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Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
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IllnessEktodermale Dysplasie, ohne An-/Hypohydrosis; Differentialdiagnose

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for ectodermal Dysplasia [without an-/hypohydrosis] containing 23 core candidate genes and altogether 31 curated genes according to the clinical signs

ID
EP0260
Number of genes
26 Accredited laboratory test
Examined sequence length
35,3 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
38,1 kb (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Test material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

[Sanger]

 

Gene panel

Selected genes

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
CDH32490NM_001793.6AR
CDSN1590NM_001264.5AD
DSG43123NM_177986.5AR
GJB6786NM_006783.5AD, AR, digenisch
HOXC13993NM_017410.3AR
HR3570NM_005144.5AD
KRT141419NM_000526.5AD
KRT251361NM_181534.4AR
KRT741590NM_175053.4AD, AR
KRT851524NM_002283.4AR
LIPH1356NM_139248.3AR
LPAR61035NM_005767.7AR
MBTPS21560NM_015884.4XLR
MSX1912NM_002448.3AD, AR
NECTIN11554NM_002855.5AR
NECTIN41533NM_030916.3AR
PKP12181NM_001005337.3AR
PORCN1386NM_203475.3XL
RMRP300NR_003051.3AR
RSPO4705NM_001029871.4AR
SNRPE279NM_003094.4AD
TP632043NM_003722.5AD
TSPEAR2010NM_144991.3AR
APCDD11545NM_153000.5AD
GJA11149NM_000165.5AD
HRURF105AD

Informations about the disease

Clinical Comment

The ectodermal dysplasias (EDs) comprise a large, heterogeneous group of hereditary and congenital disorders. They mainly affect the skin and its appendages (hair follicles, eccrine glands, sebaceous glands, nails) and the teeth. To date, about 200 different EDs have been described. For example, a very common form of ED is hidrotic ED (Clouston syndrome). Different classification principles for EDs are mainly based on clinical features or, more recently, on functional aspects. Pure EDs are manifested by defects in ectodermal structures alone, whereas ED syndromes are defined by the combination of ectodermal defects in conjunction with other abnormalities. All classical inheritance patterns are observed in EDs. The molecular genetic diagnostic yield is currently unknown. A negative molecular genetic result does not exclude the clinical diagnosis.

References: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1200/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK43797/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK154653/

 

Synonyms
  • Allelic: Bart-Pumphrey syndrome (GJB2)
  • Allelic: Craniometaphyseal dysplasia, AR (GJA1)
  • Allelic: Deafness, AD 3A (GJB2)
  • Allelic: Deafness, AR 1A (GJB2)
  • Allelic: Erythrokeratodermia variabilis et progressiva 3 (GJA1)
  • Allelic: Oculodentodigital dysplasia (GJA1)
  • Allelic: Oculodentodigital dysplasia, AR (GJA1)
  • Allelic: Syndactyly, type III (GJA1)
  • ADULT [acro-dermato-ungual-lacrimal-tooth] syndrome (TP63)
  • Anonychia congenita (RSPO4)
  • Cartilage-hair hypoplasia (RMRP)
  • Cleft lip/palate-ectodermal dysplasia syndrome (NECTIN1)
  • Congenital heart defects + ectodermal dysplasia (PRKD1)
  • Ectodermal dysplasia 14, hair/tooth type with/-out hypohidrosis (TSPEAR)
  • Ectodermal dysplasia 2, Clouston type (GJB6)
  • Ectodermal dysplasia 3, Witkop type (MSX1)
  • Ectodermal dysplasia 4, hair/nail type (KRT85)
  • Ectodermal dysplasia 9, hair/nail type (HOXC13)
  • Ectodermal dysplasia, ectrodactyly, macular dystrophy (CDH3)
  • Ectodermal dysplasia-syndactyly syndrome 1 (NECTIN4)
  • Ectodermal dysplasia/skin fragility syndrome (PKP1)
  • Ectrodactyly, ectodermal dysplasia, cleft lip/palate syndrome 3 (TP63)
  • Erythrokeratodermia variabilis et progressiva 5 (KRT83)
  • Focal dermal hypoplasia (PORCN)
  • Hay-Wells syndrome (TP63)
  • Hypotrichosis 1 (APCDD1)
  • Hypotrichosis 11 (SNRPE)
  • Hypotrichosis 2 (CDSN)
  • Hypotrichosis 3 (KRT74)
  • Hypotrichosis 4 (HR)
  • Hypotrichosis 6 (DSG4)
  • Hypotrichosis 7 (LIPH)
  • Hypotrichosis 8 (LPAR6)
  • Hypotrichosis, congenital, with juvenile macular dystrophy (CDH3)
  • Hystrix-like ichthyosis with deafness (GJB2)
  • Keratitis-ichthyosis-deafness syndrome (GJB2)
  • Keratoderma, palmoplantar, with deafness (GJB2)
  • Keratosis follicularis spinulosa decalvans, XL (MBTPS2)
  • Limb-mammary syndrome (TP63)
  • Marie Unna hereditary hypotrichosis (HR)
  • Monilethrix (KRT81, KRT83, KRT86)
  • Odontoonychodermal dysplasia (WNT10A)
  • Orofacial cleft 7 (NECTIN1)
  • Orofacial cleft 8 (TP63)
  • Palmoplantar keratoderma with congenital alopecia (GJA1)
  • Progressive cicatricial alopecia of the scalp (MBTPS2)
  • Pure hair + nail ectodermal dysplasia, Ectodermal dysplasia 7, hair/nail type (KRT74)
  • Rapp-Hodgkin syndrome (TP63)
  • Schopf-Schulz-Passarge syndrome (WNT10A)
  • Split-hand/foot malformation 4 (TP63)
  • Tooth agenesis, selective, 4 (WNT10A)
  • Vohwinkel syndrome (GJB2)
  • Woolly hair, AR 1, with/-out hypotrichosis (LPAR6)
  • Woolly hair, AR 2 with/-out hypotrichosis (LIPH)
  • Woolly hair, AR 3 (KRT25)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
  • XL
  • XLR
  • digenisch
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.