IllnessDiabetes mellitus, neonatal; Differentialdiagnose

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for Aicardi-Goutières syndrome comprising 24 guideline-curated and another 3 curated genes according to the clinical signs

DP0300

Number of loci

Loci type	Count
Gen	29

Accredited laboratory test

Examined sequence length

37,1 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
46,8 kb (Extended panel: incl. additional genes)

Analysis Duration

on request

Test material

EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)

Diagnostic indications

NGS +

[Sanger]

Loci panel

Gen

Name	Exon Length (bp)	OMIM-G	Referenz-Seq.	Heredity
ABCC8	4746	600509	NM_000352.6	AD, AR
EIF2AK3	3351	604032	NM_004836.7	AR
FOXP3	1296	300292	NM_014009.4	XLR
GATA4	1329	600576	NM_002052.5	AD
GATA6	1788	601656	NM_005257.6	AD
GCK	1398	138079	NM_000162.5	AD, AR
GLIS3	2328	610192	NM_152629.4	AR
HNF1A	1896	142410	NM_000545.8	AD
HNF1B	1674	189907	NM_000458.4	AD
HNF4A	1359	600281	NM_175914.4	AD
IER3IP1	249	609382	NM_016097.5	AR
INS	333	176730	NM_000207.3	AD, AR
KCNJ11	1173	600937	NM_000525.4	AD
NEUROD1	1071	601724	NM_002500.5	AR
NEUROG3	645	604882	NM_020999.4	AR
NKX2-2	822	604612	NM_002509.4	AR
PAX6	1269	607108	NM_000280.5	AR
PDX1	852	600733	NM_000209.4	AR
PTF1A	987	607194	NM_178161.3	AR
RFX6	2787	612659	NM_173560.4	AR
SLC19A2	1494	603941	NM_006996.3	AR
SLC2A2	1575	138160	NM_000340.2	AR
WFS1	2673	606201	NM_006005.3	AD, AR
BSCL2	1197	606158	NM_032667.6	AR
CISD2	408	611507	NM_001008388.5	AR
EIF2B1	918	606686	NM_001414.4	AD
INSR	4149	147670	NM_000208.4	AD
PLAGL1	1392	603044	NM_001080951.3	Meth
ZFP57	1611	612192	NM_001109809.5	AD, AR

Informations about the disease

Clinical Comment

Hyperglycemia, failure to thrive, in some cases, dehydration + ketoacidosis -may be severe with coma- in a child within the first months of life

