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Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
Know how in the analysis of genetic material.
For the benefit of patients.

Summary

Short information

A curated panel containing 3 genes for the comprehensive analysis of the genetically caused forms of C1Q deficiency

ID
CP0010
Number of genes
3 Accredited laboratory test
Examined sequence length
2,3 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
- (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Test material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

 

Gene panel

Selected genes

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
C1QA738NM_015991.4AR
C1QB762NM_000491.5AR
C1QC738NM_001114101.3AR

Informations about the disease

Clinical Comment

Group of diseases: Immunodeficiency due to classical component pathway complement deficiency is primary lacking either components C1q, C1r, C1s, C2, C4; increased susceptibility to bacterial infections, particularly encapsulated bacteria, increased risk for autoimmune disease. Most commonly, these include systemic lupus erythematosus (SLE), SLE-like disease, Henoch-Schonlein purpura, polymyositis, arthralgia; severity variable, dependent on the complement affected

 

Synonyms
  • Alias: C1Q deficiency
  • Alias: Immunodeficiency due to C1, C4 or C2 component complement deficiency
  • Alias: Immunodeficiency due to an early component of complement deficiency
  • C1Q deficiency susceptibility to invasive bacterial infection (C1QB)
  • C1Q deficiency; Complement component 1 deficiency (C1QA)
  • Complement component 1 deficiency (C1QB)
  • Immunodeficiency due to classical component pathway complement deficiency (C1QA)
  • Immunodeficiency due to classical component pathway complement deficiency (C1QC)
  • Immunodeficiency due to early component of complement deficiency (C1QB)
  • SLE, infections with encapsulated organisms (C1QA)
  • SLE, infections with encapsulated organisms SLE lupus-like disease (C1QB)
  • SLE, infections with encapsulated organisms, Complement component 1 def., C1Q deficiency
Heredity, heredity patterns etc.
  • AR
OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.