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Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
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IllnessLoeys-Dietz-/ Marfan-/ vaskuläres Ehlers-Danlos-Syndrom, Differentialdiagnose

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for Loeys-Dietz-/ Marfan-/ vaskuläres Ehlers-Danlos syndrome comprising 7 "guideline"-curated core genes and altogether 11 curated genes

ID
MP6544
Number of genes
10 Accredited laboratory test
Examined sequence length
25,8 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
34,6 kb (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Test material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

[Sanger]

 

Gene panel

Selected genes

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
COL1A14395NM_000088.4AD
COL3A14401NM_000090.4AD, AR
FBN18616NM_000138.5AD
SMAD21404NM_005901.6AD
SMAD31278NM_005902.4AD
TGFB21245NM_003238.6AD
TGFB31239NM_003239.5AD
TGFBR11512NM_004612.4AD
TGFBR21704NM_003242.6AD
FBN28739NM_001999.4AD

Informations about the disease

Clinical Comment

Group of diseasesMP6544 Loeys-Dietz / Marfan / vascular Ehlers-Danlos syndrome, differential diagnosis

The clinical differential diagnosis between patients with Marfan (MFS), Loeys-Dietz syndrome (LDS) and those with the Ehlers-Danlos (EDS) vascular type is sometimes quite difficult, especially in the early stages and when the condition is mild. MFS patients have ectopia lentis and remarkably long limbs. Patients with LDS tend to have more translucent skin, and the veins are clearly visible. Severe scarring and slight bruising are more common in LDS patients. Clubfoot, heart defects and cleft palate are more frequently associated with LDS. LDS is similar to the vascular EDS type in terms of skin findings. In both LDS and vascular type EDS, arterial aneurysms are relatively common, spontaneous organ ruptures are less common. Clubfoot is observed in both diseases. Hypertelorism and bifidal uvulas are more common in LDS.

The "classic" MFS is caused by mutations in the FBN1 gene (approx. 95% mutation detection probability in patients meeting the clinical criteria). LDS can be caused by mutations in six genes (SMAD2, SMAD3, TGBF2, TGBF3, TGFBR1, TGFBR2). COL3A1 mutations cause vascular EDS.

Reference: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1133/https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1335/https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1494/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1120/

 

Synonyms
  • Allelic: Acromicric dysplasia (FBN1)
  • Allelic: Caffey disease (COL1A1)-IV
  • Allelic: Colorectal cancer, hereditary nonpolyposis, type 6 (TGFBR2)
  • Allelic: Ectopia lentis, familial (FBN1)
  • Allelic: Esophageal cancer, somatic (TGFBR2)
  • Allelic: Geleophysic dysplasia 2 (FBN1)
  • Allelic: MASS syndrome (FBN1)
  • Allelic: Macular degeneration, early-onset (FBN2)
  • Allelic: Marfan lipodystrophy syndrome (FBN1)
  • Allelic: Multiple self-healing squamous epithelioma, susceptibility to (TGFBR1)
  • Allelic: Neural tube defects, folate-sensitive, susceptibility to (MTRR)
  • Allelic: Osteogenesis imperfecta, type I (COL1A1)
  • Allelic: Polymicrogyria with/-out vascular-type EDS (COL3A1)
  • Allelic: Stiff skin syndrome (FBN1)
  • Allelic: Weill-Marchesani syndrome 2, AD (FBN1)
  • Contractural arachnodactyly, congenital (FBN2)
  • DD: Dunbar-/ Ligamentum-arcuatum syndrome stomach pain: compressed A. coeliaca (Truncus coeliacus)
  • Ehlers-Danlos syndrome, arthrochalasia type, 1 (COL1A1)
  • Ehlers-Danlos syndrome, vascular type (COL3A1)
  • Loeys-Dietz syndrome 1 (TGFBR1)
  • Loeys-Dietz syndrome 2 (TGFBR1)
  • Loeys-Dietz syndrome 3 (SMAD3)
  • Loeys-Dietz syndrome 4 (TGFB2)
  • Marfan syndrome (FBN1)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.