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Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
Know how in the analysis of genetic material.
For the benefit of patients.

IllnessMacular degeneration, early onset; differentialdiagnosis

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for early macular degeneration comprising 11 or altogether 29 curated genes according to the clinical signs

ID
MP0010
Number of genes
25 Accredited laboratory test
Examined sequence length
26,4 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
54,7 kb (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Test material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

 

Gene panel

Selected genes

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
ABCA46822NM_000350.3AR
BEST11758NM_004183.4AD, AR
CDH32490NM_001793.6AR
CNGB32430NM_019098.5AR
ELOVL4945NM_022726.4AD
IMPG12394NM_001563.4AD, AR
IMPG23726NM_016247.4AD
MFSD81557NM_152778.3AR
PROM12598NM_006017.3AD, AR
PRPH21041NM_000322.5AD, AR, digenisch
TIMP3636NM_000362.5AD
CFAP4101507NM_004928.3AR
CTNNA12721NM_001903.5AD
EFEMP11482NM_001039348.3AD
GPR1431215NM_000273.3XL
GUCA1B603NM_002098.6AD
MERTK3000NM_006343.3AR
RAX2555NM_032753.4AD
RBP4606NM_006744.4AD, AR
RDH12951NM_152443.3AD, AR
RP1L17203NM_178857.6AR
RPGR2448NM_000328.3XL
RPGRIP13861NM_020366.4AR
RS1675NM_000330.4XL
SPTLC11422NM_006415.4AD

Informations about the disease

Clinical Comment

Stargardt macular degeneration causes progressive vision loss as the retina and specifically the macula is attacked. Most often, lipofuscin is deposited in the macula, damaging the cells that are critical for clear central vision. In addition, macular degeneration affects night vision (and color vision). Stargardt disease typically begins in late childhood to early adulthood and worsens later. Depending on the mutated gene, Stargardt disease can be inherited in a formally autosomal recessive (ABCA4; most frequently mutated) or autosomal dominant (ELOVL, PROM1) manner. The autosomal recessive inherited bestrophinopathy has its typical onset in the first decade, but on the other hand can remain asymptomatic until the fifth decade. It is a more severe retinopathy than best vitelliform macular dystrophy, which also becomes manifest in childhood or adolescence and shows incomplete penetrance (>70%). Visual acuity can range from normal to less than 20/200, depending on the macular involvement of the disease. Affected individuals are hyperopic and have shallow anterior chambers, making them prone to angle closure glaucoma. Other forms of early-onset macular degeneration are less commonly seen in most populations. The DNA diagnostic yield of the Amedes panel reaches ~65%. Reliable population data are not yet available for most of the involved genes in the panel. Thus, a negative result does not represent exclusion of the diagnosis.

References: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1167/

 

Synonyms
  • Alias: Macula degeneration, juvenile
  • Allelic: Leber congenital amaurosis 6 (RPGRIP1)
  • Allelic: Ceroid lipofuscinosis, neuronal, 7 (MFSD8)
  • Allelic: Choroidal dystrophy, central areolar 2 (PRPH2)
  • Allelic: Complement factor H deficiency (CFH)
  • Allelic: Cone-rod dystrophy 12 (PROM1)
  • Allelic: Cone-rod dystrophy 3 (ABCA4)
  • Allelic: Cone-rod dystrophy, XL, 1 (RPGR)
  • Allelic: Fundus flavimaculatus (ABCA4)
  • Allelic: Hemolytic uremic syndrome, atypical, susceptibility to, 1 (CFH)
  • Allelic: Ichthyosis, spastic quadriplegia, and mental retardation (ELOVL4)
  • Allelic: Leber congenital amaurosis 18 (PRPH2)
  • Allelic: Macular degeneration, age-related, 6 (RAX2)
  • Allelic: Microcornea, rod-cone dystrophy, cataract, posterior staphyloma (BEST1)
  • Allelic: Microphthalmia, isolated, with coloboma 10 (RBP4)
  • Allelic: Retinal dystrophy, early-onset severe (ABCA4)
  • Allelic: Retinitis pigmentosa 1 (ABCA4)
  • Allelic: Retinitis pigmentosa 3 (RPGR)
  • Allelic: Retinitis pigmentosa 41 (PROM1)
  • Allelic: Retinitis pigmentosa 48 (GUCA1B)
  • Allelic: Retinitis pigmentosa 56 (IMPG2)
  • Allelic: Retinitis pigmentosa 7 + digenic form (PRPH2)
  • Allelic: Retinitis pigmentosa 88 (RP1L1)
  • Allelic: Retinitis pigmentosa, XL, sinorespiratory infections, with/-out deafness (RPGR)
  • Allelic: Retinitis pigmentosa, concentric (BEST1)
  • Allelic: Retinitis pigmentosa-50 (BEST1)
  • Allelic: Retinitis punctata albescens (PRPH2)
  • Allelic: Retinoschisis (RS1)
  • Allelic: Spinocerebellar ataxia 34 (ELOVL4)
  • Allelic: Vitreoretinochoroidopathy (BEST1)
  • Achromatopsia 3 (CNGB3)
  • Basal laminar drusen (CFH(`)
  • Bestrophinopathy, AR (BEST1)
  • Cone-rod dystrophy 11 (RAX2)
  • Cone-rod dystrophy 13 (RPGRIP1)
  • Doyne honeycomb degeneration of retina (EFEMP1)
  • Ectodermal dysplasia, ectrodactyly + macular dystrophy (CDH3)
  • Fundus albipunctatus (RDH5)
  • Hypotrichosis, congenital, with juvenile macular dystrophy (CDH3)
  • Leber congenital amaurosis 13 (RDH12)
  • Macula dystrophy, hemorrhagic (Sorsby fundus dystrophy) included
  • Macular degeneration, XL atrophic (RPGR)
  • Macular degeneration, age-related, 2 (ABCA4)
  • Macular degeneration, age-related, 4 (CFH)
  • Macular dystrophy with central cone involvement (MFSD8)
  • Macular dystrophy, patterned, 1 (PRPH2)
  • Macular dystrophy, patterned, 2 (CTNNA1)
  • Macular dystrophy, retinal, 2 (PROM1)
  • Macular dystrophy, vitelliform, 2 (BEST1)
  • Macular dystrophy, vitelliform, 3 (PRPH2)
  • Macular dystrophy, vitelliform, 4 (IMPG1)
  • Macular dystrophy, vitelliform, 5 (IMPG2)
  • Neuropathy, hereditary sensory + autonomic, type IA (SPTLC1)
  • Occult macular dystrophy (RP1L1)
  • Retinal dystrophy with/-out extraocular anomalies (RCBTB1)
  • Retinal dystrophy, iris coloboma, comedogenic acne syndrome (PBP4)
  • Retinitis pigmentosa 38 (MERTK)
  • Sorsby fundus dystrophy (TIMP3)
  • Stargardt disease 1 (ABCA4)
  • Stargardt disease 3 (ELOVL4)
  • Stargardt disease 4 (PROM1)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
  • XL
  • digenisch
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.