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Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
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IllnessAortectasia, thoracic [EBM 11448}

Summary

Short information

EBM 11448-conform differential diagnostic panel for thoracic aortectasia comprising 3 guideline-curated core genes and another 6 guideline-curated core candidate genes

ID
AP0011
Number of genes
9 Accredited laboratory test
Examined sequence length
31,6 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
- (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Test material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

[Sanger]

 

Gene panel

Selected genes

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
ACTA21134NM_001613.4AD
COL3A14401NM_000090.4AD, AR
FBN18616NM_000138.5AD
MYH115919NM_002474.3AD
MYLK5745NM_053025.4AD
SMAD31278NM_005902.4AD
TGFB21245NM_003238.6AD
TGFBR11512NM_004612.4AD
TGFBR21704NM_003242.6AD

Informations about the disease

Clinical Comment

Thoracic aortic aneurysms (TAA) are often associated with genetic causes and are divided into those affecting the ascending aorta (60%), the aortic arch (10%), the descending aorta (40%) and the thoracoabdominal aorta (10%). TAA that occur at a young age without significant cardiovascular risk factors are usually stratified into syndromic disorders (e.g. Loeys-Dietz, Marfan and Ehlers-Danlos syndrome, etc.) with extravascular organ involvement and apparently isolated, non-syndromic disorders (familial TAA forms without and with persistent ductus arteriosus, Loeys-Dietz syndrome variants). Aortic abnormalities can occur at any age and vary even within the same family. Detection rates vary widely depending on the above categories, from 15 in familial TAAs to 90-95% (classic Marfan and Loeys-Dietz syndromes). Penetrance rates and expressiveness vary, sometimes considerably, depending on genetic causes. An inconspicuous genetic finding does not therefore mean that the clinical suspected diagnosis can be excluded with certainty.

Reference: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1120/

 

Synonyms
  • NOT EBM 11448: Familial thoracic aortic aneurysm, aortic dissection (EFEMP2, FOXE3, MFAP5)
  • Alias: Aortic aneurysm, familial thoracic [EBM]
  • Alias: Familial TAAD [EBM]
  • Allelic: Acromicric dysplasia (FBN1)
  • Allelic: Colorectal cancer, hereditary nonpolyposis, type 6 (TGFBR2)
  • Allelic: Ectopia lentis, familial (FBN1)
  • Allelic: Geleophysic dysplasia 2 (FBN1)
  • Allelic: MASS syndrome (FBN1)
  • Allelic: Marfan lipodystrophy syndrome (FBN1)
  • Allelic: Megacystis-microcolon-intestinal hypoperistalsis syndrome 1 (MYLK)
  • Allelic: Megacystis-microcolon-intestinal hypoperistalsis syndrome 2 (MYH11)
  • Allelic: Multiple self-healing squamous epithelioma, susceptibility to (TGFBR1)
  • Allelic: Stiff skin syndrome (FBN1)
  • Allelic: Visceral myopathy 2 (MYH11)
  • Allelic: Weill-Marchesani syndrome 2, dominant (FBN1)
  • Aortic aneurysm, familial thoracic 4 (MYH11)
  • Aortic aneurysm, familial thoracic 7 (MYLK)
  • Ehlers-Danlos syndrome, vascular type (COL3A1)
  • Fam. thoracic aortic aneurysm, aortic dissect. (COL3A1, FBN1, MYH11, MYLK, SMAD3, TGFB2, TGFBR1, -2)
  • Loeys-Dietz syndrome 1 (TGFBR1)
  • Loeys-Dietz syndrome 2 (TGFBR2)
  • Loeys-Dietz syndrome 3 (SMAD3)
  • Loeys-Dietz syndrome 4 (TGFB2)
  • Marfan syndrome (FBN1)
  • Polymicrogyria with/-out vascular-type EDS (COL3A1)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.