IllnessNeuropathy, hereditary sensory; differential diagnosis
Summary
A comprehensive panel containing 7 guideline-curated genes and altogether 8 curated genes for the differential diagnostic analysis of the suspected Neuropathy, hereditary sensory
17,8 kb (Extended panel: incl. additional genes)
- EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
NGS +
[Sanger]
Gene panel
Informations about the disease
Hereditary sensory neuropathy type (HSN) IA is a disorder with nerve abnormalities in the legs and feet. Many of the patients suffer from paraesthesias, numbness and a decreased ability to feel pain and sense heat and cold. Some affected individuals do not have sensory disturbances but do experience stabbing pain in the legs and feet. As the disease progresses, sensory disturbances may affect the shoulders, joints and abdomen. As sufferers age, they may also experience muscle atrophy and weakness. People with HSNIA typically develop ulcers on the feet/hands or infections/whitlows, some also show sensorineural hearing loss. HSNIA symptoms can begin at any time during adolescence. Although the features of this disease worsen over time, affected individuals have a normal life expectancy. HSNIA is caused by mutations in the SPTLC1 gene and is inherited in an autosomal dominant manner. Other dominant HSN1 disorders with similar symptoms are caused by pathogenic variants in the SPTLC2, ATL1 and DNMT1 genes. CMT2 disorders with related phenotypes include CMT2B, which is caused by pathogenic variants in RAB7. In CMT2I/J, a specific pathogenic MPZ variant is associated with a phenotype almost identical to HSAN1A. The molecular genetic yield in HSN is currently unknown. Therefore, a negative DNA test result does not refute the clinical neurological diagnosis.
Reference: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1390/
- Alias: Hereditary sensory + autonomic (SPTLC1)
- Alias: Neuropathy, hereditary sensory + autonomic
- Alias: Neuropathy, hereditary sensory, HSN1, HSN2
- Alias: Polyneuropathie
- Allelic: Cerebellar ataxia, deafness, narcolepsy, AD (DNMT1)
- Allelic: NESCAV syndrome (KIF1A)
- Allelic: Spastic paraplegia 30, AD + AR (KIF1A)
- Allelic: Spastic paraplegia 3A, AD (ATL1)
- Axonal, non-demyelinating CMT2B: severe sensory loss (RAB7)
- Axonal, non-demyelinating CMT2I/J: severe sensory loss (MPZ)
- Neuropathy, hereditary sensory + autonomic, type IC (RAB7A)
- Neuropathy, hereditary sensory [+ autonomic], type IA (SPTLC1)
- Neuropathy, hereditary sensory, type ID (ATL1)
- Neuropathy, hereditary sensory, type IE (DNMT1)
- Neuropathy, hereditary sensory, type IF (ATL3)
- Neuropathy, hereditary sensory, type IIC (KIF1A)
- AD
- AR
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatics and clinical interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboratory requirement
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.