IllnessGitelman plus Bartter syndromes, differential diagnosis
Summary
Comprehensive differential diagnostic panel for Gitelman plus Bartter syndromes comprising 9 curated genes according to the clinical signs
Loci type | Count |
---|---|
Gen | 21 |
48,3 kb (Extended panel: incl. additional genes)
- EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
NGS +
[Sanger]
Loci panel
Gen
Name | Exon Length (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Heredity |
---|---|---|---|---|
BSND | 963 | NM_057176.3 | AR | |
CACNA1H | 7062 | NM_021098.3 | AD | |
CASR | 3237 | NM_000388.4 | AD, AR | |
CLCN2 | 2697 | NM_004366.6 | AR, AD | |
CLCNKA | 2064 | NM_004070.4 | digenisch | |
CLCNKB | 2064 | NM_000085.5 | AR, digenisch | |
CLDN10 | 1038 | NM_001160100.2 | AR | |
CYP11B1 | 1512 | NM_000497.4 | AD, AR | |
HNF1B | 1674 | NM_000458.4 | AD | |
HSD11B2 | 1218 | NM_000196.4 | AR | |
KCNJ1 | 1176 | NM_000220.6 | AR | |
KCNJ10 | 1140 | NM_002241.5 | AR | |
KCNJ5 | 1260 | NM_000890.5 | AD | |
MAGED2 | 1832 | NM_014599.6 | XLR | |
NR3C2 | 2955 | NM_000901.5 | AD | |
SCNN1A | 2010 | NM_001038.6 | AR | |
SCNN1G | 1950 | NM_001039.4 | AD, AR | |
SLC12A1 | 3300 | NM_000338.3 | AR | |
SLC12A3 | 3093 | NM_000339.3 | AR | |
SLC26A3 | 2295 | NM_000111.3 | AR | |
WNK4 | 3732 | NM_032387.5 | AD |
Informations about the disease
ORPHA:358 + ORPHA:112
Differences Bartter syndrome vs. Gitelman syndrome
Renal defect ascending loop of Henle (s. effects of loop diuretica) distale tubulus (see effects of thiazids)
Ca excretion (urine) normal/elvated, often nephrocalzinosis reduced
Mg (serum) normal/reduced reduced / highly reduced
renal prostaglandin-E2 prod. elevated normal
Age at initial symptoms birth/early childhood, often intellectual deficit, small stature late chilhood / adults
neuromuscular symptoms, rare + weak frequent
muscle cramps, weakness
- Allelic: Bronchiectasis with or without elevated sweat chloride 3 (SCNN1G)
- Allelic: Bronchiectasis with/-out elevated sweat chloride 2 (SCNN1A)
- Allelic: Enlarged vestibular aqueduct, digenic (KCNJ10)
- Allelic: Epilepsy, childhood absence, susceptibility to, 6 (CACNA1H)
- Allelic: Epilepsy, idiopathic generalized, susceptibility to, 11 (CLCN2)
- Allelic: Epilepsy, idiopathic generalized, susceptibility to, 6 (CACNA1H)
- Allelic: Epilepsy, juvenile absence, susceptibility to, 2 (CLCN2)
- Allelic: Epilepsy, juvenile myoclonic, susceptibility to, 8 (CLCN2)
- Allelic: Hyperparathyroidism, neonatal (CASR)
- Allelic: Hypertension, early-onset, AD, exacerbation in pregnancy (NR3C2)
- Allelic: Hypocalciuric hypercalcemia, type I (CASR)
- Allelic: Leukoencephalopathy with ataxia (CLCN2)
- Allelic: Long QT syndrome 13 (KCNJ5)
- Allelic: Renal cell carcinoma (HNF1B)
- Allelic: Sensorineural deafness with mild renal dysfunction (BSND)
- Allelic: Type 2 diabetes mellitus (HNF1B)
- Adrenal hyperplasia, congenital, due to 11-beta-hydroxylase deficiency (CYP11B1)
- Aldosteronism, glucocorticoid-remediable (CYP11B1)
- Apparent mineralocorticoid excess (HSD11B2)
- Bartter syndrome, type 1 (SLC12A1)
- Bartter syndrome, type 2 (KCNJ1)
- Bartter syndrome, type 3 (CLCNKB)
- Bartter syndrome, type 4a (BSND)
- Bartter syndrome, type 4b, digenic (CLCNKA)
- Bartter syndrome, type 5, antenatal, transient (MAGED2)
- Diarrhea 1, secretory chloride, congenital (SLC26A3)
- Gitelman syndrome (SLC12A3)
- HELIX s.: Hypohidrosis, Electrolyte imbalance, Lacrimal gland dysf., Ichthyosis, Xerostomia (CLDN10)
- Hyperaldosteronism, familial, type II (CLCN2)
- Hyperaldosteronism, familial, type III (KCNJ5)
- Hyperaldosteronism, familial, type IV (CACNA1H)
- Hypocalcemia, AD, with Bartter syndrome (CASR)
- Liddle syndrome 2: pseudoaldosteronism, AD form of salt-sensitive hypertension (SCNN1G)
- Liddle syndrome 3: pseudoaldosteronism, AD form of salt-sensitive hypertension (SCNN1A)
- Pseudohypoaldosteronism type I, AD (NR3C2)
- Pseudohypoaldosteronism, type I (SCNN1A)
- Pseudohypoaldosteronism, type I (SCNN1G)
- Pseudohypoaldosteronism, type IIB (WNK4)
- Renal cysts + diabetes syndrome (HNF1B)
- SESAME syndr.: Seizures, Sensorineural deafness, Ataxia, Mental retard., Electrolyte imbal. (KCNJ10)
- AD
- AR
- XLR
- digenisch
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatics and clinical interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboratory requirement
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.