IllnessCalcinosis, tumorous; differential diagnosis
Summary
A curated panel containing 4 and altogether 11 genes for the comprehensive differentially diagnostic analysis of the genetically caused forms of Hyperphosphatemic familial tumoral calcinosis
16,1 kb (Extended panel: incl. additional genes)
- EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
NGS +
Gene panel
Informations about the disease
Hyperphosphatemic familial tumorous calcinosis (HFTC) is characterized by deposits in childhood or (early) adulthood in and just under the skin around the joints, often on the hips, shoulders and elbows. Deposits may also occur in the soft tissues of the feet, legs, hands, and less commonly in blood vessels or the brain. HFTC develops quite gradually, and the deposits vary in size and can affect joint function. Other symptoms include ocular abnormalities (corneal calcification or angioid streaks in Bruch's membrane), inflammation of the diaphyses or hyperostosis and dental abnormalities. Low-symptom microlithiasis may develop in the testes. A similar condition like HTFC, hyperphosphatemia-hyperostosis syndrome, also results in elevated blood phosphate levels, excessive bone growth and bone lesions; it is now thought to be a mild variant of HFTC. Mutations in the FGF23, GALNT3, KL or SAMD9 genes cause HFTC; the disease is inherited in an autosomal recessive manner. Although the DNA diagnostic yield reaches >90% in typical cases, a negative molecular genetic result does not exclude clinical diagnosis.
Reference: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK476672/
- Alias: Familial Tumoral Calcinosis
- Alias: Hyperostosis-hyperphosphatemia syndrome
- Alias: Hyperphosphatemia hyperostosis syndrome
- Alias: Hyperphosphatemia tumoral calcinosis
- Alias: Hyperphosphatemic familial tumoral calcinosis
- Alias: Morbus Teutschländer (GALNT3)
- Alias: Primary Hyperphosphatemic Tumoral Calcinosis
- Allelic: ACTH-independent macronodular adrenal hyperplasia (GNAS)
- Allelic: Bone mineral density variation QTL, osteoporosis (COL1A1)
- Allelic: Combined osteogenesis imperfecta + Ehlers-Danlos syndrome 1 (COL1A1)
- Allelic: Diabetes mellitus, non-insulin-dependent, susceptibility to (ENPP1)
- Allelic: Ehlers-Danlos syndrome, arthrochalasia type, 1 (COL1A1)
- Allelic: Hypophosphatemic rickets, AD (FGF23)
- Allelic: Hypophosphatemic rickets, Ar, 2 (ENPP1)
- Allelic: McCune-Albright syndrome, somatic, mosaic (GNAS)
- Allelic: Obesity, susceptibility to (ENPP1)
- Allelic: Osteogenesis imperfecta, type I-IV (COL1A1)
- Allelic: Porphyria, hepatoerythropoietic (UROD)
- Allelic: Pseudohypoparathyroidism Ia, Ib, Ic (GNAS)
- Allelic: Pseudopseudohypoparathyroidism (GNAS)
- Allelic: Pseudoxanthoma elasticum (ABCC6)
- Allelic: Pseudoxanthoma elasticum, forme fruste (ABCC6)
- Arterial calcification, generalized, of infancy, 1 (ENPP1)
- Arterial calcification, generalized, of infancy, 2 (ABCC6)
- Caffey disease (COL1A1)
- Calcification of joints + arteries (NT5E)
- Cole disease (ENPP1)
- Fibrodysplasia ossificans progressiva (ACVR1)
- MIRAGE syndrome (SAMD9)
- Osseous heteroplasia, progressive (GNAS)
- Porphyria cutanea tarda (UROD)
- Tumoral calcinosis, familial, normophosphatemic (SAMD9)
- Tumoral calcinosis, hyperphosphatemic, familial, 1 (GALNT3)
- Tumoral calcinosis, hyperphosphatemic, familial, 2 (FGF23)
- Tumoral calcinosis, hyperphosphatemic, familial, 3 (KL)
- AD
- AR
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatics and clinical interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboratory requirement
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.