IllnessStickler syndrome, differential diagnosis I
Summary
Comprehensive differential diagnostic panel for Stickler syndrome comprising 3 guideline-curated genes and altogether 11 curated genes according to the clinical signs
41,7 kb (Extended panel: incl. additional genes)
- EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
NGS +
Gene panel
Selected genes
Name | Exon Length (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Heredity |
---|---|---|---|---|
COL11A1 | 5421 | NM_001854.4 | AD | |
COL11A2 | 5211 | NM_080680.3 | AD | |
COL2A1 | 4464 | NM_001844.5 | AD | |
COL9A1 | 2766 | NM_001851.6 | AR | |
COL9A2 | 2070 | NM_001852.4 | AR | |
COL9A3 | 2055 | NM_001853.4 | AR | |
BMP4 | 1227 | NM_001202.6 | AD | |
GZF1 | 2136 | NM_022482.5 | AR | |
LOXL3 | 2283 | NM_032603.5 | AR | |
LRP2 | 13968 | NM_004525.3 | AR |
Informations about the disease
Stickler syndrome is a hereditary vitreoretinopathy in which the ocular symptomatology is associated with a more or less severe Pierre-Robin sequence, bone abnormalities, and (in 10% of cases) sensorineural hearing loss. Ocular symptoms include juvenile cataract, myopia, strabismus, vitreoretinal or chorioretinal degeneration, retinal detachment and chronic uveitis. Hyperextensibility of the joints in youth is followed early by arthritic changes. Mild platyspondyly, scoliosis and enlarged, often abnormal epiphyses are observed. Stickler syndrome is inherited in an autosomal dominant or rarely autosomal recessive manner and is genetically heterogeneous. Mutations are identified in the COL2A1, COL11A1, COL11A2, COL9A1, COL9A2 and COL9A3 genes - the panel includes all of these genes. DNA tests are used for differential diagnosis and thus for genetic counseling of the index person and relatives. The diagnostic yield of the panel amounts to 90% (80-90% of the cases harbor COL2A1 mutations, 10-20% COL11A1 mutations). Additional genes are rarely associated with the disease. A negative molecular genetic finding does not definitely exclude the clinical diagnosis.
References: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1302/
https://doi.org/10.3390/jpm10030105
- Alias: Arthroophthalmopathy
- Alias: Hereditary progressive arthroophthalmopathy
- Allelic: Czech dysplasia (COL2A1)
- Allelic: Deafness, AD 13 (COL11A2)
- Allelic: Deafness, AD 37 (COL11A1)
- Allelic: Deafness, AR 53 (COL11A2)
- Allelic: Epiphyseal dysplasia, multiple, 2 (COL9A2)
- Allelic: Epiphyseal dysplasia, multiple, 3, with/-out myopathy (COL9A3)
- Allelic: Epiphyseal dysplasia, multiple, 6 (COL9A1)
- Allelic: Epiphyseal dysplasia, multiple, with myopia + deafness (COL2A1)
- Allelic: Fibrochondrogenesis 1 (COL11A1)
- Allelic: Fibrochondrogenesis 2 (COL11A2)
- Allelic: Kniest dysplasia (COL2A1)
- Allelic: Leber congenital amaurosis 16 (KCNJ13)
- Allelic: Legg-Calve-Perthes disease (COL2A1)
- Allelic: Lumbar disc herniation, susceptibility to (COL11A1)
- Allelic: Marshall syndrome (COL11A1)
- Allelic: Orofacial cleft 11 (BMP4)
- Allelic: Osteoarthritis with mild chondrodysplasia (COL2A1)
- Allelic: Otospondylomegaepiphyseal dysplasia, AR (COL11A2)
- Allelic: Platyspondylic skeletal dysplasia, Torrance type (COL2A1)
- Allelic: Spondyloepimetaphyseal dysplasia Strudwick type (COL2A1)
- Allelic: Spondyloepiphyseal dysplasia congenita (COL2A1)
- Allelic: Spondyloepiphyseal dysplasia, Stanescu type (COL2A1)
- Allelic: Spondyloperipheral dysplasia (COL2A1)
- Allelic: Vitreoretinopathy with phalangeal epiphyseal dysplasia (COL2A1)
- Donnai-Barrow syndrome (LRP2)
- Joint laxity, short stature + myopia (GZF1)
- Microphthalmia, syndromic 6 (BMP4)
- Persistent hyperplastic primary vitreous, AR (ATOH7)
- Snowflake vitreoretinal degeneration (KCNJ13)
- Stickler sydrome, type I, nonsyndromic ocular (COL2A1)
- Stickler syndrome [MONDO:0019354] (LOXL3)
- Stickler syndrome, type I (COL2A1)
- Stickler syndrome, type II (COL11A1)
- Stickler syndrome, type III [Otospondylomegaepiphyseal dysplasia, AD] (COL11A2)
- Stickler syndrome, type IV (COL9A1)
- Stickler syndrome, type V (COL9A2)
- Stickler syndrome, type VI (COL9A3)
- Wagner vitreoretinopathy/syndrome 1 (VCAN)
- AD
- AR
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatics and clinical interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboratory requirement
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.