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Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
Know how in the analysis of genetic material.
For the benefit of patients.

IllnessFallot tetralogy, differential diagnosis

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for Fallot Tetralogy comprising 10 or 22 curated genes according to the clinical signs

ID
FP7531
Number of genes
22 Accredited laboratory test
Examined sequence length
19,8 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
50,2 kb (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Test material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

 

Gene panel

Selected genes

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
FLT44092NM_182925.5AD
GATA41329NM_002052.5AD
GATA51194NM_080473.5n.k.
GATA61788NM_005257.6AD
GDF11119NM_001492.6AD, AR
HAND2654NM_021973.3AD
JAG13657NM_000214.3AD
NKX2-5975NM_004387.4AD
TBX11488NM_080647.1AD
ZFPM23456NM_012082.4AD
ALDH1A21494NM_001206897.2Ass
CRELD11269NM_001031717.4AD
CRKL912NM_005207.4AD
DISP14575NM_032890.5n.a.
FOXC21506NM_005251.3AD
MYOM24434NM_003970.4n.k.
NFATC12832NM_001278669.2Meth
NOTCH17668NM_017617.5AD
SEMA3D2334NM_152754.3AD
TBX51557NM_000192.3AD
WNT5A1143NM_003392.7AD, Sus
ZFAND5647NM_001278245.2n.k.

Informations about the disease

Clinical Comment

Tetralogy of Fallot (TOF) and its variants include ventricular septal defect, right ventricular outflow tract obstruction, overriding of the ventricular septum by the aortic root and right ventricular hypertrophy. TOF occurs with a frequency of approximately 10% in infants with congenital heart disease. The etiology of TOF is complex, and its development has been associated with environmental factors and genetic disorders, including chromosomal abnormalities. The 22q11.2 deletion syndrome accounts for approximately 16% of cases with postnatally diagnosed TOF. TOF is one of the critical congenital heart diseases, a term that refers to a group of severe heart defects that are present from birth and are often treated surgically with good results. These defects result from problems in the formation of one or more parts of the heart during the early stages of embryonic development. In most cases, the pathogenesis of TOF is multifactorial. The diagnostic yield achievable by molecular genetics is currently largely unknown. Thus, a negative result does not represent any exclusion of the clinical diagnosis.

References: DOI: 10.1097/CRD.00000000000170

DOI: https://doi.org/10.3389/fgene.2020.00957

 

Synonyms
  • Alagille syndrome 1 (JAG1)
  • Atrial septal defect 2, (GATA4)
  • Atrial septal defect 7, with/-out AV conduction defects (NKX2-5)
  • Atrial septal defect 9 (GATA6)
  • Atrioventricular septal defect 4 (GATA4)
  • Atrioventricular septal defect 5 (GATA6)
  • Congenital heart defects, multiple types, 6 (GDF1)
  • Conotruncal anomaly face syndrome (TBX2)
  • Conotruncal heart malformations, variable (NKX2-5)
  • Deafness, congenital heart defects, posterior embryotoxon (JAG1)
  • DiGeorge syndrome (TBX2)
  • Hypoplastic left heart syndrome 2 (NKX2-5)
  • Hypothyroidism, congenital nongoitrous, 5 (NKX2-5)
  • Pancreatic agenesis + congenital heart defects (GATA6)
  • Persistent truncus arteriosus (GATA6)
  • Right atrial isomerism, Ivemark (GDF1)
  • Testicular anomalies with or without congenital heart disease (GATA4)
  • Tetralogy of Fallot, TOF (JAG1, NKX2-5, TBX1)
  • Velocardiofacial syndrome (TBX1)
  • Ventricular septal defect 1 (GATA4)
  • Ventricular septal defect 3 (NKX2-5)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
  • Ass
  • Meth
  • Sus
  • n.a.
  • n.k.
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.