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Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
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IllnessAmyloidosis, differential diagnosis

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for Amyloidosis comprising 3 guideline-curated and altogether 11 curated genes according to the clinical signs

ID
AP2536
Number of genes
11 Accredited laboratory test
Examined sequence length
10,8 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
- (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Test material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

 

Gene panel

Selected genes

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
APOA1804NM_000039.3AD
APOA2303NM_001643.2AD
APOC2306NM_000483.5AD
APOC3300NM_000040.3AD
B2M360NM_004048.4AD
CST3441NM_000099.4AD
FGA1935NM_021871.4AD, AR
GSN2349NM_000177.5AD, AR
LYZ447NM_000239.3AD
NLRP33111NM_004895.5AD
TTR444NM_000371.4AD

Informations about the disease

Clinical Comment

Amyloidosis occurs when misfolded proteins accumulate and form deposits in the organism, e.g. in the kidney and heart. This may lead to impairment and loss of organ function. Symptoms vary depending on which organs are affected. For example, transthyretin (TTR) amyloidosis is a slowly progressive disease that occurs in the peripheral nervous system and causes peripheral neuropathy. In some cases, the central nervous system is also affected, or the heart, kidneys, eyes and the gastrointestinal tract. The age at which the first symptoms appear varies between the 3.rd-8.th decade. Depending on the mutated genes such as APOA1, GSN, TTR etc., the resulting protein deposits in different organs/tissues each cause widely varying symptomatology. The mode of inheritance is autosomal dominant as in almost all other monogenic amyloidoses. Diagnostic yield data for the hereditary amyloidoses have not yet been collected. If no pathogenic variants are identified in candidate genes, the clinical diagnosis is by no means ruled out.

References: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1207/https://link.springer.com/article/10.1007/s00415-019-09688-0

Differential diagnosis should include Charcot-Marie-Tooth hereditary neuropathy, Fabry disease, mitochondrial disorders like e.g. MELAS, hereditary hypertrophic cardiomyopathy as well as multifactorial disorders like diabetic neuropathy, chronic inflammatory demyelinating polyradiculoneuropathy etc.

 

Synonyms
  • Alias: Amyloidosis, hereditary
  • Allelic: Afibrinogenemia, congenital (FGA)
  • Allelic: ApoA-I + apoC-III deficiency, combined (APOA1)
  • Allelic: Apolipoprotein A-II deficiency (APOA2)
  • Allelic: Apolipoprotein C-III deficiency (APOC3)
  • Allelic: CINCA [chronic infantile neurologic cutaneous + articular] syndrome (NLRP3)
  • Allelic: Carpal tunnel syndrome, familial (TTR)
  • Allelic: Deafness, AD 34, with/-out inflammation (NLRP3)
  • Allelic: Dysfibrinogenemia, congenital (FGA)
  • Allelic: Dystransthyretinemic hyperthyroxinemia (TTR)
  • Allelic: Familial cold inflammatory syndrome 1 (NLRP3)
  • Allelic: Hypercholesterolemia, familial, modifier of (APOA2)
  • Allelic: Hyperlipoproteinemia, type Ib (APOC2)
  • Allelic: Hypoalphalipoproteinemia, primary, 2, with/-out corneal clouding (APOA1)
  • Allelic: Hypodysfibrinogenemia, congenital (FGA)
  • Allelic: Immunodeficiency 43 (B2M)
  • Allelic: Keratoendothelitis fugax hereditaria (NLRP3)
  • Allelic: Macular degeneration, age-related, 11 (CST3)
  • Amyloidosis, 3 or more types (APOA1)
  • Amyloidosis, Finnish type (GSN)
  • Amyloidosis, familial visceral (B2M)
  • Amyloidosis, familial visceral (FGA)
  • Amyloidosis, hereditary, transthyretin-related (TTR)
  • Amyloidosis, renal (LYZ)
  • Cerebral amyloid angiopathy (CST3)
  • Muckle-Wells syndrome [urticaria-deafness-amyloidosis] (NLRP3)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.