IllnessBeckwith-Wiedemann syndrome, differential diagnosis
Summary
Comprehensive differential diagnostic panel for Beckwith-Wiedemann syndrome comprising 9 guideline-curated and altogether 13 curated genes according to the clinical signs
26,3 kb (Extended panel: incl. additional genes)
- Amniotic fluid (after amnocentesis)
- Chorionic villus
- EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
- methylation analysis
- NGS + [Sanger] panel for DD, e.g. Costello, Malan, Perlman, PTEN-hanartoma, Simpson-Golabi-Behmel, Sotos, Weaver syndromes
Gene panel
Selected genes
Name | Exon Length (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Heredity |
---|---|---|---|---|
CDKN1C | 951 | NM_000076.2 | AD | |
DIS3L2 | 2658 | NM_152383.5 | AR | |
EZH2 | 2256 | NM_004456.5 | AD | |
GPC3 | 1743 | NM_004484.4 | XL | |
GPC4 | 1671 | NM_001448.3 | XL | |
HRAS | 570 | NM_005343.4 | AD | |
IGF2 | 543 | NM_000612.6 | AD | |
NFIX | 1533 | NM_001271043.2 | AD | |
NSD1 | 8091 | NM_022455.5 | AD | |
PIK3CA | 3207 | NM_006218.4 | SMu | |
PTEN | 1212 | NM_000314.8 | AD | |
HMGA2 | 330 | NM_003483.6 | AD | |
PLAG1 | 1503 | NM_002655.3 | AD |
Informations about the disease
Beckwith-Wiedemann syndrome (BWS) affects many parts of the body, e.g. with (asymmetric) macrosomia. Growth slows from about age 8, adults with BWS are not unusually tall. Also hemihyperplasias usually become less noticeable with time. Some children with BWS are born with an omphalocele or an umbilical hernia. Other symptoms include macroglossia, visceromegaly, folds or dimples in the skin near the ears, hypoglycemia in infancy and renal abnormalities. Children with BWS have an increased risk of developing Wilms tumor and hepatoblastoma occurring in about 10% of cases. However, most children and adults with BWS do not have serious medical problems, and their life expectancy is usually normal. The genetic causes of BWS are complex and are usually due to disturbed regulation of genes in a region of chromosome 11 due to impaired genomic imprinting, i.e. via methylation. At least half of BWS cases are due to alterations in differential methylation. Imprinting centers control the methylation of several genes involved in normal growth, including CDKN1C, H19, IGF2 and KCNQ1OT1. Approximately 20% of BWS cases are due to paternal uniparental disomy, in which there are two active copies of the paternally inherited genes, rather than one active copy from the father and one inactive copy from the mother. The genetic defect occurs early in embryonic development and results in somatic mosaicism. Less commonly, BWS is caused by mutations in the CDKN1C gene. About 1% of all people with BWS have a translocation, duplication, or deletion in chromosome 11. In about 85% of BWS cases, only one person in a family is diagnosed with the condition. Another 10-15% of people with BWS belong to families with more than one affected member. In most of these latter families, the disease appears to be inherited in an autosomal dominant manner, mostly from their mothers, occasionally with reduced penetrance. In rare cases, BWS results from changes in the structure of chromosome 11; some of these chromosomal abnormalities may be inherited. In up to 20% of BWS patients, the genetic defect can currently not be clarified. Thus the combined negative molecular genetic and cytogenetic results do not exclude the clinical diagnosis.
Reference: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1394/
- Alias: BWS = Exomphalos-macroglossia-gigantism syndrome
- Alias: Beckwith-Wiedemann Spectrum
- Alias: Wiedemann-Beckwith syndrome
- Allelic: Leukemia, acute myeloid (NSD1)
- Beckwith-Wiedemann syndrome (IGF2)
- Beckwith-Wiedemann syndrome (NSD1)
- Beckwith-Wiedemann syndrome; IMAGE syndrome (CDKN1C)
- Chromosome 11p15.5-related Russell-Silver syndrome (IGF2)
- Costello syndrome; Schimmelpenning-Feuerstein-Mims s., somatic mosaic; Hemimegalencephaly (HRAS)
- Human overgrowth syndrome type (PIK3CA)
- Keipert syndrome (GPC4)
- Marshall-Smith syndrome; Sotos syndrome 2 (NFIX)
- Overgrowth with Intellectual disability (PTEN)
- Overgrowth with intellectual disability (PIK3CA)
- Perlman syndrome (DIS3L2)
- Silver-Russell syndrome 4 (PLAG1)
- Silver-Russell syndrome 5 (HMGA2)
- Simpson-Golabi-Behmel syndrome type 1 (GPC3)
- Sotos syndrome 1 (NSD1)
- Weaver syndrome; Weaver syndrome 2 (EZH2)
- AD
- AR
- SMu
- XL
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatics and clinical interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboratory requirement
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.