IllnessMacular degeneration, early onset; differentialdiagnosis
Summary
Comprehensive differential diagnostic panel for early macular degeneration comprising 11 or altogether 29 curated genes according to the clinical signs
54,7 kb (Extended panel: incl. additional genes)
- EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
NGS +
Gene panel
Selected genes
Name | Exon Length (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Heredity |
---|---|---|---|---|
ABCA4 | 6822 | NM_000350.3 | AR | |
BEST1 | 1758 | NM_004183.4 | AD, AR | |
CDH3 | 2490 | NM_001793.6 | AR | |
CNGB3 | 2430 | NM_019098.5 | AR | |
ELOVL4 | 945 | NM_022726.4 | AD | |
IMPG1 | 2394 | NM_001563.4 | AD, AR | |
IMPG2 | 3726 | NM_016247.4 | AD | |
MFSD8 | 1557 | NM_152778.3 | AR | |
PROM1 | 2598 | NM_006017.3 | AD, AR | |
PRPH2 | 1041 | NM_000322.5 | AD, AR, digenisch | |
TIMP3 | 636 | NM_000362.5 | AD | |
CFAP410 | 1507 | NM_004928.3 | AR | |
CTNNA1 | 2721 | NM_001903.5 | AD | |
EFEMP1 | 1482 | NM_001039348.3 | AD | |
GPR143 | 1215 | NM_000273.3 | XL | |
GUCA1B | 603 | NM_002098.6 | AD | |
MERTK | 3000 | NM_006343.3 | AR | |
RAX2 | 555 | NM_032753.4 | AD | |
RBP4 | 606 | NM_006744.4 | AD, AR | |
RDH12 | 951 | NM_152443.3 | AD, AR | |
RP1L1 | 7203 | NM_178857.6 | AR | |
RPGR | 2448 | NM_000328.3 | XL | |
RPGRIP1 | 3861 | NM_020366.4 | AR | |
RS1 | 675 | NM_000330.4 | XL | |
SPTLC1 | 1422 | NM_006415.4 | AD |
Informations about the disease
Stargardt macular degeneration causes progressive vision loss as the retina and specifically the macula is attacked. Most often, lipofuscin is deposited in the macula, damaging the cells that are critical for clear central vision. In addition, macular degeneration affects night vision (and color vision). Stargardt disease typically begins in late childhood to early adulthood and worsens later. Depending on the mutated gene, Stargardt disease can be inherited in a formally autosomal recessive (ABCA4; most frequently mutated) or autosomal dominant (ELOVL, PROM1) manner. The autosomal recessive inherited bestrophinopathy has its typical onset in the first decade, but on the other hand can remain asymptomatic until the fifth decade. It is a more severe retinopathy than best vitelliform macular dystrophy, which also becomes manifest in childhood or adolescence and shows incomplete penetrance (>70%). Visual acuity can range from normal to less than 20/200, depending on the macular involvement of the disease. Affected individuals are hyperopic and have shallow anterior chambers, making them prone to angle closure glaucoma. Other forms of early-onset macular degeneration are less commonly seen in most populations. The DNA diagnostic yield of the Amedes panel reaches ~65%. Reliable population data are not yet available for most of the involved genes in the panel. Thus, a negative result does not represent exclusion of the diagnosis.
References: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1167/
- Alias: Macula degeneration, juvenile
- Allelic: Leber congenital amaurosis 6 (RPGRIP1)
- Allelic: Ceroid lipofuscinosis, neuronal, 7 (MFSD8)
- Allelic: Choroidal dystrophy, central areolar 2 (PRPH2)
- Allelic: Complement factor H deficiency (CFH)
- Allelic: Cone-rod dystrophy 12 (PROM1)
- Allelic: Cone-rod dystrophy 3 (ABCA4)
- Allelic: Cone-rod dystrophy, XL, 1 (RPGR)
- Allelic: Fundus flavimaculatus (ABCA4)
- Allelic: Hemolytic uremic syndrome, atypical, susceptibility to, 1 (CFH)
- Allelic: Ichthyosis, spastic quadriplegia, and mental retardation (ELOVL4)
- Allelic: Leber congenital amaurosis 18 (PRPH2)
- Allelic: Macular degeneration, age-related, 6 (RAX2)
- Allelic: Microcornea, rod-cone dystrophy, cataract, posterior staphyloma (BEST1)
- Allelic: Microphthalmia, isolated, with coloboma 10 (RBP4)
- Allelic: Retinal dystrophy, early-onset severe (ABCA4)
- Allelic: Retinitis pigmentosa 1 (ABCA4)
- Allelic: Retinitis pigmentosa 3 (RPGR)
- Allelic: Retinitis pigmentosa 41 (PROM1)
- Allelic: Retinitis pigmentosa 48 (GUCA1B)
- Allelic: Retinitis pigmentosa 56 (IMPG2)
- Allelic: Retinitis pigmentosa 7 + digenic form (PRPH2)
- Allelic: Retinitis pigmentosa 88 (RP1L1)
- Allelic: Retinitis pigmentosa, XL, sinorespiratory infections, with/-out deafness (RPGR)
- Allelic: Retinitis pigmentosa, concentric (BEST1)
- Allelic: Retinitis pigmentosa-50 (BEST1)
- Allelic: Retinitis punctata albescens (PRPH2)
- Allelic: Retinoschisis (RS1)
- Allelic: Spinocerebellar ataxia 34 (ELOVL4)
- Allelic: Vitreoretinochoroidopathy (BEST1)
- Achromatopsia 3 (CNGB3)
- Basal laminar drusen (CFH(`)
- Bestrophinopathy, AR (BEST1)
- Cone-rod dystrophy 11 (RAX2)
- Cone-rod dystrophy 13 (RPGRIP1)
- Doyne honeycomb degeneration of retina (EFEMP1)
- Ectodermal dysplasia, ectrodactyly + macular dystrophy (CDH3)
- Fundus albipunctatus (RDH5)
- Hypotrichosis, congenital, with juvenile macular dystrophy (CDH3)
- Leber congenital amaurosis 13 (RDH12)
- Macula dystrophy, hemorrhagic (Sorsby fundus dystrophy) included
- Macular degeneration, XL atrophic (RPGR)
- Macular degeneration, age-related, 2 (ABCA4)
- Macular degeneration, age-related, 4 (CFH)
- Macular dystrophy with central cone involvement (MFSD8)
- Macular dystrophy, patterned, 1 (PRPH2)
- Macular dystrophy, patterned, 2 (CTNNA1)
- Macular dystrophy, retinal, 2 (PROM1)
- Macular dystrophy, vitelliform, 2 (BEST1)
- Macular dystrophy, vitelliform, 3 (PRPH2)
- Macular dystrophy, vitelliform, 4 (IMPG1)
- Macular dystrophy, vitelliform, 5 (IMPG2)
- Neuropathy, hereditary sensory + autonomic, type IA (SPTLC1)
- Occult macular dystrophy (RP1L1)
- Retinal dystrophy with/-out extraocular anomalies (RCBTB1)
- Retinal dystrophy, iris coloboma, comedogenic acne syndrome (PBP4)
- Retinitis pigmentosa 38 (MERTK)
- Sorsby fundus dystrophy (TIMP3)
- Stargardt disease 1 (ABCA4)
- Stargardt disease 3 (ELOVL4)
- Stargardt disease 4 (PROM1)
- AD
- AR
- XL
- digenisch
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatics and clinical interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboratory requirement
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.