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Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
Know how in the analysis of genetic material.
For the benefit of patients.

IllnessDystonia-Parkinson syndrome, diufferential diagnosis

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for Dystonia-Parkinson syndrome comprising 8 guideline-curated and altogether 24 curated genes according to the clinical signs

ID
DP8273
Number of genes
17 Accredited laboratory test
Examined sequence length
22,6 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
29,1 kb (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Test material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

[Sanger]

 

Gene panel

Selected genes

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
ATP1A33042NM_152296.5AD
C19orf12459NM_001031726.3AR
GCH1753NM_000161.3AD, AR
PANK21713NM_153638.4AR
PRKRA942NM_003690.5AR
SLC30A101458NM_018713.3AR
SLC39A141804NM_015359.6AR
SLC6A31863NM_001044.5AR
SPR786NM_003124.5AR
TAF15682NM_004606.5XLR
TH1587NM_199292.3AR
TUBB4A1335NM_006087.4AD
WDR451086NM_007075.4XL
FBXO71332NM_001033024.2AR
MECP21461NM_004992.4XL
PLA2G62421NM_003560.4AR
SGCE1314NM_003919.3AD

Informations about the disease

Clinical Comment

X-linked dystonia-parkinsonism (XLDP) is the prime example for this group of diseases, the other pertinent genes are mostly subsumed under dystonias, their mutated genes are mentioned below. XLDP is a movement disorder exclusively observed in people of Filipino descent. Parkinsonism is usually the first sign of the disease with tremors, bradykinesia, rigidity, postural instability and a shuffling gait. Later in life, many affecteds individuals also develop dystonia typically starting in areas of the eyes, jaw or neck which later spread with disabling spasms. Generalized dystonia disturbs speaking, swallowing, coordination and walking. The symptoms of dystonia-parkinsonism (DP) vary widely. In severe cases the affecteds become dependent on others for care within a few years, and they may die prematurely from breathing difficulties, infections or other complications. TAF1 mutations cause XLDP. The gene is part of the complex TAF1/DYT3 multiple transcript system. This condition is inherited in an X-linked pattern. Genes to be considered In the differential diagnosis of DP include ATP1A3, GCH1, KCTD17, PRKRA, SPR, TH, C19orf12, PANK2, SLC30A10, SLC39A14, SLC6A3, TUBB4A, WDR45 and others. These DP disorders are inherited rarely in an XL pattern, more often in autosomal recessive or dominant patterns. Since the yield via molecular genetics reaches barely 90%, a negative DNA test result does not exclude the clinical diagnosis.

References: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1489/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1155/

 

Synonyms
  • Alias: Adult-onset dystonia-parkinsonism, included
  • Alias: Infantile dystonia-parkinsonism, included
  • Alias: Rapid-onset dystonia-parkinsonism, included
  • Allelic: Autism susceptibility, XL 3 (MECP2)
  • Allelic: Developmental and epileptic encephalopathy 53 (SYNJ1)
  • Allelic: Dystonia 3, torsion, XL (TAF1)
  • Allelic: Dystonia musculorum deformans (TAF1)
  • Allelic: Dystonia-parkinsonism, XL (TAF1)
  • Allelic: Encephalopathy, neonatal severe (MECP2)
  • Allelic: Hyperostosis cranalis interna (SLC39A14)
  • Allelic: Lopes-Maciel-Rodan syndrome (HTT)
  • Allelic: Lubag syndrome (TAF1)
  • Allelic: Rett syndrome (MECP2)
  • Allelic: Torsion dystonia-parkinsonism, Filipino type
  • Allelic: XL dystonia-parkinsonism syndrome (TAF1)
  • Allelic: XL torsion dystonia-parkinsonism syndrome (TAF1)
  • Alternating hemiplegia of childhood (ATP1A3)
  • CAPOS syndrome (ATP1A3)
  • Choreoacanthocytosis (VPS13A)
  • Dystonia 11, myoclonic (SGCE)
  • Dystonia 12 (ATP1A3)
  • Dystonia 16 (PRKRA)
  • Dystonia 26, myoclonic (KCTD7)
  • Dystonia 4, torsion, AD (TUBB4A)
  • Dystonia, DOPA-responsive, with or without hyperphenylalaninemia (GCH1)
  • Dystonia, dopa-responsive, due to sepiapterin reductase deficiency (SPR)
  • Dystonia-Parkinsonism, XL (TAF1)
  • Early-onset dystonia parkinsonism, included
  • Huntington disease (HTT)
  • Hypermanganesemia with dystonia 1 (SLC30A10)
  • Hypermanganesemia with dystonia 2 (SLC39A14)
  • Hyperphenylalaninemia, BH4-deficient, B (GCH1)
  • Hypoprebetalipoproteinemia, acanthocytosis, retinitis pigm. + pallidal degeneration/HARP s. (PANK2)
  • Intellectual developmental disorder, XL syndromic, Lubs type (MECP2)
  • Intellectual developmental disorder, XL, syndromic 13 (MECP2)
  • Kufor-Rakeb syndrome (ATP13A2)
  • Leukodystrophy, hypomyelinating, 6 (TUBB4A)
  • McLeod syndrome with/-out chronic granulomatous disease (XK)
  • Mental retardation, X-linked, syndromic 3 (TAF1)
  • Neurodegeneration with brain iron accumulation 1 (PANK2)
  • Neurodegeneration with brain iron accumulation 4 (C19orf12)
  • Neurodegeneration with brain iron accumulation 5 (WDR45)
  • Nicotine dependence, protection against (SLC6A3)
  • PLA2G6-related dystonia-parkinsonism (PLA2G6)
  • Parkinson disease 15, AR (FBXO7)
  • Parkinson disease 20, early-onset (SYNJ1)
  • Parkinson disease, juvenile, type 2 (PRKN)
  • Parkinsonism-dystonia, infantile, 1 (SLC6A3)
  • Rett syndrome, atypical (MECP2)
  • Rett syndrome, preserved speech variant (MECP2)
  • Segawa syndrome, recessive (TH)
  • Spastic paraplegia 43, AR (C19orf12)
  • Spastic paraplegia 78, AR (ATP13A2)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
  • XL
  • XLR
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.