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Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
Know how in the analysis of genetic material.
For the benefit of patients.

IllnessHypomagnesiämie, hyperkalziurisch; Differentialdiagnose

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for hyperkalciuric Hypomagnesiemia comprising 4 curated genes according to the clinical signs

ID
HP0040
Number of genes
3 Accredited laboratory test
Examined sequence length
4,9 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
- (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Test material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

[Sanger]

 

Gene panel

Selected genes

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
CASR3237NM_000388.4AD, AR
CLDN16918NM_006580.4AR
CLDN19675NM_148960.3AR

Informations about the disease

Clinical Comment

Familial hypomagnesemia with hypercalciuria and nephrocalcinosis (FHHNC; OMIM 248250) is a progressive kidney disease characterized by hypomagnesemia, hypercalciuria and nephrocalcinosis due to a renal absorption disorder of magnesium and calcium. The disease manifests itself in childhood with polyuria, polydipsia, recurrent urinary tract infections, vomiting, abdominal pain and failure to thrive and leads to chronic kidney failure as it progresses. Although the clinical picture is usually severe, the clinical manifestations can also be subject to a certain degree of variability in affected siblings. In some cases (so-called FHHNCOI), ocular involvement is also present (e.g. myopia, nystagmus, retinal dysplasia).

The disease is heterogeneous and is inherited in an autosomal recessive manner. Pathogenic variants have been detected in the CLDN16 and CLDN19 (FHHNCOI) genes. CASR gene-related hypocalciuric hypercalcemia (hypocalcemia (or hypercalcemia), familial hypocalciuric hypercalcemia and hyperparathyroidism in newborns) is an important differential diagnosis due to similar clinical symptoms and is also covered in the panel. This disease is inherited in an autosomal dominant manner.

There is currently no specific therapy available for FHHNC. Symptomatic treatment with fluid intake, magnesium salts, thiazide diuretics and citrates can delay the progression of kidney failure. By knowing the genetic cause, the course of the disease can be better assessed, but in most cases a kidney transplant is the only treatment option.

If FHHNC/FHHNCOI or CASR-related kidney disease has been confirmed in an affected person by the detection of (one of) the pathogenic variants, relatives can be offered predictive testing for the familially identified variants as part of genetic counseling.

Literature

Vall-Palomar et al. 2021, PMID: 33595712; https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33595712/

Daan H H M Viering et al. 2017, PMID:27234911; https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27234911/

 

Synonyms
  • ALias: Familial hypomagnesemia with secondary hypocalcemia
  • Alias: Familial primary hypomagnesemia with hypercalciuria + nephrocalcinosis (CLDN16, CLDN19)
  • Alias: Michellis-Castrillo syndrome
  • Allelic: Epilepsy idiopathic generalized, susceptibility to, 8 (CASR)
  • Allelic: Hyperparathyroidism, neonatal (CASR)
  • Allelic: Hypocalcemia, AD (CASR)
  • Allelic: Hypocalciuric hypercalcemia, type I (CASR)
  • Bartter syndrome, type 3 (CLCNKB)
  • Hypocalcemia, AD, with Bartter syndrome (CASR)
  • Hypomagnesemia 3, renal (CLDN16)
  • Hypomagnesemia 5, renal, with ocular involvement (CLDN19)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.