IllnessMyopathy, nemaline; differential diagnosis

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for Myopathy (nemaline) comprising 3 core candidate genes and altogether 14 curated genes according to the clinical signs

MP0349

Number of loci

Locus type	Count
Gen	16

Accredited laboratory test

Examined sequence length

26,9 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
87,9 kb (Extended panel: incl. additional genes)

Analysis Duration

on request

Test material

EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)

Diagnostic indications

NGS +

Loci

Gen

Name	Exon Length (bp)	OMIM-G	Referenz-Seq.	Heredity
ACTA1	1134	102610	NM_001100.4	AD, AR
NEB	25683	161650	NM_001271208.2	AR
CFL2	501	601443	NM_021914.8	AR
FLNC	8178	102565	NM_001458.5	AD
KBTBD13	1377	613727	NM_001101362.3	AD
KLHL40	1866	615340	NM_152393.4	AR
KLHL41	1821	607701	NM_006063.3	AR
LMOD3	1683	616112	NM_198271.5	AR
MYO18B	7704	607295	NM_032608.7	AR
MYPN	3963	608517	NM_032578.4	AR
NEFL	1633	162280	NM_006158.5	AD
RYR1	15117	180901	NM_000540.3	AD, AR
RYR3	14613	180903	NM_001036.6	AR
TNNT1	837	191041	NM_003283.6	AR
TPM2	855	190990	NM_003289.4	AD
TPM3	858	191030	NM_152263.4	AD, AR

Informations about the disease

Clinical Comment

https://register.awmf.org/de/leitlinien/detail/030-115

[DOI: doi.org/10.1016/j.nmd.2021.07.012]

Synonyms

Alias: Nemaline myopathy
Alias: Nemaline rod myopathy
Allelic: Arrhythmogenic right ventricular dysplasia, familial (FLNC)
Allelic: Arthrogryposis, distal, type 1A (TPM2)
Allelic: Arthrogryposis, distal, type 2B4 (TPM2)
Allelic: Cardiomyopathy, dilated, 1KK (MYPN)
Allelic: Cardiomyopathy, familial hypertrophic, 26 (FLNC)
Allelic: Cardiomyopathy, familial restrictive 5 (FLNC)
Allelic: Cardiomyopathy, familial restrictive, 4 (MYPN)
Allelic: Cardiomyopathy, hypertrophic, 22 (MYPN)
Allelic: Charcot-Marie-Tooth disease, DI G (NEFL)
Allelic: Charcot-Marie-Tooth disease, type 1F (NEFL)
Allelic: Charcot-Marie-Tooth disease, type 2E (NEFL)
Allelic: Malignant hyperthermia susceptibility 1 (RYR1)
Allelic: Myopathy, scapulohumeroperoneal (ACTA1)
CAP myopathy 1 (TPM3)
CAP myopathy 2 (TPM2)
Congenital myopathy 1A, AD, with susceptibility to malignant hyperthermia (RYR1)
Congenital myopathy 1B, AR (RYR1)
Congenital myopathy 20 (RYR3)
King-Denborough syndrome (RYR1)
Klippel-Feil syndrome 4, AR, with myopathy + facial dysmorphism (MYO18B)
Myopathy, actin, congenital, with cores (ACTA1)
Myopathy, actin, congenital, with excess of thin myofilaments (ACTA1)
Myopathy, congenital, with fiber-type disproportion (TPM3)
Myopathy, congenital, with fiber-type disproportion 1 (ACTA1)
Myopathy, distal, 4 (FLNC)
Myopathy, myofibrillar, 5 (FLNC)
Nemaline myopathy 1, AD or AR (TPM3)
Nemaline myopathy 10 (LMOD3)
Nemaline myopathy 11, AR (MYPN)
Nemaline myopathy 2, AR (NEB)
Nemaline myopathy 3, AD or AR (ACTA1)
Nemaline myopathy 4, AD (TPM2)
Nemaline myopathy 5, Amish type (TNNT1)
Nemaline myopathy 6, AD (KBTBD13)
Nemaline myopathy 7, AR (CFL2)
Nemaline myopathy 8, AR (KLHL40)
Nemaline myopathy 9 (KLHL41)
Nemaline myopathy [Lit.] (RYR1, RYR3)
Nemaline myopathy [panelapp] (NEFL)

Heredity, heredity patterns etc.

OMIM-Ps

Multiple OMIM-Ps

ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

DAkkS-akkreditiertes Labor
EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
Gen-Konversionen
komplexe Inversionen
Balancierte Translokationen
Mitochondriale Varianten
Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
niedriger Mosaik-Status
Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
Varianten innerhalb von Pseudogenen
die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.