IllnessEpileptic encephalopathy, early infantile -"Dravet syndrome"; differential diagnosis
Summary
Comprehensive differential diagnostic panel for epileptic encephalopathy, infantile [Dravet syndrome] comprising 9 guideline-curated and altogether 25 curated genes according to the clinical signs
72,8 kb (Extended panel: incl. additional genes)
- EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
NGS +
Gene panel
Selected genes
Name | Exon Length (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Heredity |
---|---|---|---|---|
GABRA1 | 1371 | NM_000806.5 | AD | |
GABRG2 | 1404 | NM_000816.3 | AD | |
SCN1A | 6030 | NM_001165963.4 | AD | |
SCN1B | 657 | NM_001037.5 | AD, AR | |
SCN8A | 5943 | NM_014191.4 | AD | |
SCN9A | 5934 | NM_002977.3 | AD, AR | |
STX1B | 867 | NM_052874.5 | AD | |
STXBP1 | 1812 | NM_003165.6 | AD, AR | |
CHRNA2 | 1590 | NM_000742.4 | AD | |
CHRNA4 | 1884 | NM_000744.7 | AD | |
CHRNB2 | 1509 | NM_000748.3 | AD | |
CPA6 | 1314 | NM_020361.5 | AD, AR | |
CRH | 591 | NM_000756.4 | Mult | |
DEPDC5 | 4812 | NM_001242896.3 | AD | |
EFHC1 | 1923 | NM_018100.4 | AD | |
GABRD | 1359 | NM_000815.5 | AD | |
KCNQ2 | 2619 | NM_172107.4 | AD | |
KCNQ3 | 2619 | NM_004519.4 | AD | |
KCNT1 | 3708 | NM_020822.3 | AD | |
LGI1 | 1674 | NM_005097.4 | AD | |
MICAL1 | 3286 | NM_001159291.2 | AD | |
PCDH19 | 3447 | NM_001184880.2 | XL | |
RELN | 10383 | NM_005045.4 | AD, AR | |
SCN2A | 6018 | NM_021007.3 | AD |
Informations about the disease
Dravet syndrome, formerly sometimes called severe myoclonic epilepsy of infancy (SMEI), is an epilepsy syndrome that begins in infancy or early childhood and encompasses a spectrum of symptoms ranging from mild to severe. Initial focal or generalized seizures may begin before 15 months of age. Seizures are often prolonged, may be provoked by temperature changes, and can vary widely in course. Status epilepticus occurs frequently, especially in the first five years of life. Children typically develop normally in the first few years, but as seizures increase, skill acquisition slows and children lag behind their peers in development and show additional nonspecific symptoms. In at least 80%, Dravet syndrome is caused by SCNA1 mutations. Borderline SMEI and generalized epilepsy with febrile seizures plus are caused by defects in the same gene. Dravet syndrome is a lifelong condition; seizures can now be reduced by certain anticonvulsant medications. Although this comprehensive panel covers most monogenic causes of Dravet syndrome, a negative result does not represent a definite exclusion of even very rarely occurring mutations in additional genes.
Reference: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1318/
Europäische Dravet-Syndrom-(Therapie-)Leitlinie (2022): SCN1A, GABRA1, GABRG2, SCN8A, STXBP1 Gene sind diagnostisch relevant.
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1002/epi4.12569
Leitlinie: Diagnostische Prinzipien bei Epilepsien des Kindesalters; S1; From: 18.12.2017, valid until 17.12.2022; Gesellschaft für Neuropädiatrie (GNP): "Zwar haben die neuesten molekulargenetischen Befunde beigetragen, die Ursachen dieser häufigen idiopathischen Epilepsien etwas besser zu verstehen, doch ist eine routinemäßige genetische Diagnostik derzeit noch nicht sinnvoll.." However GRIN2A, KCNT1, KCNQ2, KCNQ3, SCN1A genes explicitly mentioned.
DD: >20 additional genes
- Alias: SMEI, Severe Myoclonic Epilepsy of Infancy
- Allelic: Hydranencephaly with abnormal genitalia (ARX)
- Allelic: Intellectual developmental disorder, XL 29 (ARX)
- Developmental + epileptic encephalopathy 1 (ARX)
- Epilepsy, childhood absence, susceptibility to, 4 (GABRA1)
- Epilepsy, generalized, with febrile seizures plus, type 1 (SCN1B)
- Epilepsy, generalized, with febrile seizures plus, type 2 (SCN1A)
- Epilepsy, generalized, with febrile seizures plus, type 3 (GABRG2)
- Epilepsy, juvenile myoclonic, susceptibility to, 5 (GABRA1)
- Epileptic encephalopathy, early infantile (SCN1B)
- Epileptic encephalopathy, early infantile [EIEE], >68 forms known
- Epileptic encephalopathy, early infantile, 19 (GABRA1)
- Epileptic encephalopathy, early infantile, 4 (STXBP1)
- Epileptic encephalopathy, early infantile, 6 [Dravet syndrome] (SCN1A)
- Epileptic encephalopathy, early infantile, 74 (GABRG2)
- Erythermalgia, primary (SCN9A)
- Febrile seizures, familial, 3A (SCN1A)
- Febrile seizures, familial, 3B (SCN9A)
- Febrile seizures, familial, 8 (GABRG2)
- Generalized epilepsy with febrile seizures plus, type 7 (SCN9A)
- Generalized epilepsy with febrile seizures plus, type 9 (STX1B)
- Insensitivity to pain, congenital (SCN9A)
- Lissencephaly, XL 2 (ARX)
- Migraine, familial hemiplegic (SCN1A)
- Neuropathy, hereditary sensory and autonomic, type IID (SCN9A)
- Paroxysmal extreme pain disorder (SCN9A)
- Partington syndrome (ARX)
- Proud syndrome (ARX)
- Small fiber neuropathy (SCN9A)
- AD
- AR
- Mult
- XL
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatics and clinical interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboratory requirement
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.