Klinische FragestellungKardio-fazio-kutanes Syndrom, Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Kardio-fazio-kutanes Syndrom mit 6 Leitlinien-kuratierten Genen bzw. insgesamt 21 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose
40,2 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- EDTA-Blut (3-5 ml)
NGS +
[Sanger]
Genpanel
Ausgewählte Gene
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
BRAF | 2301 | NM_004333.6 | AD | |
HRAS | 570 | NM_005343.4 | AD | |
KRAS | 567 | NM_004985.5 | AD | |
LZTR1 | 2523 | NM_006767.4 | AD, AR | |
MAP2K1 | 1182 | NM_002755.4 | AD | |
MAP2K2 | 1203 | NM_030662.4 | AD | |
NRAS | 570 | NM_002524.5 | AD | |
PPP1CB | 350 | NM_002709.3 | AD | |
PTPN11 | 1782 | NM_002834.5 | AD | |
RAF1 | 1947 | NM_002880.4 | AD | |
RIT1 | 660 | NM_006912.6 | AD | |
SHOC2 | 1749 | NM_007373.4 | AD | |
SOS1 | 4002 | NM_005633.4 | AD | |
SOS2 | 3999 | NM_006939.4 | AD | |
CBL | 2721 | NM_005188.4 | AD | |
MRAS | 636 | NM_001085049.3 | AD | |
NF1 | 8457 | NM_001042492.3 | AD | |
RASA2 | 2550 | NM_006506.5 | AD | |
RRAS | 657 | NM_006270.5 | AD | |
RRAS2 | 384 | NM_012250.6 | AD | |
SPRED1 | 1335 | NM_152594.3 | AD |
Infos zur Erkrankung
Die meisten Patienten mit kardiofaziokutanem Syndrom (CFCS), einer RASopathie, weisen Herzfehler auf (Pulmonalstenosen, Vorhofseptumdefekte, hypertrophe Kardiomyopathie). Die Gesichtszüge des CFCS sind charakteristisch: hohe Stirn (an den Schläfen verengt), kurze Nase, Hypertelorismus, nach außen/unten verlaufende Lidspalten, Ptosis, kleines Kinn und tief angesetzte Ohren. Insgesamt ist das Gesicht breit und lang. Hautanomalien treten bei fast allen CFCS-Patienten auf: trockene/raue Haut, Nävi, faltige Handflächen/Fußsohlen und Keratosis pilaris. CFCS-Patienten haben auch dünnes, trockenes, lockiges Haar sowie spärliche oder fehlende Wimpern und Augenbrauen. Säuglinge mit CFCS zeigen typischerweise Muskelhypotonie, Fütterungsschwierigkeiten und Gedeihstörungen. Weitere Merkmale von CFCS können Makrozephalie, Kleinwuchs, Sehprobleme und Krampfanfälle sein. CFCS-Patienten entwickeln sich verzögert mit moderaten bis schwereren intellektuellen Defiziten. Die Symptome des CFCS überschneiden sich deutlich mit denen des Costello und des Noonan Syndroms. Diese drei Syndrome unterscheiden sich wesentlich durch die Molekulargenetik und einige spezifische Symptome; dennoch kann es schwierig sein, diese Syndrome voneinander zu trennen, besonders im Säuglingsalter. Im Gegensatz zum Costello-Syndrom, scheint Krebs-Entwicklung kein Hauptmerkmal von CFCS zu sein. CFCS wird autosomal-dominant vererbt. BRAF-Genmutationen sind beim CFCS am häufigsten (>75%), >15% werden Mutationen in den Genen MAP2K1 oder MAP2K2 und <5% im KRAS-Gen identifiziert. Negative molekulargenetische Befunde können bei typischer Klinik am ehesten auf die Differentialdiagnosen, z.B. auf das Costello oder auf das Noonan Syndrom hinweisen.
Referenz: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1186/
- Allelic: Cardiomyopathy, dilated, 1NN (RAF1)
- Allelic: Congenital myopathy with excess of muscle spindles (HRAS)
- Allelic: Fibromatosis, gingival, 1 (SOS1)
- Allelic: Juvenile myelomonocytic leukemia (CBL)
- Allelic: Leukemia, juvenile myelomonocytic (NF1)
- Allelic: Melorheostosis, isolated, somatic mosaic (MAP2K1)
- Allelic: Metachondromatosis (PTPN11)
- Allelic: Neurofibromatosis, familial spinal (NF1)
- Allelic: Ovarian carcinoma (RRAS2)
- Allelic: RAS-associated autoimmune leukoproliferative disorder (KRAS)
- Allelic: Schwannomatosis-2, susceptibility to (LZTR1)
- Allelic: Watson syndrome (NF1)
- Cardiofaciocutaneous syndrome (BRAF)
- Cardiofaciocutaneous syndrome 2 (KRAS)
- Cardiofaciocutaneous syndrome 3 (MAP2K1)
- Cardiofaciocutaneous syndrome 4 (MAP2K2)
- Costello syndrome (HRAS)
- LEOPARD syndrome 1 (PTPN11)
- LEOPARD syndrome 2 (RAF1)
- LEOPARD syndrome 3 (BRAF)
- Legius syndrome (SPRED1)
- Neurofibromatosis, type 1 (NF1)
- Neurofibromatosis-Noonan syndrome (NF1)
- Noonan syndrome (RASA2)
- Noonan syndrome 1 (PTPN11)
- Noonan syndrome 10 (LZTR1)
- Noonan syndrome 11 (MRAS)
- Noonan syndrome 12 (RRAS2)
- Noonan syndrome 2 (LZTR1)
- Noonan syndrome 3 (KRAS)
- Noonan syndrome 4 (SOS1)
- Noonan syndrome 5 (RAF1)
- Noonan syndrome 6 (NRAS)
- Noonan syndrome 7 (BRAF)
- Noonan syndrome 8 (RIT1)
- Noonan syndrome 9 (SOS2)
- Noonan syndrome-like disorder (RREB1)
- Noonan syndrome-like disorder with loose anagen hair 2 (PPP1CB)
- Noonan syndrome-like disorder with or without juvenile myelomonocytic leukemia (CBL)
- Noonan syndrome-like with loose anagen hair 1 (SHOC2)
- AD
- AR
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboranforderung
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.