IllnessJeune syndrome, differential diagnosis
Summary
Comprehensive differential diagnostic panel for Jeune syndrome comprising 5 or 26 curated genes according to the clinical signs
73,5 kb (Extended panel: incl. additional genes)
- EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
NGS +
Gene panel
Selected genes
Name | Exon Length (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Heredity |
---|---|---|---|---|
DYNC2H1 | 12945 | NM_001080463.2 | AR, digenisch | |
IFT140 | 4389 | NM_014714.4 | AR | |
IFT80 | 2334 | NM_020800.3 | AR | |
TTC21B | 3951 | NM_024753.5 | AR | |
WDR19 | 4029 | NM_025132.4 | AR | |
C2CD3 | 5892 | NM_015531.6 | AR | |
CEP120 | 2961 | NM_153223.4 | AR | |
CFAP410 | 1507 | NM_004928.3 | AR | |
CILK1 | 1899 | NM_014920.5 | AR | |
DYNC2I1 | 3201 | NM_018051.5 | AR | |
DYNC2I2 | 1611 | NM_052844.4 | AR | |
DYNC2LI1 | 1438 | NM_016008.4 | AR | |
DYNLT2B | 429 | AR | ||
EVC | 2979 | NM_153717.3 | AD, AR | |
EVC2 | 3927 | NM_147127.5 | AD, AR | |
IFT122 | 3879 | NM_052985.4 | AR | |
IFT172 | 5250 | NM_015662.3 | AR | |
IFT43 | 642 | NM_052873.3 | AR | |
INTU | 2829 | NM_015693.4 | AR | |
NEK1 | 3777 | NM_012224.4 | AR, digenisch | |
WDR35 | 3546 | NM_001006657.2 | AR |
Informations about the disease
Asphyxiating thoracic dystrophy (Jeune syndrome) is a hereditary disorder of bone growth with a narrow rib cage, short ribs, shortened arm and leg bones, short stature as well as polydactyly. Other skeletal abnormalities may include abnormally shaped clavicles, pelvic bones and tapered ends of the long limb bones. Many children with this condition are born with extremely narrow chests that limit the expansion of the lungs. Life-threatening respiratory problems can lead to infantile death. For those who survive the first few years, breathing may improve with age. Some patients are born with only mild problems and live into adolescence or adulthood, but may develop life-threatening kidney abnormalities. Cardiac defects and subglottic stenosis may occur. Less common features of Jeune syndrome include liver disease, pancreatic cysts, dental abnormalities and retinal dystrophy. Mutations in >30 genes are part of the differential diagnosis of this skeletal ciliopathy. Genetic alterations in the DYNC2H1 gene are responsible for up to 50% of cases. The disease is mostly inherited in an autosomal recessive manner. Although the diagnostic yield via molecular genetics can be as high as 90%, a negative DNA test result does not exclude the clinical diagnosis.
Reference: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1325/
- Alias: Asphyxiating thoracic chondrodystrophy
- Alias: Asphyxiating thoracic dysplasia
- Alias: Chondroectodermal dysplasia-like syndrome
- Alias: Infantile thoracic dystrophy
- Alias: Jeune asphyxiating thoracic dystrophy, JATD
- Alias: Jeune thoracic dysplasia
- Alias: Thoracic asphyxiant dystrophy
- Alias: Thoracic-pelvic-phalangeal dystrophy
- DD: Ellis-van Creveld syndrome (EVC, EVC2)
- DD: Loucks-Innes syndrome
- DD: Sensenbrenner syndrome
- Allelic: Amyotrophic lateral sclerosis, susceptibility to, 24 (NEK1)
- Allelic: Cranioectodermal dysplasia 4 (WDR19)
- Allelic: Epilepsy, juvenile myoclonic, susceptibility to, 10 (CILK1)
- Allelic: Joubert syndrome 23 (KIAA0586)
- Allelic: Joubert syndrome 31 (CEP120)
- Allelic: Nephronophthisis 12 (TTC21B)
- Allelic: Nephronophthisis 13 (WDR19)
- Allelic: Orofaciodigital syndrome XVII (INTU)
- Allelic: Retinal dystrophy with macular staphyloma (CFAP410)
- Allelic: Retinitis pigmentosa 71 (IFT172)
- Allelic: Retinitis pigmentosa 80 (IFT140)
- Allelic: Retinitis pigmentosa 81 (IFT43)
- Allelic: Senior-Loken syndrome 8 (WDR19)
- Allelic: Weyers acrofacial dysostosis (EVC, EVC2)
- Acrocallosal syndrome (KIF7)
- Acrocallosal syndrome (OFD1)
- Al-Gazali-Bakalinova syndrome (KIF7)
- Al-Gazali-Bakalinova syndrome (OFD1)
- Cranioectodermal dysplasia 1 (IFT122)
- Cranioectodermal dysplasia 2 (WDR35)
- Cranioectodermal dysplasia 3 (IFT43)
- Endocrine-cerebroosteodysplasia (CILK1)
- Hydrolethalus syndrome (HYLS1)
- Hydrolethalus syndrome 2 (KIF7)
- Hydrolethalus syndrome 2 (OFD1)
- Joubert syndrome 12 (KIF7)
- Joubert syndrome 12 (OFD1)
- Joubert syndrome 21 (CSPP1)
- Orofaciodigital syndrome XIV (C2CD3)
- Short-rib thoracic dysplasia 10 with/-out polydactyly (IFT172)
- Short-rib thoracic dysplasia 11 with/-out polydactyly (WDR34)
- Short-rib thoracic dysplasia 13 with/-out polydactyly (CEP120)
- Short-rib thoracic dysplasia 14 with polydactyly (KIAA0586)
- Short-rib thoracic dysplasia 15 with polydactyly (DYNC2LI1)
- Short-rib thoracic dysplasia 16 with/-out polydactyly (IFT52)
- Short-rib thoracic dysplasia 17 with/-out polydactyly (TCTEX1D2)
- Short-rib thoracic dysplasia 18 with polydactyly (IFT43)
- Short-rib thoracic dysplasia 19 with/-out polydactyly (IFT81)
- Short-rib thoracic dysplasia 2 with/-out polydactyly (IFT80)
- Short-rib thoracic dysplasia 20 with polydactyly (INTU)
- Short-rib thoracic dysplasia 3 with/-out polydactyly (DYNC2H1)
- Short-rib thoracic dysplasia 4 with/-out polydactyly (TTC21B)
- Short-rib thoracic dysplasia 5 with/-out polydactyly (WDR19)
- Short-rib thoracic dysplasia 6 with/-out polydactyly (NEK1)
- Short-rib thoracic dysplasia 7 with/-out polydactyly (WDR35)
- Short-rib thoracic dysplasia 8 with/-out polydactyly (WDR60)
- Short-rib thoracic dysplasia 9 with/-out polydactyly (IFT140)
- Spondylometaphyseal dysplasia, axial (CFAP410)
- AD
- AR
- digenisch
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatics and clinical interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboratory requirement
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.