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Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
Know how in the analysis of genetic material.
For the benefit of patients.

IllnessFloating-Harbor syndrome, differential dignosis

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for Floating-Harbor syndrome comprising 1 or 7 curated genes according to the clinical signs

ID
FP0340
Number of genes
7 Accredited laboratory test
Examined sequence length
9,7 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
38,9 kb (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Test material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

 

Gene panel

Selected genes

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
SRCAP9693NM_006662.3AD
CCDC81617NM_032040.5AR
CREBBP7329NM_004380.3AD
CUL75097NM_014780.5AR
EP3007245NM_001429.4AD
FOXP22148NM_014491.4AD
OBSL15691NM_015311.3AR

Informations about the disease

Clinical Comment

Floating harbor syndrome (FHS) is a disorder associated with short stature, slow bone mineralization, delayed speech development and characteristic facial features. The growth disturbance usually becomes apparent in the first year of life, and bone age is delayed in early childhood, but usually normal by 6-12 years of age. The delay in expressive language can be severe, and most affected individuals have also mild intellectual disability. Typical facial features in FHS include a triangular face with a low hairline, deep-set eyes with long eyelashes as well as a large nose with an overhanging nasal bridge including a short philtrum and thin red lips. In addition, some patients have finger abnormalities (brachydactyly, drumstick fingers, clinodactyly). Other features may include a high-pitched voice, cryptorchidism and possibly other organ systems involved. The syndrome is inherited in autosomal dominant manner, but most patients have a de novo pathogenic variant. The final diagnosis of the syndrome depends on molecular genetic findings, so FHS is diagnosed with practical certainty.

Reference: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK114458/

 

Synonyms
  • Alias: Leisti-Hollander-Rimoin syndrome (SRCAP)
  • Alias: Pelletier-Leisti syndrome (SRCAP)
  • 3-M syndrome 1(CUL7)
  • 3-M syndrome 2 (OBSL1)
  • 3-M syndrome 3 (CCDC8)
  • Broad thumbs, great toes, characteristic facies, mental retardation (CREBBP)
  • Childhood apraxia of speech, Developmental verbal apraxia (FOXP2)
  • Dolichospondylis dysplasia (CUL7)
  • Gloomy face syndrome (CUL7)
  • Le Merrer syndrome (CUL7)
  • Menke-Hennekam syndrome 1 (CREBBP)
  • Menke-Hennekam syndrome 2 (EP300)
  • Rubinstein-Taybi syndrome 1 (CREBBP)
  • Rubinstein-Taybi syndrome 2 (EP300)
  • Speech and language disorder with orofacial dyspraxia (FOXP2)
  • Speech-language disorder-1 (FOXP2)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.