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Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
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IllnessThyroid hormone receptor deficiency, differential diagnosis

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for Thyroid hormone receptor deficiency containing 2 guideline-curated core genes and altogether 25 curated genes according to the clinical signs

ID
SP0560
Number of genes
14 Accredited laboratory test
Examined sequence length
8,1 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
29,9 kb (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Test material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

[Sanger]

 

Gene panel

Selected genes

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
SECISBP22565NM_024077.5AR
SLC16A21620NM_006517.5XLR
THRA1233NM_199334.5AD
THRB1386NM_000461.5AD, AR
TRHR1197NM_003301.7AR
CHD78994NM_017780.4AD
FGF8735NM_033163.5AD, AR
FGFR12469NM_023110.3AD
LEPR3498NM_002303.6AR
POU1F1876NM_000306.4AD, AR
PRKAR1A1146NM_002734.5AD
PROKR21155NM_144773.4n.k.
PROP1681NM_006261.5AR
TSHR2295NM_000369.5AR, AD

Informations about the disease

Clinical Comment

Congenital hypothyroidism is a loss of thyroid function with either lower hormone levels or, in rare cases, resistance to these hormones. In up to 85% of cases the thyroid gland is absent, i.e. there is thyroid dysgenesis. In the remaining cases, thyroid hormones or their effect(s) are missing. Thyroid dyshormonogenesis and central (or pituitary) hypothyroidism also lead to congenital hypothyroidism due to a lack of thyroid hormone function. Affected babies are asymptomatic or less active and sleep more, have feeding problems and suffer from constipation. If left untreated, congenital, non-goitous hypothyroidism can lead to mental retardation and slow growth. Thyroid hormone resistance can be inherited autosomal dominantly, recessively or X-linked, each with variable expressivity. The diagnostic yield is largely unknown, as it depends in particular on the clinical findings.

Reference: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK26373/

 

Synonyms
  • Alias: Refetoff syndrome
  • Alias: Resistance to thyroid hormone beta
  • Alias: Resistance to thyroid hormone due to mutation in thyroid hormone receptor beta
  • Alias: Thyroid hormone receptor deficiency, beta
  • Allelic: AD hyperinsul., hypopituit., craniofacial/endoderm-derived abnorm. [panelapp] (FOXA2)
  • Allelic: Adrenocortical tumor, somatic (PRKAR1A)
  • Allelic: Amyloidosis, hereditary, transthyretin-related (TTR)
  • Allelic: Analbuminemia (ALB)
  • Allelic: Carney complex, type 1 (PRKAR1A)
  • Allelic: Carpal tunnel syndrome, familial (TTR)
  • Allelic: Congenital hyperinsulinism [panelapp] (FOXA2)
  • Allelic: Hyperthyroidism, familial gestational (TSHR)
  • Allelic: Hyperthyroidism, nonautoimmune (TSHR)
  • Allelic: Intellectual developmental disorder, XL, with isolated growth hormone deficiency (SOX3)
  • Allelic: Jackson-Weiss syndrome (FGFR1)
  • Allelic: Myxoma, intracardiac (PRKAR1A)
  • Allelic: Osteoglophonic dysplasia (FGFR1)
  • Allelic: Pfeiffer syndrome (FGFR1)
  • Allelic: Pigmented nodular adrenocortical disease, primary, 1 (PRKAR1A)
  • Allelic: Thyroid adenoma, hyperfunctioning, somatic (TSHR)
  • Allelic: Thyroid carcinoma with thyrotoxicosis (TSHR)
  • Allelic: Trigonocephaly 1 (FGFR1)
  • Acrodysostosis 1, with or without hormone resistance (PRKAR1A)
  • Allan-Herndon-Dudley syndrome (SLC16A2)
  • CHARGE syndrome (CHD7)
  • Congenital hypopituitarism [panelapp] (FOXA2)
  • Dysalbuminemic hyperthyroxinemia (ALB)
  • Dysalbuminemic hypertriiodothyroninemia (ALB)
  • Dystransthyretinemic hyperthyroxinemia (TTR)
  • Growth hormone deficiency with pituitary anomalies (HESX1)
  • Hartsfield syndrome (FGFR1)
  • Hypogonadotropic hypogonadism 2 with/-out anosmia (FGFR1)
  • Hypogonadotropic hypogonadism 3 with/-out anosmia (PROKR2)
  • Hypogonadotropic hypogonadism 5 with/-out anosmia (CHD7)
  • Hypogonadotropic hypogonadism 6 with/-out anosmia (FGF8)
  • Hypothyroidism, central + testicular enlargement (IGSF1)
  • Hypothyroidism, congenital, nongoitrous, 1 (TSHR)
  • Hypothyroidism, congenital, nongoitrous, 4 (TSHB)
  • Hypothyroidism, congenital, nongoitrous, 6 (THRA)
  • Hypothyroidism, congenital, nongoitrous, 7 (TRHR)
  • Hypothyroidism, congenital, nongoitrous, 8 (TBL1X)
  • Immunodeficiency, common variable, 10 (NFKB2)
  • Microphthalmia, syndromic 3 (SOX2)
  • Microphthalmia, syndromic 5 (OTX2)
  • Obesity, morbid, due to leptin receptor deficiency (LEPR)
  • Optic nerve hypoplasia + abnormalities of the central nervous system (SOX2)
  • Panhypopituitarism, XL (SOX3)
  • Pituitary hormone deficiency, combined or isolated, 1 (POU1F1)
  • Pituitary hormone deficiency, combined, 2 (PROP1)
  • Pituitary hormone deficiency, combined, 3 (LHX3)
  • Pituitary hormone deficiency, combined, 4 (LHX4)
  • Pituitary hormone deficiency, combined, 5 (HESX1)
  • Pituitary hormone deficiency, combined, 6 (OTX2)
  • Retinal dystrophy, early-onset, with/-out pituitary dysfunction (OTX2)
  • Septooptic dysplasia (HESX1)
  • Thyroid hormone metabolism, abnormal (SECISBP2)
  • Thyroid hormone resistance (THRB)
  • Thyroid hormone resistance, AR (THRB)
  • Thyroid hormone resistance, selective pituitary (THRB)
  • obsolete designation: Deafness-thyroid hormone resistance syndrome (THRB)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
  • XLR
  • n.k.
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.