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Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
Know how in the analysis of genetic material.
For the benefit of patients.

IllnessNail dysplasia, congenital; differential diagnosis

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for Nail dysplasia, congenital stationary, containing 7 core candidate genes and altogether 13 curated genes according to the clinical signs

ID
NP5180
Number of genes
13 Accredited laboratory test
Examined sequence length
18,2 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
27,8 kb (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Test material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

 

Gene panel

Selected genes

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
COL7A18835NM_000094.4AD, AR
FZD62121NM_001164615.2AR
HOXC13993NM_017410.3AR
KRT741590NM_175053.4AD
KRT851524NM_002283.4AR
PLCD12334NM_001130964.2AD, AR
RSPO4705NM_001029871.4AR
EDAR1347NM_022336.4AD, AR
FOXN11947NM_003593.3AR
GRHL21878NM_024915.4AR
LMX1B1188NM_002316.4AD
MSX1912NM_002448.3AD, AR
RIPK42355NM_020639.3AR

Informations about the disease

Clinical Comment

Congenital and hereditary nail disorders are a heterogeneous group of rare diseases. They may occur as non-syndromic congenital nail disorders or in various genetic syndromes, e.g., nail-patella syndrome, pachyonychia congenita, ectodermal dysplasia, epidermolysis bullosa, T-cell immunodeficiencies. Congenital nail disorders should not be confused with the physiologic, transient nail changes seen in most newborns, which usually resolve in the first few months of life. Congenital isolated anonychia is rare and is caused by RSPO4 variants. Iatrogenic congenital anonychia +/- digital hypoplasia may be due to prenatal phenytoin exposure. Non-syndromic congenital nail disease 1 (FZD6) presents with thickened, hyperplastic, and hyperpigmented nails with a very slow growth rate that develop as claw-like structures. In hereditary leukonychia (porcelain nails, PLCD1), leukonychia punctata or striata presents. Isolated congenital nail clumping is rare and characterized by enlargement of the nail plate and distal segments of the fingers and toes (HPGD, SLCO2A1; each associated with primary hypertrophic osteoarthropathy). Many other nonsyndromic congenital nail disorders have been described with mostly unknown genetic alterations. Tennis racket nails/thumbs can be an isolated disorder or syndromic with numerous genetic disorders. Several multiple malformation syndromes are associated with nail hypoplasia, anonychia/micronychia. Autosomal inheritance patterns are generally observed. A negative molecular genetic test result does not exclude the clinical suspicion for an inherited nail disease.

Reference: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1280/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1304/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1132/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1112/

 

Synonyms
  • Anonychia congenita (RSPO4)
  • CHAND [Curly hair-ankyloblepharon-nail dysplasia] syndrome (RIPK4)
  • Ectodermal dysplasia 10A, hypohidrotic/hair/nail type, AD (EDAR)
  • Ectodermal dysplasia 10B, hypohidrotic/hair/tooth type, AR (EDAR)
  • Ectodermal dysplasia 3, Witkop type (MSX1)
  • Ectodermal dysplasia 4, hair/nail type (KRT85)
  • Ectodermal dysplasia 7, hair/nail type (KRT74)
  • Ectodermal dysplasia 9, hair/nail type (HOXC13)
  • Ectodermal dysplasia/short stature syndrome (GRHL2)
  • Nail disorder, nonsyndromic congenital, 1 (FZD6)
  • Nail disorder, nonsyndromic congenital, 3 [leukonychia] (PLCD1)
  • Nail-patella syndrome (LMX1B)
  • T-cell immunodeficiency, congenital alopecia, nail dystrophy (FOXN1)
  • T-cell lymphopenia, infantile, with/-out nail dystrophy, AD (FOXN1)
  • Toenail dystrophy, isolated (COL7A1)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.