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Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
Know how in the analysis of genetic material.
For the benefit of patients.

IllnessNeuropathy, hereditary motor-sensory, demyelinating, type I; differential diagnosis

Summary

Short information

A curated panel containing 7 guideline-curated genes and altogether 10 curated genes for the comprehensive analysis of the suspected Neuropathy, hereditary motor-sensory, demyelinating; type I

ID
NP0230
Number of genes
9 Accredited laboratory test
Examined sequence length
7,4 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
10,8 kb (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Test material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

 

Gene panel

Selected genes

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
EGR21431NM_000399.5AD
FBLN51347NM_006329.4AD
GJB1852NM_000166.6XL
LITAF486NM_004862.4AD
MPZ747NM_000530.8AD
NEFL1633NM_006158.5AD, AR
PMP2403NM_002677.5AD
PMP22483NM_000304.4AD
POLR3B3402NM_018082.6AD

Informations about the disease

Clinical Comment

Hereditary motor and sensory neuropathies (HMSN) or Charcot-Marie-Tooth (CMT) disorders and related neuropathies are a group of clinically and genetically heterogeneous conditions primarily affecting the peripheral nervous system with secondary muscle wasting and weakness. CMT is the most common inherited neuromuscular disorder, and patients with CMT and other HMSNs may present with many symptoms, with motor signs predominating over sensory symptoms in all age groups. Onset can occur in infancy, adolescence or throughout life with mild symptoms - even asymptomatic relatives can be detected in respective families. Motor nerve conduction velocities (NCV) distinguish two main types: CMT1 (demyelinating; NCV<35m/sec) and CMT2 (axonal; NCV>45m/sec). CMT1 accounts for 2/3 of all CMT cases. CMT neuropathy can be inherited either autosomal dominantly, recessively or X-linked (CMTX forms) and often occurs as a sporadic neuropathy. To date, over 60 different genetic loci have been associated with CMT1-4, CMTX and CMTdi (dominant intermediate type; NCV 35-45m/sec). Almost all of the relevant genes have been identified. These genes encode proteins involved in myelination, Schwann cell differentiation, axonal transport, endocytic recycling, mitochondrial function, protein translation, signal transduction, single-strand DNA break repair, and other processes. DNA diagnostic yields reported to date for all forms of CMT vary considerably from >20% to >60%, probably depending on the degree of clinical workup. Negative molecular genetic results by no means exclude clinical diagnosis.

Reference: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1358/

 

Synonyms
  • Alias: Charcot-Marie-Tooth type I; CMT1
  • Alias: Hereditary motor sensory neuropathy, type I; HMSNI
  • Alias: Polyneuropathie, erblich
  • Alias: Polyneuropathy
  • Allelic: Cutis laxa, AD 2 (FBLN5)
  • Allelic: Cutis laxa, AR, type IA (FBLN5)
  • Allelic: Diabetes, type 1, susceptibility to (ITPR3)
  • Allelic: Leukodystrophy, hypomyelinating, 8, +/- oligodontia +/- hypogonadotr. hypogonadism (POLR3B)
  • Allellc: Macular degeneration, age-related, 3 (FBLN5)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, demyelinating, type 1G (PMP2)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, demyelinating, type 1H (FBLN5)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, demyelinating, type 1I (POLR3B)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, demyelinating, type 1J (ITPR3)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, type 1A (PMP22)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, type 1B (MPZ)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, type 1C (LITAF)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, type 1D (EGR2)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, type 1E (PMP22)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, type 1F (NEFL)
  • Neuropathy, hereditary, +/- age-related macular degeneration (FBLN5)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
  • XL
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.