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Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
Know how in the analysis of genetic material.
For the benefit of patients.

IllnessEpilepsy, generalized with fever attacks, differential diagnosis

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for Aicardi-Goutières syndrome containing 1 guideline-curated gene as well as 8 core candidate genes and altogether 13 curated genes according to the clinical signs

ID
EP0371
Number of genes
11 Accredited laboratory test
Examined sequence length
24,4 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
29,0 kb (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Test material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

 

Gene panel

Selected genes

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
CPA61314NM_020361.5AR, AD
GABRD1359NM_000815.5AD
GABRG21404NM_000816.3AD
PIGH767NM_004569.5AR
SCN1A6030NM_001165963.4AD
SCN1B657NM_001037.5AD, AR
SCN2A6018NM_021007.3AD
SCN9A5934NM_002977.3AD
STX1B867NM_052874.5AD
EFHC11923NM_018100.4AD
HCN22670NM_001194.4AD, AR

Informations about the disease

Clinical Comment

Genetic epilepsy with febrile seizures plus (GEFS+) is a spectrum of seizure disorders, each with varying severity. High fever triggers recurrent seizures, including febrile seizures. Common forms of GEFS+ include myoclonic, atonic and absence seizures. Common in the GEFS+ spectrum and tending to be mild are simple febrile seizures that usually resolve by 5 years of age. If febrile seizures persist after 5 years of age, they regularly terminate in early adolescence. Dravet syndrome (severe myoclonic epilepsy in infancy) is often considered part of the GEFS+ spectrum and is the most severe disorder in this group. Affected infants typically have sustained febrile seizures lasting several minutes, which may progress to status epilepticus. Reduced brain functioning is common in Dravet syndrome. GEFS+ are virtually always inherited in an autosomal dominant manner (or occur sporadically). Family members with GEFS+ may have various combinations of febrile seizures and forms of epilepsy. Penetrance rates are estimated to be 70-90%, depending on the genetic basis. Diagnostic yield is approximately 50%. Inconspicuous findings by no means exclude clinical diagnosis.

Reference: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1318/

 

Synonyms
  • Spectrum from simple febrile seizures + generalized epilepsy to Dravet syndrome
  • Allelic: Atrial fibrillation, familial, 13 (SCN1B)
  • Allelic: Brugada syndrome 5 (SCN1B)
  • Allelic: Cardiac conduction defect, nonspecific (SCN1B)
  • Allelic: Erythermalgia, primary (SCN9A)
  • Allelic: Insensitivity to pain, congenital (SCN9A)
  • Allelic: Neuropathy, hereditary sensory + autonomic, type IID (SCN9A)
  • Allelic: Paroxysmal extreme pain disorder (SCN9A)
  • Allelic: Small fiber neuropathy (SCN9A)
  • Developmental + epileptic encephalopathy 24 (HCN1)
  • Epilepsy, childhood absence, susceptibility to, 2 (GABRG2)
  • Epilepsy, familial temporal lobe, 5 (CPA6)
  • Epilepsy, generalized, with febrile seizures plus, type 1 (SCN1B)
  • Epilepsy, generalized, with febrile seizures plus, type 2 (SCN1A)
  • Epilepsy, generalized, with febrile seizures plus, type 3 (GABRG2)
  • Epilepsy, generalized, with febrile seizures plus, type 5, susceptibility to (GABRD)
  • Epilepsy, idiopathic generalized, 10} (GABRD)
  • Epilepsy, juvenile myoclonic, susceptibility to (GABRD)
  • Epileptic encephalopathy, early infantile, 11 (SCN2A)
  • Epileptic encephalopathy, early infantile, 4 (STXBP1)
  • Epileptic encephalopathy, early infantile, 52 (SCN1B)
  • Epileptic encephalopathy, early infantile, 6 [Dravet syndrome] (SCN1A)
  • Epileptic encephalopathy, early infantile, 74 (GABRG2)
  • Epileptic encephalopathy, early infantile, 9 (GABRG2)
  • Episodic ataxia, type 9 (SCN2A)
  • Febrile seizures, familial, 11 (CPA6)
  • Febrile seizures, familial, 3A (SCN1A)
  • Febrile seizures, familial, 3B (SCN9A)
  • Febrile seizures, familial, 8 (GABRG2)
  • Generalized epilepsy with febrile seizures plus, type 10 (HCN1)
  • Generalized epilepsy with febrile seizures plus, type 7 (SCN9A)
  • Genetic epilepsy with febrile seizures plus [panelapp] (SLC32A1)
  • Glycosylphosphatidylinositol biosynthesis defect 17 (PIGH)
  • Intractable childhood epilepsy with generalized tonic-clonic seizures
  • Migraine, familial hemiplegic, 3 (SCN1A)
  • Seizures, benign familial infantile, 3 (SCN2A)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.