidney cysts (LRP5)
- Pulmonary fibrosis and/or bone marrow failure, telomere-related, 1 (TERT)
- Pulmonary fibrosis and/or bone marrow failure, telomere-related, 3 (RTEL1)
- Renal cysts + diabetes syndrome (HNF1B)
- Townes-Brocks branchiootorenal-like syndrome (SALL1)
- Townes-Brocks syndrome 1 (SALL1)
- Tuberous sclerosis-1 (TSC1)
- Tuberous sclerosis-2 (TSC2)
- Tubulointerstitial kidney disease, AD, 5 (SEC61A1)
- Vesicoureteral reflux 2 (ROBO2)
- AD
- AR
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatics and clinical interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboratory requirement
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.