Synonyms

Alias: Neonatal diabetes mellitus (NDM)
Allelic: Cataract 41 (WFS1)
Allelic: Deafness, AD 6/14/38 (WFS1)
Allelic: Diabetes mellitus, gestational (GCK)
Allelic: Diabetes mellitus, insulin-dependent (HNF1A)
Allelic: Diabetes mellitus, insulin-dependent, 2 (INS)
Allelic: Diabetes mellitus, insulin-dependent, 20 (HNF1A)
Allelic: Diabetes mellitus, noninsulin-dependent (ABCC8, HNF1B, HNF4A, SLC2A2)
Allelic: Diabetes mellitus, noninsulin-dependent, 2 (HNF1A)
Allelic: Diabetes mellitus, noninsulin-dependent, association with (WFS1)
Allelic: Diabetes mellitus, noninsulin-dependent, late onset (GCK)
Allelic: Diabetes mellitus, type 1 (INS)
Allelic: Diabetes mellitus, type 2, susceptibility to (KCNJ11)
Allelic: Diabetes mellitus, type II, susceptibility to (PDX1)
Allelic: Diarrhea 4, malabsorptive, congenital (NEUROG3)
Allelic: Fanconi renotubular syndrome 4, with maturity-onset diabetes of the young (HNF4A)
Allelic: Hepatic adenoma, somatic (HNF1A)
Allelic: Hyper-IgE recurrent infection syndrome (STAT3)
Allelic: Hyperinsulinemic hypoglycemia, familial, 1 (ABCC8)
Allelic: Hyperinsulinemic hypoglycemia, familial, 2 (KCNJ11)
Allelic: Hyperinsulinemic hypoglycemia, familial, 3 (GCK)
Allelic: Hypoglycemia of infancy, leucine-sensitive (ABCC8)
Allelic: MODY, type II (GCK)
Allelic: MODY, type III (HNF1A)
Allelic: MODY, type IV (PDX1)
Allelic: MODY, type VI (NEUROD1)
Allelic: MODY, type X (INS)
Allelic: Neuropathy, distal hereditary motor, type VC (BSCL2)
Allelic: Silver spastic paraplegia syndrome (BSCL2)
Allelic: Thiamine-responsive megaloblastic anemia syndrome (SLC19A2)
Allelic: Vissers-Bodmer syndrome (CNOT1)
Allelic:MODY, type I (HNF4A)
Asphyxiating thoracic dystrophy syndrome + infantile‐onset diabetes [panelapp] (PDIA6)
Autoimmune disease, multisystem, infantile-onset, 1 (STAT3)
Congenital generalised lipodystrophy, severe insulin resistance + diabetes [panelapp] (BSCL2)
Currarino syndrome (MNX1)
Diabetes mellitus, neonatal, with congenital hypothyroidism (GLIS3)
Diabetes mellitus, permanent neonatal (ABCC8, GCK, INS)
Diabetes mellitus, permanent neonatal, with neurologic features (KCNJ11)
Diabetes mellitus, transient neonatal (KCNJ11)
Diabetes mellitus, transient neonatal 2 (ABCC8)
Diabetes, mellitus, insulin-dependent, susceptibility to, 10 (IL2RA)
Diabetes, permanent neonatal (KCNJ11)
Encephalopathy, progressive, with/-out lipodystrophy (BSCL2)
Fanconi-Bickel syndrome (SLC2A2)
Holoprosencephaly 12, with or without pancreatic agenesis (CNOT1)
Immunodeficiency 41 with lymphoproliferation + autoimmunity (IL2RA)
Immunodysregulation, polyendocrinopathy, enteropathy, XL, IPEX (FOXP3)
Leukoencephalopathy with vanishing white matter 1, +/- ovarian failure (EIF2B1)
Lipodystrophy, congenital generalized, type 1 (AGPAT2)
Lipodystrophy, congenital generalized, type 2 (BSCL2)
MEHMO [Mental retard., Epilepsy, Hypogonadism/-genitalism, Microcephaly, Obesity] syndrome (EIF2S3)
Microcephaly, epilepsy + diabetes syndrome (IER3IP1)
Microcephaly, epilepsy + diabetes syndrome 2 (YIPF5)
Mitchell-Riley syndrome, includes neonatal diabetes (RFX6)
Neonatal diabetes + generalised lipodystrophy [panelapp] (BSCL2)
Neonatal diabetes mellitus [MONDO:0016391, panelapp] (ONECUT1)
Neonatal diabetes mellitus [MONDO:0016391, panelapp] (ZNF808)
Neonatal diabetes mellitus [MONDO:0016391] (IL2RA)
Neonatal diabetes, pancreatic agenesis and/or congenital heart defects (GATA4)
ONECUT1-associated neonatal diabetes [panelapp] (ONECUT1)
Pancreatic agenesis 1 (PDX1, PTF1A)
Pancreatic agenesis [MONDO:0009832, panelapp] (ZNF808)
Pancreatic agenesis and congenital heart defects (GATA6)
Renal cell carcinoma (HNF1A, HNF1B)
Renal cysts and diabetes syndrome (HNF1B)
Wolcott-Rallison syndrome (EIF2AK3)
Wolfram syndrome 1 (WFS1)
Wolfram-like syndrome, AD (WFS1)

Heredity, heredity patterns etc.

AD
AR
Meth
XLR

OMIM-Ps

Multiple OMIM-Ps

ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

DAkkS-akkreditiertes Labor
EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
Gen-Konversionen
komplexe Inversionen
Balancierte Translokationen
Mitochondriale Varianten
Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
niedriger Mosaik-Status
Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
Varianten innerhalb von Pseudogenen
die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.