IllnessEktodermale Dysplasie, ohne An-/Hypohydrosis; Differentialdiagnose
Summary
Comprehensive differential diagnostic panel for ectodermal Dysplasia [without an-/hypohydrosis] containing 23 core candidate genes and altogether 31 curated genes according to the clinical signs
38,1 kb (Extended panel: incl. additional genes)
- EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
NGS +
[Sanger]
Gene panel
Selected genes
Name | Exon Length (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Heredity |
---|---|---|---|---|
CDH3 | 2490 | NM_001793.6 | AR | |
CDSN | 1590 | NM_001264.5 | AD | |
DSG4 | 3123 | NM_177986.5 | AR | |
GJB6 | 786 | NM_006783.5 | AD, AR, digenisch | |
HOXC13 | 993 | NM_017410.3 | AR | |
HR | 3570 | NM_005144.5 | AD | |
KRT14 | 1419 | NM_000526.5 | AD | |
KRT25 | 1361 | NM_181534.4 | AR | |
KRT74 | 1590 | NM_175053.4 | AD, AR | |
KRT85 | 1524 | NM_002283.4 | AR | |
LIPH | 1356 | NM_139248.3 | AR | |
LPAR6 | 1035 | NM_005767.7 | AR | |
MBTPS2 | 1560 | NM_015884.4 | XLR | |
MSX1 | 912 | NM_002448.3 | AD, AR | |
NECTIN1 | 1554 | NM_002855.5 | AR | |
NECTIN4 | 1533 | NM_030916.3 | AR | |
PKP1 | 2181 | NM_001005337.3 | AR | |
PORCN | 1386 | NM_203475.3 | XL | |
RMRP | 300 | NR_003051.3 | AR | |
RSPO4 | 705 | NM_001029871.4 | AR | |
SNRPE | 279 | NM_003094.4 | AD | |
TP63 | 2043 | NM_003722.5 | AD | |
TSPEAR | 2010 | NM_144991.3 | AR | |
APCDD1 | 1545 | NM_153000.5 | AD | |
GJA1 | 1149 | NM_000165.5 | AD | |
HRURF | 105 | AD |
Informations about the disease
The ectodermal dysplasias (EDs) comprise a large, heterogeneous group of hereditary and congenital disorders. They mainly affect the skin and its appendages (hair follicles, eccrine glands, sebaceous glands, nails) and the teeth. To date, about 200 different EDs have been described. For example, a very common form of ED is hidrotic ED (Clouston syndrome). Different classification principles for EDs are mainly based on clinical features or, more recently, on functional aspects. Pure EDs are manifested by defects in ectodermal structures alone, whereas ED syndromes are defined by the combination of ectodermal defects in conjunction with other abnormalities. All classical inheritance patterns are observed in EDs. The molecular genetic diagnostic yield is currently unknown. A negative molecular genetic result does not exclude the clinical diagnosis.
References: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1200/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK43797/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK154653/
- Allelic: Bart-Pumphrey syndrome (GJB2)
- Allelic: Craniometaphyseal dysplasia, AR (GJA1)
- Allelic: Deafness, AD 3A (GJB2)
- Allelic: Deafness, AR 1A (GJB2)
- Allelic: Erythrokeratodermia variabilis et progressiva 3 (GJA1)
- Allelic: Oculodentodigital dysplasia (GJA1)
- Allelic: Oculodentodigital dysplasia, AR (GJA1)
- Allelic: Syndactyly, type III (GJA1)
- ADULT [acro-dermato-ungual-lacrimal-tooth] syndrome (TP63)
- Anonychia congenita (RSPO4)
- Cartilage-hair hypoplasia (RMRP)
- Cleft lip/palate-ectodermal dysplasia syndrome (NECTIN1)
- Congenital heart defects + ectodermal dysplasia (PRKD1)
- Ectodermal dysplasia 14, hair/tooth type with/-out hypohidrosis (TSPEAR)
- Ectodermal dysplasia 2, Clouston type (GJB6)
- Ectodermal dysplasia 3, Witkop type (MSX1)
- Ectodermal dysplasia 4, hair/nail type (KRT85)
- Ectodermal dysplasia 9, hair/nail type (HOXC13)
- Ectodermal dysplasia, ectrodactyly, macular dystrophy (CDH3)
- Ectodermal dysplasia-syndactyly syndrome 1 (NECTIN4)
- Ectodermal dysplasia/skin fragility syndrome (PKP1)
- Ectrodactyly, ectodermal dysplasia, cleft lip/palate syndrome 3 (TP63)
- Erythrokeratodermia variabilis et progressiva 5 (KRT83)
- Focal dermal hypoplasia (PORCN)
- Hay-Wells syndrome (TP63)
- Hypotrichosis 1 (APCDD1)
- Hypotrichosis 11 (SNRPE)
- Hypotrichosis 2 (CDSN)
- Hypotrichosis 3 (KRT74)
- Hypotrichosis 4 (HR)
- Hypotrichosis 6 (DSG4)
- Hypotrichosis 7 (LIPH)
- Hypotrichosis 8 (LPAR6)
- Hypotrichosis, congenital, with juvenile macular dystrophy (CDH3)
- Hystrix-like ichthyosis with deafness (GJB2)
- Keratitis-ichthyosis-deafness syndrome (GJB2)
- Keratoderma, palmoplantar, with deafness (GJB2)
- Keratosis follicularis spinulosa decalvans, XL (MBTPS2)
- Limb-mammary syndrome (TP63)
- Marie Unna hereditary hypotrichosis (HR)
- Monilethrix (KRT81, KRT83, KRT86)
- Odontoonychodermal dysplasia (WNT10A)
- Orofacial cleft 7 (NECTIN1)
- Orofacial cleft 8 (TP63)
- Palmoplantar keratoderma with congenital alopecia (GJA1)
- Progressive cicatricial alopecia of the scalp (MBTPS2)
- Pure hair + nail ectodermal dysplasia, Ectodermal dysplasia 7, hair/nail type (KRT74)
- Rapp-Hodgkin syndrome (TP63)
- Schopf-Schulz-Passarge syndrome (WNT10A)
- Split-hand/foot malformation 4 (TP63)
- Tooth agenesis, selective, 4 (WNT10A)
- Vohwinkel syndrome (GJB2)
- Woolly hair, AR 1, with/-out hypotrichosis (LPAR6)
- Woolly hair, AR 2 with/-out hypotrichosis (LIPH)
- Woolly hair, AR 3 (KRT25)
- AD
- AR
- XL
- XLR
- digenisch
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatics and clinical interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboratory requirement
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.