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Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
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IllnessLebersche kongenitale Amaurose/Abiotrophie, Differentialdiagnose

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for Leber congenital amaurosis comprising 6 core candidate genes and altogether 33 curated genes according to the clinical signs

ID
LP0140
Number of genes
28 Accredited laboratory test
Examined sequence length
21,4 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
68,6 kb (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Test material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

 

Gene panel

Selected genes

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
CEP2907440NM_025114.4AR
CRB14221NM_201253.3AR
GUCY2D3312NM_000180.4AD, AR
RDH12951NM_152443.3AD, AR
RPE651602NM_000329.3AR
RPGRIP13861NM_020366.4AR
ADAMTS183666NM_199355.4AR
AIPL11155NM_014336.5AD, AR
ALMS112504NM_015120.4AR
CABP4828NM_145200.5AR
CRX900NM_000554.6AD
GDF61368NM_001001557.4AR
IFT1404389NM_014714.4AR
IMPDH11800NM_000883.4AD
IQCB11797NM_001023570.4AR
LCA52094NM_001122769.3AR
LRAT693NM_004744.5AR
MERTK3000NM_006343.3AR
NMNAT1840NM_022787.4AR
OTX2870NM_172337.3AD
POC1B1437NM_172240.3AR
PRPH21041NM_000322.5AD, AR, digenisch
RD3588NM_001164688.2AR
ROM11056NM_000327.4AD, AR, digenisch
SPATA71704NM_001040428.4AR
TUBB4B1342NM_006088.6AD
TULP11629NM_003322.6AR
USP452510NM_001080481.3AR

Informations about the disease

Clinical Comment

Leber congenital amaurosis/abiotrophy is an eye disease that primarily affects the retina and leads to severe visual impairment as early as in infancy. The visual impairment then usually remains stable, although it may worsen very slowly over time. Leber abiotrophy is also associated with other visual problems, including photophobia, nystagmus, extreme hyperopia and kertoconus. The pupils do not respond normally to light. A specific behavior of the young patients called the Franceschetti's oculo-digital sign is characteristic: pushing around, poking and rubbing the eyes with the fingers. In rare cases, developmental delays and mental retardation have been noted in people with Leber abiotrophy traits. About 20 different types have been described, as distinguished by their genetic causes, patterns of vision loss and associated eye changes. Mutations in any of the genes associated with Leber abiotrophy disrupt retinal development and function, leading to early vision loss. Mutations in the CEP290, CRB1, GUCY2D and RDH12 genes are the most common causes of the disease, although this depends on the population. The disease is usually inherited in an autosomal recessive manner or, less commonly, in an autosomal dominant manner. In <30% of all patients with liver abiotrophy, the cause of the disease remains unknown. Thus a negative DNA test result does not exclude the clinical diagnosis.

Reference: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK531510/

 

Synonyms
  • Alias: Amaurosis congenita of Leber, LCA
  • Alias: Amaurosis, Leber congenital
  • Alias: Congenital amaurosis of retinal origin
  • Alias: Congenital retinal blindness
  • Alias: Dysgenesis neuroepithelialis retinae
  • Alias: Hereditary epithelial dysplasia of retina
  • Alias: Hereditary retinal aplasia
  • Alias: Heredoretinopathia congenitalis
  • Alias: Leber abiotrophy
  • Alias: Leber congenital tapetoretinal degeneration
  • Alias: Retinal blindness, congenital
  • Allelic: Bardet-Biedl syndrome 14 (CEP290)
  • Allelic: Choroidal dystrophy, central areolar 1 (GUCY2D)
  • Allelic: Choroidal dystrophy, central areolar 2 (PRPH2)
  • Allelic: Cone-rod dystrophy 13 (RPGRIP1)
  • Allelic: Cranioectodermal dysplasia 4 (WDR19)
  • Allelic: Joubert syndrome 5 (CEP290)
  • Allelic: Klippel-Feil syndrome 1, AD (GDF6)
  • Allelic: Macular dystrophy, patterned, 1 (PRPH2)
  • Allelic: Macular dystrophy, vitelliform, 3 (PRPH2)
  • Allelic: Meckel syndrome 4 (CEP290)
  • Allelic: Microphthalmia with coloboma 6, digenic (GDF6)
  • Allelic: Microphthalmia, isolated 4 (GDF6)
  • Allelic: Multiple synostoses syndrome 4 (GDF6)
  • Allelic: Nephronophthisis 13 (WDR19)
  • Allelic: Night blindness, congenital stationary, type 1I (GUCY2D)
  • Allelic: Senior-Loken syndrome 6 (CEP290)
  • Allelic: Short-rib thoracic dysplasia 5 with/-out polydactyly (WDR19)
  • Allelic: Snowflake vitreoretinal degeneration (KCNJ13)
  • Allelic: Spermatogenic failure 72 (WDR19)
  • Achromatopsia 2 (CNGA3)
  • Cone-rod dystrophy (AIPL1)
  • Cone-rod dystrophy 13 (RPGRIP1)
  • Cone-rod dystrophy 6 (GUCY2D)
  • Cone-rod retinal dystrophy 2 (CRX)
  • Hypotaurinemic retinal degeneration + cardiomyopathy (SLC6A6)
  • Leber congenital amaurosis 1 (GUCY2D)
  • Leber congenital amaurosis 10 (CEP290)
  • Leber congenital amaurosis 11 (IMPDH1)
  • Leber congenital amaurosis 12 (RD3)
  • Leber congenital amaurosis 13 (RDH12)
  • Leber congenital amaurosis 14 (LRAT)
  • Leber congenital amaurosis 15 (TULP1)
  • Leber congenital amaurosis 16 (KCNJ13)
  • Leber congenital amaurosis 18 (PRPH2)
  • Leber congenital amaurosis 19 (USP45)
  • Leber congenital amaurosis 2 (RPE65)
  • Leber congenital amaurosis 3 (SPATA7)
  • Leber congenital amaurosis 4 (AIPL1)
  • Leber congenital amaurosis 5 (LCA5)
  • Leber congenital amaurosis 6 (RPGRIP1)
  • Leber congenital amaurosis 7 (CRX)
  • Leber congenital amaurosis 8 (CRB1)
  • Leber congenital amaurosis 9 (NMNAT1)
  • Leber's amaurosis
  • Nephronophthisis 15 (CEP164)
  • Pigmented paravenous chorioretinal atrophy (CRB1)
  • Retinal dystrophy, early-onset severe (LRAT)
  • Retinitis pigmentosa 10 (IMPDH1)
  • Retinitis pigmentosa 12 (CRB1)
  • Retinitis pigmentosa 14 (TULP1)
  • Retinitis pigmentosa 20 (RPE65)
  • Retinitis pigmentosa 7 + digenic form (PRPH2)
  • Retinitis pigmentosa 7 + digenic form (ROM1)
  • Retinitis pigmentosa 87 with choroidal involvement (RPE65)
  • Retinitis pigmentosa, juvenile (AIPL1)
  • Retinitis pigmentosa, juvenile (LRAT)
  • Retinitis pigmentosa, juvenile, AR (SPATA7)
  • Retinitis punctata albescens (PRPH2)
  • Senior-Loken syndrome 8 (WDR19)
  • Spondyloepiphyseal dysplasia, sensorineural hearing loss, intellectual developm. dis., LCA (NMNAT1)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
  • digenisch
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.