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Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
Know how in the analysis of genetic material.
For the benefit of patients.

IllnessDystonia, Dopa-responsive; differential diagnosis

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for Dystonia, DOPA-responsive comprising 5 guideline-curated genes and altogether 7 curated genes according to the clinical signs

ID
DP0190
Number of genes
7 Accredited laboratory test
Examined sequence length
13,8 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
15,6 kb (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Test material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

[Sanger]

 

Gene panel

Selected genes

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
GCH1753NM_000161.3AD, AR
KMT2B8232NM_014727.3AD
PRKN1398NM_004562.3AR
SPR786NM_003124.5AR
TH1587NM_199292.3AR
TOR1A999NM_000113.3AD
PINK11746NM_032409.3AR, digenisch

Informations about the disease

Clinical Comment

In Dopa-Responsive dystonia (DRD), mild to severe involuntary muscle contractions, tremor and especially dystonia occur. Symptoms of DRD usually begin in childhood, often by age 6. The first signs are typically clubfeet and dystonia in the lower limbs. DRD spreads to the upper limbs, and by adolescence, virtually the entire body is affected. Affected individuals sometimes have unusual limb positions and lack of coordination when walking and running. Some patients have sleep problems or depressive episodes, often parkinsonism. The movement disorder worsens with age, but it stabilizes around age 30. Characteristic is diurnal fluctuation, i.e., worsening of problems during the day and morning betterment after waking. In rare cases, movement problems do not appear until adulthood. GCH1 mutations are the most common cause of DRD, less commonly mutated TH or SPR genes. In some cases, the genetic cause remains unclear. When DRD is caused by mutations in the GCH1 gene, it is inherited in an autosomal dominant manner. Some GCH1 mutation carriers never develop symptoms, but women are 2-4 times more likely to be affected than men. When TH gene mutations are responsible, DRD is inherited in an autosomal recessive manner; when caused by SPR mutations, DRD can be inherited either in an autosomal recessive manner or, less commonly, in a dominant manner. A negative DNA test result does not exclude the clinical diagnosis.

References: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1508/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1437/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK304122/

 

Synonyms
  • Allelic: Adenocarcinoma of lung, somatic (PRKN)
  • Allelic: Arthrogryposis multiplex congenita 5 (TOR1A)
  • Allelic: Hyperphenylalaninemia, BH4-deficient, B (GCH1)
  • Allelic: Ovarian cancer, somatic (PRKN)
  • Allelic: Polyneuropathy (GCH1)
  • Dystonia 28, childhood-onset (KMT2B)
  • Dystonia 5 (GCH1)
  • Dystonia [panelapp] (PINK1)
  • Dystonia, DOPA-responsive, AD (GCH1)
  • Dystonia, DOPA-responsive, due to sepiapterin reductase deficiency (SPR)
  • Dystonia, DOPA-responsive, with/-out hyperphenylalaninemia (GCH1)
  • Dystonia, infantile (GCH1)
  • Dystonia, progressive, with diurnal variation/fluctuation (GCH1)
  • Dystonia-1, modifier of (TOR1A)
  • Dystonia-1, torsion (TOR1A)
  • Parkinson disease 6, early onset (PINK1)
  • Parkinson disease, juvenile, type 2 (PRKN)
  • Segawa syndrome, AD (GCH1)
  • Segawa syndrome, AR (TH)
  • Spastic paraplegia (GCH1)
  • Tyrosine hydroxylase-deficient dopa-responsive dystonia (TH)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
  • digenisch
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.