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Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
Know how in the analysis of genetic material.
For the benefit of patients.

IllnessCardio-facio-cutaneous syndrome, differential diagnosis

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for Cardio-facio-cutanous syndrome comprising 6 guideline-curated genes and altogether 21 curated genes according to the clinical signs

ID
KP1340
Number of genes
21 Accredited laboratory test
Examined sequence length
23,5 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
40,2 kb (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Test material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

[Sanger]

 

Gene panel

Selected genes

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
BRAF2301NM_004333.6AD
HRAS570NM_005343.4AD
KRAS567NM_004985.5AD
LZTR12523NM_006767.4AD, AR
MAP2K11182NM_002755.4AD
MAP2K21203NM_030662.4AD
NRAS570NM_002524.5AD
PPP1CB350NM_002709.3AD
PTPN111782NM_002834.5AD
RAF11947NM_002880.4AD
RIT1660NM_006912.6AD
SHOC21749NM_007373.4AD
SOS14002NM_005633.4AD
SOS23999NM_006939.4AD
CBL2721NM_005188.4AD
MRAS636NM_001085049.3AD
NF18457NM_001042492.3AD
RASA22550NM_006506.5AD
RRAS657NM_006270.5AD
RRAS2384NM_012250.6AD
SPRED11335NM_152594.3AD

Informations about the disease

Clinical Comment

Most patients with cardiofaciocutaneous syndrome (CFCS), a RASopathy, have cardiac defects (pulmonary stenosis, atrial septal defects, hypertrophic cardiomyopathy). The facial features of CFCS are characteristic: high forehead (narrowed at the temples), short nose, hypertelorism, outward/downward palpebral fissures, ptosis, small chin, and low-set ears. Overall, the face is broad and long. Skin abnormalities occur in almost all CFCS patients: dry/rough skin, nevi, wrinkled palms/soles and keratosis pilaris. CFCS patients also have thin, dry, curly hair and sparse or absent eyelashes and eyebrows. Infants with CFCS typically exhibit muscle hypotonia, feeding difficulties and failure to thrive. Other features of CFCS may include macrocephaly, short stature, vision problems and seizures. CFCS patients develop delayed with moderate to severe intellectual deficits. The symptoms of CFCS overlap significantly with those of Costello and Noonan syndrome. These three syndromes differ substantially in molecular genetics and some specific symptoms; however, it may still be difficult to separate these syndromes, especially in infancy. Unlike Costello syndrome, cancer development does not appear to be a major feature of CFCS. CFCS is inherited in an autosomal dominant manner. BRAF gene mutations are most common in CFCS (>75%), less common (>15% mutations) in the MAP2K1 or MAP2K2 genes and <5% in the KRAS gene. Negative molecular genetic findings in typical clinical situations most likely point to differential diagnoses, e.g. Costello or Noonan syndrome.

Reference: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1186/

 

Synonyms
  • Allelic: Cardiomyopathy, dilated, 1NN (RAF1)
  • Allelic: Congenital myopathy with excess of muscle spindles (HRAS)
  • Allelic: Fibromatosis, gingival, 1 (SOS1)
  • Allelic: Juvenile myelomonocytic leukemia (CBL)
  • Allelic: Leukemia, juvenile myelomonocytic (NF1)
  • Allelic: Melorheostosis, isolated, somatic mosaic (MAP2K1)
  • Allelic: Metachondromatosis (PTPN11)
  • Allelic: Neurofibromatosis, familial spinal (NF1)
  • Allelic: Ovarian carcinoma (RRAS2)
  • Allelic: RAS-associated autoimmune leukoproliferative disorder (KRAS)
  • Allelic: Schwannomatosis-2, susceptibility to (LZTR1)
  • Allelic: Watson syndrome (NF1)
  • Cardiofaciocutaneous syndrome (BRAF)
  • Cardiofaciocutaneous syndrome 2 (KRAS)
  • Cardiofaciocutaneous syndrome 3 (MAP2K1)
  • Cardiofaciocutaneous syndrome 4 (MAP2K2)
  • Costello syndrome (HRAS)
  • LEOPARD syndrome 1 (PTPN11)
  • LEOPARD syndrome 2 (RAF1)
  • LEOPARD syndrome 3 (BRAF)
  • Legius syndrome (SPRED1)
  • Neurofibromatosis, type 1 (NF1)
  • Neurofibromatosis-Noonan syndrome (NF1)
  • Noonan syndrome (RASA2)
  • Noonan syndrome 1 (PTPN11)
  • Noonan syndrome 10 (LZTR1)
  • Noonan syndrome 11 (MRAS)
  • Noonan syndrome 12 (RRAS2)
  • Noonan syndrome 2 (LZTR1)
  • Noonan syndrome 3 (KRAS)
  • Noonan syndrome 4 (SOS1)
  • Noonan syndrome 5 (RAF1)
  • Noonan syndrome 6 (NRAS)
  • Noonan syndrome 7 (BRAF)
  • Noonan syndrome 8 (RIT1)
  • Noonan syndrome 9 (SOS2)
  • Noonan syndrome-like disorder (RREB1)
  • Noonan syndrome-like disorder with loose anagen hair 2 (PPP1CB)
  • Noonan syndrome-like disorder with or without juvenile myelomonocytic leukemia (CBL)
  • Noonan syndrome-like with loose anagen hair 1 (SHOC2)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.