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Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
Know how in the analysis of genetic material.
For the benefit of patients.

Summary

Short information

2 curated single gene sequence analyses according to the clinical suspicion Myotonia congenita

ID
MS7030
Number of genes
2 Accredited laboratory test
Examined sequence length
8,5 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
- (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Test material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

 

Gene panel

Selected genes

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
CLCN12967NM_000083.3AD, AR
SCN4A5511NM_000334.4AD

Informations about the disease

Clinical Comment

Non-dystrophic myotonias are rare muscle hyperexcitability disorders caused by gain-of-function mutations in the SCN4A gene or loss-of-function mutations in the CLCN1 gene. Myotonia congenita affects skeletal muscles beginning in childhood with bouts of sustained myotonia of any muscles, including of the face and tongue, but most often in the legs causing stiffness sometimes with warm-up effect. The two major types are designated Thomsen disease and Becker disease as distinguished by the severity of symptoms and patterns of inheritance. Becker disease usually appears later in childhood causing more severe stiffness. Becker disease patients often experience temporary attacks of muscle weakness, sometimes permanent over time. Mutations in the CLCN1 gene alter structure and/or function of chloride channels. Thomsen disease is transmitted in an autosomal dominant pattern, Becker disease is inherited in an autosomal recessive manner. The phenotypic manifestations of the pathogenic variants in the CLCN1 and SCN4A genes can be variable even within the same family; many autosomal dominant pathogenic variants can be associated with reduced penetrance. Both, the analytical sensitivity and specificity are close to 100%, the clinical sensitivity and specificity are dependent on variable factors such as age and/or family history.

Reference:

Reference: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1355/

 

Synonyms
  • Alias: Non-dystrophic skeletal muscle disorder
  • Alias: Thomsen + Becker disease
  • Hyperkalemic periodic paralysis, type 2 (SCN4A)
  • Hypokalemic periodic paralysis, type 2 (SCN4A)
  • Myasthenic syndrome, congenital, 16 (SCN4A)
  • Myotonia congenita, AD (CLCN1)
  • Myotonia congenita, AR (CLCN1)
  • Myotonia congenita, atypical, acetazolamide-responsive (SCN4A)
  • Myotonia levior, AR (CLCN1)
  • Paramyotonia congenita (SCN4A)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.