©istock.com/Andrea Obzerova
Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
Know how in the analysis of genetic material.
For the benefit of patients.

IllnessGefleckte-Retina-Syndrom, Differentialdiagnose

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for Choroideremia syndrome comprising 9 or 10 curated genes according to the clinical signs

ID
GP0040
Number of loci
Loci typeCount
Gen10
Accredited laboratory test
Examined sequence length
20,7 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
21,3 kb (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Test material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

 

Loci panel

Gen

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
CHM1962NM_000390.4XL
EFEMP11482NM_001039348.3AD
PLA2G5417NM_000929.3AR
PRPH21041NM_000322.5AD, AR, digenisch
RDH5957NM_002905.5AD, AR
RHO1047NM_000539.3AD, AR
RLBP1954NM_000326.5AD, AR
RS1675NM_000330.4XL
VPS13B12069NM_017890.5AR
LRAT693NM_004744.5AR

Informations about the disease

Clinical Comment

DD "retinal fleck"

 

Synonyms
  • Alias: Albipunctate retinal dystrophy
  • Alias: Kandori fleck retina
  • Alias: Lauber's disease
  • Alias: Pigmentary retinal dystrophy
  • Allelic: Hypotonia, obesity, prominent incisors (VPS13B)
  • Allelic: Leber congenital amaurosis 14 (LRAT)
  • Allelic: Macular dystrophy, vitelliform, 3; Retinitis pigmentosa 7 + digenic form (PRPH2)
  • Allelic: Retinoschisis (RS1)
  • Bothnia retinal dystrophy; Fundus albipunctatus (RLBP1)
  • Choroidal dystrophy, central areolar 2; Leber congenital amaurosis 18 (PRPH2)
  • Choroideraemia; Tapetochoroidal dystrophy, progressive (CHM)
  • Cohen syndrome; Pepper syndrome (VPS13B)
  • Doyne honeycomb degeneration of retina (EFEMP1)
  • Fundus albipunctatus (RDH5)
  • Macular dystrophy, patterned, 1; Retinitis punctata albescens (PRPH2)
  • Newfoundland rod-cone dystrophy; Retinitis punctata albescens (RLBP1)
  • Retinal dystrophy, early-onset severe (LRAT)
  • Retinitis pigmentosa 4, AD/AR; Retinitis punctata albescens (RHO)
  • Retinitis pigmentosa, juvenile (LRAT)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
  • XL
  • digenisch
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.