Klinische FragestellungAdipositas, schwer, pur, früh; Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Umfassendes differentialdiagnostisches panel für monogen bedingte, pure Adipositas mit 5 "core candidate"-Genen bzw. insgesamt 18 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose
22,7 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- EDTA-Blut (3-5 ml)
NGS +
[Sanger]
Genpanel
Ausgewählte Gene
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
LEP | 504 | NM_000230.3 | AR | |
LEPR | 3498 | NM_002303.6 | AR | |
MC4R | 999 | NM_005912.3 | AD, AR | |
PCSK1 | 2262 | NM_000439.5 | AR | |
POMC | 804 | NM_001035256.3 | AR, Sus, AD | |
CEP19 | 492 | NM_032898.5 | AR | |
MC3R | 972 | NM_019888.3 | n.k. | |
MYT1L | 3555 | NM_015025.4 | AD | |
NTRK2 | 2517 | NM_006180.6 | AD | |
SEZ6L2 | 2523 | NM_001114099.3 | n.k. | |
SH2B1 | 2271 | NM_001145795.2 | AD | |
SIM1 | 2301 | NM_005068.3 | AD |
Infos zur Erkrankung
Adipositas ist in der Regel multifaktoriell bedingt. Neben nachteiligen Ernährungsgewohnheiten und zu wenig körperlicher Aktivität, können in seltenen Fällen auch Mutationen in einem der Gene ursächlich sein, die an der Kontrolle von Hunger und Sättigung beteiligt sind. Es handelt sich dann in der Regel um eine früh einsetzende Adipositas (early onset obesity, EOO, BMI im Alter von 5 Jahren um 2 oder mehr Standardabweichungen erhöht). Die häufigsten der einzelnen Genveränderungen betreffen das MC4R-Gen, seltener das Leptinrezeptor-Gen (LEPR), das LEP-Gen, was zu einem angeborenen Leptinmangel führt, der sich als intensive Hyperphagie, EOO und schwere Adipositas in Verbindung mit hormonellen und metabolischen Veränderungen äußert. Erbgang ist zumeist autosomal rezessiv, selten dominant (MC4R), die Penetranz ist bei nur wenig mhr als 100 Mutationsträgern nicht genau bekannt. Bei polygener Vererbung wurde u.a. der Einfluss von MC4R-Genmutationen untersucht: Weniger als ein Fünftel der Mutationen zeigten moderate bis hohe Penetranz und erhöhten das Adipositas-Risiko um mehr als das Doppelte.
Referenzen: https://www.nature.com/articles/s41576-021-00414-z
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7373259/
- Allelic: ACTH-independent macronodular adrenal hyperplasia (GNAS)
- Allelic: Epileptic encephalopathy, early infantile, 58 (NTRK2)
- Allelic: McCune-Albright syndrome, somatic, mosaic (GNAS)
- Allelic: Mental retardation, AD 39 (MYT1L)
- Allelic: Osseous heteroplasia, progressive (GNAS)
- Allelic: Pituitary adenoma 3, multiple types, somatic (GNAS)
- Allelic: Pseudohypoparathyroidism Ia (GNAS)
- Allelic: Pseudohypoparathyroidism Ib (GNAS)
- Allelic: Pseudohypoparathyroidism Ic (GNAS)
- Allelic: Pseudopseudohypoparathyroidism (GNAS)
- Abdominal obesity-metabolic syndrome 3 (DYRK1B)
- BDV syndrome - Blakemore-Durmaz-Vasileiou syndrome (CPE)
- Borjeson-Forssman-Lehmann syndrome (PHF6)
- Chung-Jansen syndrome: developm. delay, impaired ID/learning, behavior, dysmorphism, obesity (PHIP)
- Cohen syndrome (VPS13B)
- Congenital obesity [panelapp] (SIM1)
- Joubert syndrome 1 (INPP5E)
- Mental retardation, truncal obesity, retinal dystrophy + micropenis (INPP5E)
- Morbid obesity + spermatogenic failure (CEP19)
- Neurodevelopmental disorder [panelapp] (PGM2L1)
- Obesity [panelapp] (KSR2)
- Obesity with impaired prohormone processing (PCSK1)
- Obesity, BMIQ20 (MC4R)
- Obesity, adrenal insufficiency, red hair due to POMC deficiency (POMC)
- Obesity, congenital (GNAS)
- Obesity, early-onset, susceptibility to (POMC)
- Obesity, hyperphagia + developmental delay (NTRK2)
- Obesity, mental retardation, AD 39 (MYT1L)
- Obesity, morbid, due to leptin deficiency (LEP)
- Obesity, morbid, due to leptin receptor deficiency (LEPR)
- Obesity, resistance to; BMIQ20 (MC4R)
- Obesity, severe (SIM1)
- Obesity, severe, susceptibility to, BMIQ9 (MC3R)
- Obesity, susceptibility to, BMIQ12 (PCSK1)
- Obesity, susceptibility to, BMIQ18 (MRAP2)
- Obesity, susceptibility to, BMIQ19 (ADCY3)
- Obesity, susceptibility to, BMIQ4 (UCP2)
- Retinal dystrophy + obesity (TUB)
- Severe early-onset obesity-insulin resistance syndrome due to SH2B1 defic. [MONDO:0017994] (SH2B1)
- Truncal obesity developing in mid-childhood (VPS13B)
- WAGRO s. [Wilms tumor, Aniridia, Genitourin. anom., ment. Retard., Obes.] (11p13-p12/BDNF deletion)
- AD
- AR
- Sus
- n.k.
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboranforderung
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.