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Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
Know how in the analysis of genetic material.
For the benefit of patients.

IllnessAdipositas, severe, pure, early onset; differential diagnosis

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for monogenic adipositas comprising 5 core candidate genes and/or altogether 18 curated genes according to the clinical signs

ID
AP0150
Number of genes
12 Accredited laboratory test
Examined sequence length
8,1 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
22,7 kb (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Test material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

 

Gene panel

Selected genes

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
LEP504NM_000230.3AR
LEPR3498NM_002303.6AR
MC4R999NM_005912.3AD, AR
PCSK12262NM_000439.5AR
POMC804NM_001035256.3AR, Sus, AD
CEP19492NM_032898.5AR
MC3R972NM_019888.3n.k.
MYT1L3555NM_015025.4AD
NTRK22517NM_006180.6AD
SEZ6L22523NM_001114099.3n.k.
SH2B12271NM_001145795.2AD
SIM12301NM_005068.3AD

Informations about the disease

Clinical Comment

Obesity is usually multifactorial. In rare cases it is caused by mutations in one of the genes involved in controlling hunger and satiety. This is usually early onset obesity (EOO; BMI increased by two or more standard deviations at the age of 5 years). The most common of the individual gene alterations affect the MC4R gene more rarely the leptin receptor gene (LEPR) and the LEP gene resulting in a congenital leptin deficiency, which manifests itself as intense hyperphagia, EOO and severe obesity in conjunction with hormonal and metabolic changes. The inheritance is autosomal recessive, the penetrance is not known in only a few more than100 mutation carriers.

Reference: https://www.nature.com/articles/s41576-021-00414-z

 

Synonyms
  • Allelic: ACTH-independent macronodular adrenal hyperplasia (GNAS)
  • Allelic: Epileptic encephalopathy, early infantile, 58 (NTRK2)
  • Allelic: McCune-Albright syndrome, somatic, mosaic (GNAS)
  • Allelic: Mental retardation, AD 39 (MYT1L)
  • Allelic: Osseous heteroplasia, progressive (GNAS)
  • Allelic: Pituitary adenoma 3, multiple types, somatic (GNAS)
  • Allelic: Pseudohypoparathyroidism Ia (GNAS)
  • Allelic: Pseudohypoparathyroidism Ib (GNAS)
  • Allelic: Pseudohypoparathyroidism Ic (GNAS)
  • Allelic: Pseudopseudohypoparathyroidism (GNAS)
  • Abdominal obesity-metabolic syndrome 3 (DYRK1B)
  • BDV syndrome - Blakemore-Durmaz-Vasileiou syndrome (CPE)
  • Borjeson-Forssman-Lehmann syndrome (PHF6)
  • Chung-Jansen syndrome: developm. delay, impaired ID/learning, behavior, dysmorphism, obesity (PHIP)
  • Cohen syndrome (VPS13B)
  • Congenital obesity [panelapp] (SIM1)
  • Joubert syndrome 1 (INPP5E)
  • Mental retardation, truncal obesity, retinal dystrophy + micropenis (INPP5E)
  • Morbid obesity + spermatogenic failure (CEP19)
  • Neurodevelopmental disorder [panelapp] (PGM2L1)
  • Obesity [panelapp] (KSR2)
  • Obesity with impaired prohormone processing (PCSK1)
  • Obesity, BMIQ20 (MC4R)
  • Obesity, adrenal insufficiency, red hair due to POMC deficiency (POMC)
  • Obesity, congenital (GNAS)
  • Obesity, early-onset, susceptibility to (POMC)
  • Obesity, hyperphagia + developmental delay (NTRK2)
  • Obesity, mental retardation, AD 39 (MYT1L)
  • Obesity, morbid, due to leptin deficiency (LEP)
  • Obesity, morbid, due to leptin receptor deficiency (LEPR)
  • Obesity, resistance to; BMIQ20 (MC4R)
  • Obesity, severe (SIM1)
  • Obesity, severe, susceptibility to, BMIQ9 (MC3R)
  • Obesity, susceptibility to, BMIQ12 (PCSK1)
  • Obesity, susceptibility to, BMIQ18 (MRAP2)
  • Obesity, susceptibility to, BMIQ19 (ADCY3)
  • Obesity, susceptibility to, BMIQ4 (UCP2)
  • Retinal dystrophy + obesity (TUB)
  • Severe early-onset obesity-insulin resistance syndrome due to SH2B1 defic. [MONDO:0017994] (SH2B1)
  • Truncal obesity developing in mid-childhood (VPS13B)
  • WAGRO s. [Wilms tumor, Aniridia, Genitourin. anom., ment. Retard., Obes.] (11p13-p12/BDNF deletion)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
  • Sus
  • n.k.
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.